Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Prci4g0281 ATGTCTCGAGTTGAGGCACTGTGGGAGAGATTAGTCCGAGCTACACTGAGGAGGGAAAGGATTGGTGATGATGCATTTGGACGGCCCGTTGCTGGAATTGCTGGAAACGTACCATCTGCACTCGCCAAAAACAGAGATATTGATGAGATATTGAGAGTTGCAGATGAAATTCAAGACGAAGATCCTAATGTCTCCAGAATCTTATGTGAGCATGCTTATTCATTATCTCAAAATCTGGACCCTAACAGTGAAGGCCGAGGTGTTTTGCAATTTAAGACTGGTTTGATGTCTGTTATTAAGCAAAAGTTGGCTAAGAGAGAAGTTGGAACTATAGATAGAAGTCAGGACATTACAAAATTACAAGAGTTCTACAAGCGCTATAGGGAGAAGCATAATGTAGACAGGCTACAGGAGGAAGAGAAGAAATTGCGGGAATCTGGTGCCATCAGTGGAAACCTTAGCGAGTTGGAGCGGAAGACAGTGAAGCGAAAAAGAATTTTTGCTAGTTTAAGGGTTTTAGGCATGGTGATTGAGCAGTTGTCCCCAGAAATTCCTGAAGAGCTGAAATCTCTAATGGAATCAGATTCTGCAATGACAGAAGACTTAATTGCTTACAACATTATTCCCTTAGATGCTCCATCCTTAACAAACTCTATTATGTCTTTGCTTGAGGTTCAAGCAGCAGTTTCAGCTTTGAAGTACTTTAGGGGTTTGCCAGAGTTGCCTCGGAGTCATCCAATTCCTGCTGCTAGAGATGCTGATATGCTTGATTTCTTGCAGTGTATATTTGGATTTCAGAAAGATAATGTCTCTAATCAGCGAGAACACTTGGTTCACCTGCTTGCTAATGAGCAGTCTCGGCTTGGAATTCCAAATGAGACAGAGCCTAAATTGGATGAGGCTGCGGTGCAAAATGTATTTGAGAAGTCCCTTGAGAATTACATAAGCTGGTGTAACTATTTAGCTATTCAGCCTGTCTGGAGCAGTTTGGATGCTGTTAGCAGAGAGAAAAAATTGCTTTATGTTTCTTTATATTACCTGATATGGGGTGAAGCTGCCAATATCAGGTTTCTGCCAGAATGCTTGTGCTACATATTTCACCATATGGCTAGGGAAATGGATGAAATTGTGAGGCAGCAAATTGCACAGCCAGCTAATAGTTGCATTTCTCAGGATGTTGTCTCTTTTCTTGATCAAGTTATTTTGCCTCTATATGACGTTGTTGCTGCGGAAGCTGCAAACAATAATAATGGGAAGGCACCTCATTCTGCCTGGAGAAACTATGATGATTTTAACGAATATTTCTGGTCTCTTCACTGCTTCAAGCTTGGCTGGCCATGGCGCCAAAGCTCTTCTTTTTTTCAAAAGCCACCACTTGAATCAAAGAACTTGCTTAATTCTGGTAGAAGTCAGCGGCAGGGAAAGACATCTTTTGTGGAGCATCGAACTTTTCTCCATCTCTACCACAGTTTCCATCGGTTGTGGATATTCCTTTTCATGATGTTTCAGGGTCTGACTCTTGTCGCTTTTAACGATGGACATCTTAATGCCAAGACTCTGCGTGCAGTTCTTAGTCTTGGACCAACATTTGTTGTGATGAAGTTTCTTGAGAGTGTTCTGGACATTTTCATGATGTATGGAGCATATAAAACAACAAGGCGCTTAGCCATTTCCCGGATTTTTCTTCGATTTTCATGGTTTGGTGTTGCATCAGTCTTCATAACCTTCCTTTATGTGAAAGCTCTCCTTGAAGAGAGCAAAGGAAATGGAAATTCAATTGTTTTTAGATTATACGTGATTGTCATAAGTATCTATGCAGGTGTACAAATTTTCATTAGTTTTCTCATGCGAATACCTGCTTGTCATCGTCTAACTAATCAATGTGATCGGTGGCCTTTAATTCGATTTGTGAAGTGGATGCGCCAGGAACGATACTATGTTGGACGGGGAATGTATGAAAGGAGTACTGATTTCATAAAGTATATGCTATTTTGGCTTGTCATTTTGGGTGCAAAATTCTCGTTTGCTTACTTCTTACAGATCAAGCCACTAGTTAGGCCAACAAGAGTGATAGTGGACATGGGTGATCTTGAATACTCTTGGCACGATCTTTTTTCTAAAAATAACCATAATGCTTTGACAGTTCTTAGCTTATGGGCTCCAGTATTTGCTATGTATCTTTTAGATGTTTATGTGTTCTATGTGCTTGCTTCGGCTGTTTGGGGATTCTTGCTTGGGGCAAGAGATCGCTTGGGAGAGATTAGATCATTGGAAGCCCTACACAAACTTTTTGAGCAGTTTCCTGGAGCTTTTATGGACACTCTTCATGTTCCTCTGCCCAACAGGAGTTCCCGACGTGCATCTGGTGAGGGTGTGGAAAGTAACAAGGTTGATGCTGCACGCTTCTCTCCCTTTTGGAATGAAATAATACGAAATCTGAGGGAGGAGGATTATATAACTAACTTGGAAATGGAATGGCTTTTAATGCCTAAAAATTCTGGGGACGTTCCTTTAGTTCAGTGGCCTCTTTTTCTACTTGCTAGCAAGATATTTCTTGCTAAGGATATTGCTGTTGAGAGTAGAGATAATCAAGATGAGCTTTGGGATAGGATTTCAAGGGATGAGTATATGAAATATGCTGTTCAGGAGTGTTACTATACCATTGAACTCATATTGACAGAAATATTAGATGAAGTGGGAAGGATGTGGGTTGAAAGAGTGTATGCTGATATTCATGGAAGTATCACGAAGAAGACCATTCTTGTGGATTTTCACCTTAATAAGTTGCCTCTTTTGATATCAAGAGTATCTGCACTTATGGGTATTTTGAAAAAACCAAAGACACCTGAACTTGAAAGGGGTGCAGTTAAGGCTGTTCAGGATCTGTATGATGTTGTGACACATGATATCCTTTCTATTAATTTGAGGGACAATTATGGTACTTGGAATCTACTGTTAAGAGAAAGACAAGAGGGGCGATTGTTTGCACAGTTGAAATGGCCAAACAATGCTGATTTGAGTGCACAAGTGAAAAGATTGCATTCACTATTGACCATCCAACATTCTGGTTCAAACATTCCTAAGAATCTTGAGGCTAGACGAAGGCTGGAGTTTTTCACAAATTCTCTTTTCATGAAGATGCCTGCTGCAAAGCCAGTTAGAGGGATGCTATCTTTCAGTGTTTTCACACCATATTATTCTGAGATTGTGCTTTATAGTATGGCTGAGCTACTAAAGAAAAATGAAGATGGCATATCGATTCTATTTTATCTCCAGAAGATTTTTCCAGATGAGTGGAAGAACTTTCTTGCTCGAATTGGACGTGATGAAGATGCACTTGATTCAGAACTTTTTGATAATCCTAGAGATATCCTTGAACTACGTTTTTGGGCATCTTATCGGGGACAAACGTTGGCTAGAACTGTTCGAGGGATGATGTACTATAGGAAAGCCCTTATGTTACAGACATATTTGGAGCGGACAACCTCTGGAGATTTGGAGTCTGGAGTTGGCAGCAATGAAGTGACTGATACACGTGGCTTTGATTTATCACCTGAAGCACGTGCTCAGGCAGATCTTAAGTTCACTTATGTTGTCGCATGTCAAATTTATGGAAGACAGAAAGAGGAACAAAAACCTGAGGCTGCTGATATTGCCTTACTTATGCAAAGGAATGAAGCTCTTCGTGTCGCATTCATTGATGTTGTAGATACTTTAAATGGTGGGAAAGAATACTACTCAAAGCTTGTGAAGGCTGATATCAATGGGAAGGACAAGGAAATATATTCGATTAAACTACCTGGAAATCCCAAGCTTGGGGAAGGGAAACCTGAGAATCAAAACCATGCAATTATATTTACTCGTGGAAATGCAGTCCAGACAATTGACATGAATCAGGACAACTATTTTGAGGAAGCTTTGAAGATGAGGAATCTCCTCGAAGAATTCCATTGTGATCATGGCCTTCGTCCTGCTACAATTCTTGGTGTTAGAGAGCATGTATTTACTGGAAGTGTCTCATCTTTGGCCTCATTTATGTCCAACCAAGAGACAAGTTTTGTTACTTTGGGCCAGCGCGTCTTAGCAAATCCTTTGAAGGTCCGGATGCATTATGGTCATCCAGATGTTTTTGATAGAGTATTCCACATCACCCGTGGTGGCATCAGCAAGGCATCTCGTATCATAAACATTAGTGAAGATATCTACTCAGGATTCAACTCAACCTTACGTCAAGGGAATGTTACGCATCATGAATATATTCAGGTTGGCAAGGGAAGGGATGTAGGGCTCAATCAGATTGCTTTATTTGAAGGGAAGGTTGCTGGTGGTAATGGTGAACAAGTTCTCAGTCGCGATGTATATAGACTCGGGCAGCTTTTTGATTTCTTCCGGATGATGTCATTTTTCTATACAACTGTTGGCTTCTATTTTTGTACCATGTTAACAGTGCTGACTGTGTACTTCTTTCTTTATGGGAGAGCATATCTGGCATTATCTGGCCTTGATGAAGAAATGGAGGAGAGGGCCAGGATAACTAAGAACACTGCCCTGAGTGCTGCTTTGAATACACAGTTCCTCTTCCAAATTGGGGTCTTCACTGCTGTACCAATGATCTTGGGCTTCATCCTGGAACAGGGTTTCCTGAGGGCCATTGTTGGTTTTGTCACAATGCAGTTTCAGCTCTGCTCTGTCTTTTTTACATTTTCCATGGGTACAAAGACTCATTATTTTGGGCGGACCATTCTTCATGGTGGTGCAAGGTATCAAGCAACTGGACGTGGATTTGTCGTCCGCCATATCAAATTTTCAGAGAATTACAGGCTTTACTCTCGCAGTCATTTTGTTAAAGGGTTGGAAGTTGTGCTTTTGTTGATAGTATACCTTGCATATGGATATAATGAAGGCAGTGCTGTAGCGTACATTCTTCTGACTGTTAGCAGCTGGTTTATGGCCCTATCCTGGTTGTTTGCTCCTTATTTATTTAATCCATCTGGATTTGAGTGGCAAAAGGTAGTTGAGGACTTTCGGGATTGGACAAACTGGCTTCTGTACAGGGGTGGAATTGGAGTTAAGGGAGAAGAAAGCTGGGAAGCTTGGTGGGATGAAGAACTGGCACATATCAGAACTATTAGTTCAAGAATAGTGGAGACGATCCTTAGTCTAAGATTTTTCATCTTCCAATATGGTATCGTGTACAAGCTTCATGTACAAGGGACAAATACTTCATTGACGGTTTATGGCCTGTCATGGGCAGTGCTGGCTGTTCTTATACTTCTTTTCAAGGTGTTCTCCTTTAGCCAGAAGATATCTGTTAACTTCCAGCTTTTGTTGCGTTTTATCCAAGGCCTTTCCTTGTTGTTGGCGCTGGCTGGAATAGTTGTGGCAGTCATATTTTCTGATCTTTCTGTATCAGATATATTTGCTGCTATCTTAGCATTTTTTCCTACTGGATGGGGAATTCTTTCGATTGCTGTTGCCTGGAAGCCAGTGGTGAAGAGTCTGGGGTTATGGAAATCCATACGATCAATTGCACGTCTGTATGATGCTGGCATGGGAATGCTCATCTTTATACCCATTGCATTCTTCTCATGGTTCCCATTTGTATCTACATTCCAAACCCGTCTAATGTTTAACCAAGCTTTCAGCCGAGGCCTTGAAATTTCTCTTATCCTTGCTGGAAACAATCCCAATACTGGGATCTAG 5703 0.411 MSRVEALWERLVRATLRRERIGDDAFGRPVAGIAGNVPSALAKNRDIDEILRVADEIQDEDPNVSRILCEHAYSLSQNLDPNSEGRGVLQFKTGLMSVIKQKLAKREVGTIDRSQDITKLQEFYKRYREKHNVDRLQEEEKKLRESGAISGNLSELERKTVKRKRIFASLRVLGMVIEQLSPEIPEELKSLMESDSAMTEDLIAYNIIPLDAPSLTNSIMSLLEVQAAVSALKYFRGLPELPRSHPIPAARDADMLDFLQCIFGFQKDNVSNQREHLVHLLANEQSRLGIPNETEPKLDEAAVQNVFEKSLENYISWCNYLAIQPVWSSLDAVSREKKLLYVSLYYLIWGEAANIRFLPECLCYIFHHMAREMDEIVRQQIAQPANSCISQDVVSFLDQVILPLYDVVAAEAANNNNGKAPHSAWRNYDDFNEYFWSLHCFKLGWPWRQSSSFFQKPPLESKNLLNSGRSQRQGKTSFVEHRTFLHLYHSFHRLWIFLFMMFQGLTLVAFNDGHLNAKTLRAVLSLGPTFVVMKFLESVLDIFMMYGAYKTTRRLAISRIFLRFSWFGVASVFITFLYVKALLEESKGNGNSIVFRLYVIVISIYAGVQIFISFLMRIPACHRLTNQCDRWPLIRFVKWMRQERYYVGRGMYERSTDFIKYMLFWLVILGAKFSFAYFLQIKPLVRPTRVIVDMGDLEYSWHDLFSKNNHNALTVLSLWAPVFAMYLLDVYVFYVLASAVWGFLLGARDRLGEIRSLEALHKLFEQFPGAFMDTLHVPLPNRSSRRASGEGVESNKVDAARFSPFWNEIIRNLREEDYITNLEMEWLLMPKNSGDVPLVQWPLFLLASKIFLAKDIAVESRDNQDELWDRISRDEYMKYAVQECYYTIELILTEILDEVGRMWVERVYADIHGSITKKTILVDFHLNKLPLLISRVSALMGILKKPKTPELERGAVKAVQDLYDVVTHDILSINLRDNYGTWNLLLRERQEGRLFAQLKWPNNADLSAQVKRLHSLLTIQHSGSNIPKNLEARRRLEFFTNSLFMKMPAAKPVRGMLSFSVFTPYYSEIVLYSMAELLKKNEDGISILFYLQKIFPDEWKNFLARIGRDEDALDSELFDNPRDILELRFWASYRGQTLARTVRGMMYYRKALMLQTYLERTTSGDLESGVGSNEVTDTRGFDLSPEARAQADLKFTYVVACQIYGRQKEEQKPEAADIALLMQRNEALRVAFIDVVDTLNGGKEYYSKLVKADINGKDKEIYSIKLPGNPKLGEGKPENQNHAIIFTRGNAVQTIDMNQDNYFEEALKMRNLLEEFHCDHGLRPATILGVREHVFTGSVSSLASFMSNQETSFVTLGQRVLANPLKVRMHYGHPDVFDRVFHITRGGISKASRIINISEDIYSGFNSTLRQGNVTHHEYIQVGKGRDVGLNQIALFEGKVAGGNGEQVLSRDVYRLGQLFDFFRMMSFFYTTVGFYFCTMLTVLTVYFFLYGRAYLALSGLDEEMEERARITKNTALSAALNTQFLFQIGVFTAVPMILGFILEQGFLRAIVGFVTMQFQLCSVFFTFSMGTKTHYFGRTILHGGARYQATGRGFVVRHIKFSENYRLYSRSHFVKGLEVVLLLIVYLAYGYNEGSAVAYILLTVSSWFMALSWLFAPYLFNPSGFEWQKVVEDFRDWTNWLLYRGGIGVKGEESWEAWWDEELAHIRTISSRIVETILSLRFFIFQYGIVYKLHVQGTNTSLTVYGLSWAVLAVLILLFKVFSFSQKISVNFQLLLRFIQGLSLLLALAGIVVAVIFSDLSVSDIFAAILAFFPTGWGILSIAVAWKPVVKSLGLWKSIRSIARLYDAGMGMLIFIPIAFFSWFPFVSTFQTRLMFNQAFSRGLEISLILAGNNPNTGI 1900
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Prci4g0281 1900 PANTHER LYST-INTERACTING PROTEIN LIP5 DOPAMINE RESPONSIVE PROTEIN DRG-1 152 1893 - -
Prci4g0281 1900 Pfam 1,3-beta-glucan synthase subunit FKS1, domain-1 338 445 IPR026899 -
Prci4g0281 1900 SMART FKS1_dom1_2 336 448 IPR026899 -
Prci4g0281 1900 Pfam 1,3-beta-glucan synthase component 1026 1714 IPR003440 GO:0000148|GO:0003843|GO:0006075|GO:0016020
Prci4g0281 1900 Gene3D - 33 189 IPR023175 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Prci4g0281 Prci-Chr4 1940099 1998265 Transposed
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Prci4g0281 1 1900 Cell Wall Biosynthesis AT3G07160 75.864 0.0 3003
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Prci4g0281 K11000 - gmx:100811473 3273.03