Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Prci9g1450 ATGGCTTTCTTTGGTAGAGTTGGGAATATACTAAGACAGGCTGCAAATAAGCAGCTCAGCTCAGAATTGCGTACAGCTCCATCTATTTTCCAGGCTATACGGTTCATGTCATCTGCTGCAAGTTCAAGGGTGTTTGTAGGAGGACTGTCATATTCCACTGATGAGCAAAGTTTGAGGGAAGCATTTGCAAAATATGGTGAAATAGTTGATGCAAGGATAATTATGGACCGTGACTCTGGTAGATCTAGAGGGTTTGCCTTTGTCACTTTCACATCAGTTGAGGAGGCATCAAGTGCTATTCAGGCATTGGATGGTCAGGATCTTCATGGTCGCCGAGTTCGGGTAAATTACGCTAATGAGAGGCCTCGATTTGGTGGCGGTGGTTTTGGTGGTTCTTATGGCAATGCTTCGTATGGTGCTGGAGCTGGTGCTGGCTATGGAGGCAGTTATGGTAACCCTCCTTATGGTGGTTCTGGTGCATATGGTGGCAATGCTGCTGGAGGTTATGGTGGTAGTGGATATGGTGGAGGAAGCTATGGATCAGGTGGCAATTTCGGTGACAGTGCCGGCAATAACTATGCTCCTAACAATTTTGGAGCTGGAGCTGCAGGTGGCAGTTATGGAAACGATGGTAGCTTTGCAAGTGGAAGCCCTTATGCTGGTGGAAGTGGGGGATATGGTGGTAACAATGGAAGTGGACCTGCTGCTGATAGCTTTGGAACTGTAAGTGCTGGTGGTGGCTTTGGGGGAACCAATTATGCAAGTGATGGGAACTTTGGGAGTGGAAGCACTTATGCTGGTGGCAGCAGTGGAGGCTATGGTGGTAATAGTGGGAACTTTGCAAGTGAAAGCACTTATACCGGTGGGAGCAGTGGAGGATATGGTGGCAACAGTGGGAACTTTGGTGTTGCTGGTGGTGGTGGAGGTAGTGATAACCATGGAAGTGCTCCTAGTTTTGGTGCTCCAGTCAGTGGTGGTAGTGATAGCTTTGGCAGTGCTGCTGGATTTGGCAGCAGCGGTAGCTTTGGCAGTGGTGATAGCTTTGGTGGTGCATCTGGATTCGGCAGCAGCGGTAACTTTAGCAGTTCAGCTGATTGTGGTGGCAGTGGTGGTCCAGGTTCTGGAAGCGGCTTTGCTGGTGGATATGATGGAGACATCAGCAGCAGTGATCAATTGGATGGCAAAGAAAGCAGCAATATAGGTGAGGATGTTGGAAATTTTGGGAACACGATAGAGGAAAACTACCGGGATGACGATGATGATGGTAATTTTGCCAAAAGGGCTTGA 1287 0.4856 MAFFGRVGNILRQAANKQLSSELRTAPSIFQAIRFMSSAASSRVFVGGLSYSTDEQSLREAFAKYGEIVDARIIMDRDSGRSRGFAFVTFTSVEEASSAIQALDGQDLHGRRVRVNYANERPRFGGGGFGGSYGNASYGAGAGAGYGGSYGNPPYGGSGAYGGNAAGGYGGSGYGGGSYGSGGNFGDSAGNNYAPNNFGAGAAGGSYGNDGSFASGSPYAGGSGGYGGNNGSGPAADSFGTVSAGGGFGGTNYASDGNFGSGSTYAGGSSGGYGGNSGNFASESTYTGGSSGGYGGNSGNFGVAGGGGGSDNHGSAPSFGAPVSGGSDSFGSAAGFGSSGSFGSGDSFGGASGFGSSGNFSSSADCGGSGGPGSGSGFAGGYDGDISSSDQLDGKESSNIGEDVGNFGNTIEENYRDDDDDGNFAKRA 428
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Prci9g1450 428 PANTHER HETEROGENEOUS NUCLEAR RIBONUCLEOPROTEIN 87F-RELATED 21 198 - -
Prci9g1450 428 MobiDBLite consensus disorder prediction 359 428 - -
Prci9g1450 428 SMART rrm1_1 43 116 IPR000504 GO:0003723
Prci9g1450 428 Gene3D - 12 136 IPR012677 -
Prci9g1450 428 ProSiteProfiles Eukaryotic RNA Recognition Motif (RRM) profile. 42 120 IPR000504 GO:0003723
Prci9g1450 428 Pfam RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain) 44 114 IPR000504 GO:0003723
Prci9g1450 428 SUPERFAMILY RNA-binding domain, RBD 41 147 IPR035979 GO:0003676
Prci9g1450 428 CDD RRM2_NsCP33_like 43 118 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Prci9g1450 Prci-Chr9 27736825 27739868 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Prci9g1450 39 122 C2H2 Transcription Factor Family AT2G19380 34.524 1.17e-10 61.6
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Prci9g1450 K12741 - qsa:O6P43_002219 211.846