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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Psa3g2019 ATGTCACAATTGTCACAACCCAAACGCATGTTTTTCACTCTGTTCCTGAACACCTCGTTCCTCTTGTTGTTTTCTGTTTTTCTTCTTGTTCACTTCCAATCCTCAGAGCATGTTTTTCTCAAAAGCAAAACCAGCAACCTCAATAAAAACAAAAACTTTGTCTCTGGCGCCAACGATGATGAGAATTGCAATAGTTTCCATAGCATAACTGATTATAAAGCTAAATGCTTTTACCTTAAATCAAACGACCCATGTGTTTCCCAAGGCTATATTGATTATCTTTACCTTTTCTATTGCAAATTCGGTGGATTCCCTTTATTGGGTCACACTCTTTTGTTCCTTTGGTTATTGGTCATGTTCTATGTTCTAGCTAACACTGCTTCTGAATACTTTTGTCCTTCTCTTGAGAGCCTCTCCAAGCTTTTGAGGCTTTCACCAACAATTGCTGGTGTGACTCTTCTCTCTTTTGGTAGTGGTGCTAATGATGTTTTTTCCACACTTGTTTCTTTCAAGAGTAATGGAACACAGGATATTGGATTCAACGCTGTTCTTGGTGGTGCTTCTTTTATTTCATGTGTTGTGGTGGGAATTGTGAGCATTTCTGTTAGACATAAAGGGATTCATGTTCAGAAATCTGCTTTGATAAGAGATATTTGTTTTCTTCTGTTTGTTATTGTTTGCTTGTTCACTATCTTCATCCTTGGTGAAATTAACCTTGTTGTGGGAATTGGGTTTTGTTTGATGTATGTTGTGTATGTGGTTATTGTTTATGTCACAAGTAAAAAAAAAGAAGAAGATGGTGAAAGTGATTCAAGACATGGCAAAGGTGATAATGATTTAGGTGTTCCTCTACTTGGTTTTATGGAGAAGGGAATGATTAATGAAGCTCAAGAATGTGAGTTTAAAATTGAGAAGAATTGTTGCTATGAGAAATCTTCAATCTCTAGAATTTTACTTTATGTTTTGGATATGCCTCTTTACTTGCCTAGGAGATTAACAATTCCGGTTGTTTGTGAAGAGAAATGGTCTAAACTATATGCAGTTTCAACAGCTATGTTATCACCACTTTTGTTATCTTTTCTTTGGAAAAACAATTTCTCAAACTCATCAAGCCTACTAGTTTACGGAATCGGATTATCAGTCGGAGTCACATTAGGACTAACCGCGATTTTCACGACAGAGTCGTCGAATCCGCCGAAAAAGTACTTGTTACCATGGCTAGCAGCAGGGTTTGTGATGAGTGTGACATGGAGTTACATTTCAGCTCAAGAGTTGGTAGGATTGTTAGTTTCAATTGGTTATATATGTGGAGTTAGTCCTTCAATACTTGGATTAACAGTACTTGCTTGGGGAAATTCAGTTGGTGATTTAGTAACAAACTTAACAATGGCTTTAAATGGTGGATCAGATGGAACACAAACAGCAATTTCAGGTTGTTATGCTGGTCCTATATTTAACACAGTTGTTGGATTGGGATTGTCTCTTGTGTCATCAACCTGGCGTGAGTATCCTTCATCTGTTGTGATTCCTAGAGATCCTTACTTGTGGGAAACATTGGGATTTTTGGTGGTTGGATTGATTTGGGCACTTGTTGTTTTGGTTAGAAAAGATATGAAGCTTAATGCAATGTTGGGTGGAGGGCTTTTGGCTATTTACTTTAGTTCTGTTATTCTTAGGCTTATACAAACACTTGGGCCTCTTCAATTTAAGGATATGTTATAG 1722 0.3717 MSQLSQPKRMFFTLFLNTSFLLLFSVFLLVHFQSSEHVFLKSKTSNLNKNKNFVSGANDDENCNSFHSITDYKAKCFYLKSNDPCVSQGYIDYLYLFYCKFGGFPLLGHTLLFLWLLVMFYVLANTASEYFCPSLESLSKLLRLSPTIAGVTLLSFGSGANDVFSTLVSFKSNGTQDIGFNAVLGGASFISCVVVGIVSISVRHKGIHVQKSALIRDICFLLFVIVCLFTIFILGEINLVVGIGFCLMYVVYVVIVYVTSKKKEEDGESDSRHGKGDNDLGVPLLGFMEKGMINEAQECEFKIEKNCCYEKSSISRILLYVLDMPLYLPRRLTIPVVCEEKWSKLYAVSTAMLSPLLLSFLWKNNFSNSSSLLVYGIGLSVGVTLGLTAIFTTESSNPPKKYLLPWLAAGFVMSVTWSYISAQELVGLLVSIGYICGVSPSILGLTVLAWGNSVGDLVTNLTMALNGGSDGTQTAISGCYAGPIFNTVVGLGLSLVSSTWREYPSSVVIPRDPYLWETLGFLVVGLIWALVVLVRKDMKLNAMLGGGLLAIYFSSVILRLIQTLGPLQFKDML* 574
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Psa3g2019 573 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 113 257 IPR004837 GO:0016021|GO:0055085
Psa3g2019 573 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 407 559 IPR004837 GO:0016021|GO:0055085
Psa3g2019 573 PANTHER CATION CALCIUM EXCHANGER 7 568 - -
Psa3g2019 573 Gene3D - 367 560 IPR044880 -
Psa3g2019 573 Gene3D - 144 285 IPR044880 -
Psa3g2019 573 PANTHER NA+/CA2+ K+ INDEPENDENT EXCHANGER 7 568 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Psa3g2019 Psa-Chr3 179522323 179524833 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Psa3g2019 15 565 Antiporters AT5G17850 50.887 3.11e-166 483
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Psa3g2019 K13754 - gmx:100787016 745.732