Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pral4333g00023 ATGTTAATGCAGAGTTCTCTTCCTAGTTCAATTGAAGCTGCTCTATTTCATGTATCGGATAAAGGGAAAGAAGATGCTCTATGTGACTGGATACCTAGTGCTGAAACTTGGCAGGTGTGCCTGAAATGCAAAAGATGCCCTCTTACCTGCTGCAGAAAAGTTGAAACAATGCAAGAGCAAGAGGATAGAAGGAATGATGATGTTCCGTGCTGCAGAAATGTTGAAGCGATGCAAGAGCAAGAGGATAGAAATGATGATGATGTTCCGTGCCGCAGAAATGTTGAAGCAATGCAAGAGCAAGAGGATAGAAATAATGATGATGTTCTGTGCTGCAGAGAAGTTGAAGCTGTGCAAGAGCAAGAGGATAGAAGCAATGATGATGTTCCATGCCGCAGAAAAATTGATGCTATGCAAGAGCAAGAGGATAGAAGGAATGATGATGCTCCATGCTGCAGAAAATTTGATGCTATGCAAGAGCAGGAGGATAGAAGGAATGATGATGCTCCTTGCCGCAGAAATGTTGAAGCAATGCAAGAGCAAGAGGATAGAAGTAATGATGATGGTCTGTGCTGCAGAGAAGTTGAAGCCGTTGAAGCTATGCAAGAGCAAGAGGATAGAAGGAATGATGATGTTCTGTGCTGCAGAGAAGTTGAAGCCGTGCAAGAGCAAGAGGATAGAAGGAATGATGATATTCCATGCCGCAGAAAAATTGATGCTATGCAAGAGCAAGAGGGTAGAAGGAATGATGATGTTCCATGCTGCAGAAATGTTGAAGCAATGCAAGAACAAGAGGATAGAAGTAATGATGATGTTCCATGCTGCAGAGAAGTTGAAGCCGTGCAAGAGCAAGAGGATAGACGGAATGATGATGTTCCATGCTGCAGAAAAATTGACGCTATGCAAGAGCAAGATGATAGAAGGAATGATGATGTTCCTTGCTGCAGAAATGTTGAAGCAATGCGAGAGCAAGAGGATAGAAGGAATGATGATGTTCCGTGCTGCAGAGAAGTTGAAGCCATGCAAGAGCAAGAGGATAGAAGGAATGATGATGTTCCATGCTGCAGAAAAATTGATGCTATGCAAGAGCAAGAGGATAGAAGGAATGATGATGTTCCATGCTGCAGAAAAATTGATGTTATCCAAGAGCAAGAGGATAGAAGTAATGATGATGTTCTATGCTGCAGAAATGTTGAATCAATGCAAGAGCAAGAGGATAGAAGGAATGATGATGTTCCATGCAGCTCAAACTGTTTGAGCAGCTTAGATCGACTGCCAACTGCCAGTACAATGACTGGACATGCTGTGCCTAATCTAGTTTACAGGAGAAAGAAGCTACGGAAGAATTCAACTGTGCCCGTTTTAAAAATAGGGCCTATGTCTGTGCCAGCAAGTGCCAGTTGCCCTTTATTCATAAGCCCCTGTGCTCATAGATTAACATTGGAGCATCAGCCAGCCAGCTCTCAAATTGAACGAGTTACTGAAATGGTTAATGATCCTGATGCACCCATTGTCTTATGTGAAACAGCAGTAGATAGCAGCATACCTAAAAATTTAGGTATTAACAGCATTTATGATAGTTGCTCCTCATCAAAATCAAATATGGAAATTGTTTCAGATTCCATAGAAACTGGAGTGGATGACACTGGCGAATGCTCCTCATCTAGTGTATTAGTCATGGATGCCCCTGTAGAAGACCTATCAGCAAAGGATTTCTGCGTCAAAATTTTAAGAAGCCATGGACTCCTTGGAGAAGATTCTCATGCTCCTACTGTAGCTTCTCAAGTGCAGGTGGCTACCTCTGGTAATAGTTGCAGTTCCCGGTCATGCAAAATATGTGGCCATTTAGATGGCTCATTGAGCATGCTTATATGTGATCATTGTGAAGAGGCACACCATCCATCCTGCATGGTTCCGCGTGTGAAAAAGTTACCAATTGATGAATGGTTTTGTCATTCATGTATAAAAAGGAAGCAGAAAATTCTTAAGGAGTCAATTATTAGACGTTCACCAACTAGTGAAATGGAATTATGCAGATCTTCCTCAGTCAATGGAGGATTGAATCCTATACTGTTGATGTTGAATGATTCTGAGCCAAGTAAAAGTGGTGTACGGGTTGGTAAAGGTTTTCAAGCAGAAGTTCCTGAATGGTCAGGTCCAATAGGAAGTGATGATGACTGTGCTGAACCGTTGGAAATTGGTTCTTCAGCAATTTCCAGTTTGCTGGAAAAGAATCTCAAAAGGTCAACAAGACCCAGCTCCATTGGTAATTGGCTTCAGTGTCAAGAGGTTGTAGATAGAGCCAAAGGAACTATATGTGGTAAATGGCGCAGGGCTCCTCTTTTTGAAGTCCAAACTGATAATTGGGAGTGTTTCTGTGCCATCCAGTGGGATCCGGCTCATGCTGATTGTGCTGTACCTCAGGAGGTGGAAACAGATCAGGTTCTGAAGCAACTGAAGTATATAGAAATGTTGAGGCCGCGACTTGCCGCAAAACGTTCAAAATTAGACAACAAAAGGGGTGGTGAATGA 2529 0.4251 MLMQSSLPSSIEAALFHVSDKGKEDALCDWIPSAETWQVCLKCKRCPLTCCRKVETMQEQEDRRNDDVPCCRNVEAMQEQEDRNDDDVPCRRNVEAMQEQEDRNNDDVLCCREVEAVQEQEDRSNDDVPCRRKIDAMQEQEDRRNDDAPCCRKFDAMQEQEDRRNDDAPCRRNVEAMQEQEDRSNDDGLCCREVEAVEAMQEQEDRRNDDVLCCREVEAVQEQEDRRNDDIPCRRKIDAMQEQEGRRNDDVPCCRNVEAMQEQEDRSNDDVPCCREVEAVQEQEDRRNDDVPCCRKIDAMQEQDDRRNDDVPCCRNVEAMREQEDRRNDDVPCCREVEAMQEQEDRRNDDVPCCRKIDAMQEQEDRRNDDVPCCRKIDVIQEQEDRSNDDVLCCRNVESMQEQEDRRNDDVPCSSNCLSSLDRLPTASTMTGHAVPNLVYRRKKLRKNSTVPVLKIGPMSVPASASCPLFISPCAHRLTLEHQPASSQIERVTEMVNDPDAPIVLCETAVDSSIPKNLGINSIYDSCSSSKSNMEIVSDSIETGVDDTGECSSSSVLVMDAPVEDLSAKDFCVKILRSHGLLGEDSHAPTVASQVQVATSGNSCSSRSCKICGHLDGSLSMLICDHCEEAHHPSCMVPRVKKLPIDEWFCHSCIKRKQKILKESIIRRSPTSEMELCRSSSVNGGLNPILLMLNDSEPSKSGVRVGKGFQAEVPEWSGPIGSDDDCAEPLEIGSSAISSLLEKNLKRSTRPSSIGNWLQCQEVVDRAKGTICGKWRRAPLFEVQTDNWECFCAIQWDPAHADCAVPQEVETDQVLKQLKYIEMLRPRLAAKRSKLDNKRGGE 842
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pral4333g00023 842 ProSitePatterns Zinc finger PHD-type signature. 609 653 IPR019786 -
Pral4333g00023 842 SUPERFAMILY FYVE/PHD zinc finger 592 658 IPR011011 -
Pral4333g00023 842 ProSiteProfiles Zinc finger PHD-type profile. 606 656 IPR019787 -
Pral4333g00023 842 PANTHER BROMODOMAIN ADJACENT TO ZINC FINGER DOMAIN PROTEIN 1A 602 673 IPR047171 GO:0006338
Pral4333g00023 842 Gene3D Zinc/RING finger domain, C3HC4 (zinc finger) 526 666 IPR013083 -
Pral4333g00023 842 Pfam PHD-finger 609 655 IPR019787 -
Pral4333g00023 842 ProSiteProfiles Zinc finger CW-type profile. 751 811 IPR011124 GO:0008270
Pral4333g00023 842 SMART PHD_3 608 654 IPR001965 -
Pral4333g00023 842 Pfam ELM2 domain 703 814 IPR000949 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pral4333g00023 Pral-Chr4333 414552 427066 Dispersed/Tandem
       

Transcription factors information

Select Regulatory Factors Family Gene Hmm_acc Hmm_name E_value Clan
TR PHD Pral4333g00023 ELM2 0.0001 No_clan
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Pral4333g00023 - - gmx:100800660 530.406