Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Psa5g3365 ATGGATCTACTAATGACAGTAAGAGCCGCAAAAAGTACCTGGCTACTTGGAATAGTACCTTTTGTGGCTTCTTTTTTGGTTATGTCAATACTATTGAACCTTTTCTATTCGCCAACAAATTTCCCTCCATTAATCGCGTCACGTTTATCAATAAGTACTACAATGGCAGTCACTAATTTCCCTGTCTTGACTGAAGCTTTATCAGAACTTAACCTCATGGCAACCGAATTAGGTCAGCTTGCTATGTCTTCAGCCTCGTTCAACGATTGCATACAATTTTCTCTCATAATAACACACCATATCGTATTCACTGAGCAACTAAAATTCCAAGTGTTGGCTGTGGTTAGTTGCATATTGTTCACGGTTTTTTGCTTTTATGTTTTAAAGCCAATGATGAAAATGATTGCACGCAACACACCGTATGGGAAACAAGTGAAACAAATTTATGTTGTCCTTATTCTTCTCGGTGTTTTAATCATGTCAGGTATAACTGACATGATTGGGGTAACGTTCATGATTGGACCGTTGATGCTTGGTTTGATGATACCAAGTGGACCTCCTTTAGGAACAATTTTGGTTGAAAAATGTGAAATTATTATCTCGGATTTTCTGTTACCTTTCTTCTTTGCTTTTGTTGGCATGACCACAAATCTGGCTTCACTTCACAGCTGGAAAGAGTTCTTAATTTTGCAGTTTATCGTACTTGCTGGCGACGCAACAAAAGTGGTTGCTTGTGCATTGGTTTCTATGGTATATAACATTAAGCCCAAACACGGCACGGTGCTTGGTCTCATGATGAACATCAAGGGCATAACTCAACTTATAGCTCTTACTAAATTGAAGAATAACAAGCTAATGGATGAAGATACATACAGTCACTTGGTGATTTGTGTGGTGGTTACAACCGCAATCGTCACACCCTTGATTAAAAACCTATACAAACGTCTTCATCGGGTACTAAATTCATCGTGCCTATACGATGAAAAAATGAGAACAATCCAAAACTCTTCAAGAAATTTAGAGTTTCGCATTATTACTTGTGTACATAACGAGGGAAACGTACGTGGTATCACTGCTCTATTAGAAGTTTGCAACCCAGTTCCAGAAAGTCCGTTATCTGTATACGTGATTCACCTCGTCGAGCTTTTAGGAAAAAGTGCACCAATTTTGCTTCCAATTAATCACAAACAGAACAAAAAATTCTTGTCGGTTAATTACCCCGACACAAACCACATAATGCGAGCATTCGAGAATTATGCTAGCAACTCTTATGGTCCGGTTATTATTCTACCATATGTCAACGTTGCACCTTATAAAAGCATGCACGATGCTGTTATCAACTTAGCACAAGACAGAATGGCTCCTTTTATAATAATCCCTTTTCATGAAAATGACCATGTTGACCTCAACGGACACGTCTCGACCGCGATCCGGAAACTAAATACTAGGTTTCAAGCATGTGTGCCATGCACGTTGGGAATATTGGTGGATAGATACTCACGGCTTGGAGATAGTAACGACAATGTTAAATCTTATTTTCACGTGGGAGTGTTTTTCATTGGTGGAGCTGATGACAGAGAAGCATTGGCTTTAGGAATTCGAATGTCGGAGAGGGAAAACATGAAGGTGTCTTTGTTTCGGTTTGTTGTGTTGAATAGAAAAGAATATGAAAGCAAATCTCTATCAGGTGGAGAAGTTTCACTAGATGAGGAAGCACAAGAGGAAATGTTGGATGAAAGTTTAATTGATGAGTTTAAGGGTATGAAATTTGGGATAGGGAATGTTTGTTGCTACGAGGTTGTTGTGGATGATGGAGTAGAGGTGTTGAGTGCAATTCGTGGTTTGGAAGGAGACTATGATCTTGTGATGGTTGGGAGGAGACATAATATTGAATCTTTGAAAGATGAAGAAATGGGAAATTTCATAGAGAATGTTCAAATATTAGGGATATTTGGAGATATGTTATCATCAACAGAATTCTGTATTGGAATGGTTCCTGTTTTGGTGACACAATGTGGTGGGGATAAAAGGGTAAGTAACAAGCTTGATAGACTAGGTTCAGTTAATGTCTCTCAGAGGAGTTTAATGTCTAATAAATAA 2100 0.3848 MDLLMTVRAAKSTWLLGIVPFVASFLVMSILLNLFYSPTNFPPLIASRLSISTTMAVTNFPVLTEALSELNLMATELGQLAMSSASFNDCIQFSLIITHHIVFTEQLKFQVLAVVSCILFTVFCFYVLKPMMKMIARNTPYGKQVKQIYVVLILLGVLIMSGITDMIGVTFMIGPLMLGLMIPSGPPLGTILVEKCEIIISDFLLPFFFAFVGMTTNLASLHSWKEFLILQFIVLAGDATKVVACALVSMVYNIKPKHGTVLGLMMNIKGITQLIALTKLKNNKLMDEDTYSHLVICVVVTTAIVTPLIKNLYKRLHRVLNSSCLYDEKMRTIQNSSRNLEFRIITCVHNEGNVRGITALLEVCNPVPESPLSVYVIHLVELLGKSAPILLPINHKQNKKFLSVNYPDTNHIMRAFENYASNSYGPVIILPYVNVAPYKSMHDAVINLAQDRMAPFIIIPFHENDHVDLNGHVSTAIRKLNTRFQACVPCTLGILVDRYSRLGDSNDNVKSYFHVGVFFIGGADDREALALGIRMSERENMKVSLFRFVVLNRKEYESKSLSGGEVSLDEEAQEEMLDESLIDEFKGMKFGIGNVCCYEVVVDDGVEVLSAIRGLEGDYDLVMVGRRHNIESLKDEEMGNFIENVQILGIFGDMLSSTEFCIGMVPVLVTQCGGDKRVSNKLDRLGSVNVSQRSLMSNK* 700
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Psa5g3365 699 Gene3D - 1 321 IPR038770 -
Psa5g3365 699 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 8 308 IPR006153 GO:0006812|GO:0015299|GO:0016021|GO:0055085
Psa5g3365 699 PANTHER CATION/H + ANTIPORTER 1 685 - -
Psa5g3365 699 PANTHER CATION/H+ EXCHANGER 3 1 685 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Psa5g3365 Psa-Chr5 262508916 262511093 Tandem
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Psa5g3365 49 683 Antiporter Super Family AT2G13620 34.154 7.22e-114 360
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Psa5g3365 - - gmx:106794183 863.603