Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pral4333g00019 ATGTTAATGCAGAGTTCTCTTCCTAGTTCAATTGAAGCTGCTCTATTTCATGTATCGGATAAAGGGAAAGAAGATGCTCTATGTGACTGGATACCTAGTGCTGAAACTTGGCAGGTGTGCCTGAAATGCAAAAGATGCCCTCTTACCTGCTGCAGAAAAGTTGAAACAATGCAAGAGCAAGAGGATAGAAGGAATGATGATGTTCCGTGCTGCAGAAATGTTGAAGCGATGCAAGAGCAAGAGGATAGAAATGATGATGATGTTCCGTGCCGCAGAAATGTTGAAGCAATGCAAGAGCAAGAGGATAGAAATAATGATGATGTTCTGTGCTGCAGAGAAGTTGAAGCTGTGCAAGAGCAAGAGGATAGAAGGAATGATGATGCTCCTTGCCGCAGAAATGTTGAAGCAATGCAAGAGCAAGAGGATAGAAGTAATGATGATGGTCTGTGCTGCAGAGAAGTTGAAGCCGTTGAAGCTATGCAAGAGCAAGAGGATAGAAGGAATGATGATGTTCTGTGCTGCAGAGAAGTTGAAGCCGTGCAAGAGCAAGAGGATAGAAGGAATGATGATATTCCATGCCGCAGAAAAATTGATGCTATGCAAGAGCAAGAGGGTAGAAGGAATGATGATGTTCCATGCTGCAGAAATGTTGAAGCAATGCAAGAACAAGAGGATAGAAGTAATGATGATGTTCCATGCTGCAGAGAAGTTGAAGCCGTGCAAGAGCAAGAGGATAGACGGAATGATGATGTTCCATGCTGCAGAAAAATTGACGCTATGCAAGAGCAAGATGATAGAAGGAATGATGATGTTCCTTGCTGCAGAAATGTTGAAGCAATGCGAGAGCAAGAGGATAGAAGGAATGATGATGTTCCGTGCTGCAGAGAAGTTGAAGCCATGCAAGAGCAAGAGGATAGAAGGAATGATGATGTTCCATGCTGCAGAAAAATTGATGCTATGCAAGAGCAAGAGGATAGAAGGAATGATGATGTTCCATGCTGCAGAAAAATTGATGTTATCCAAGAGCAAGAGGATAGAAGTAATGATGATGTTCTATGCTGCAGAAATGTTGAATCAATGCAAGAGCAAGAGGATAGAAGGAATGATGATGTTCCATGCAGCTCAAACTGTTTGAGCAGCTTAGATCGACTGCCAACTGCCAGTACAATGACTGGACATGCTGTGCCTAATCTAGTTTACAGGAGAAAGAAGCTACGGAAGAATTCAACTGTGCCCGTTTTAAAAATAGGGCCTATGTCTGTGCCAGCAAGTGCCAGTTGCCCTTTATTCATAAGCCCCTGTGCTCATAGATTAACATTGGAGCATCAGCCAGCCAGCTCTCAAATTGAACGAGTTACTGAAATGGTTAATGATCCTGATGCACCCATTGTCTTATGTGAAACAGCAGTAGATAGCAGCATACCTAAAAATTTAGGTATTAACAGCATTTATGATAGTTGCTCCTCATCAAAATCAAATATGGAAATTGTTTCAGATTCCATAGAAACTGGAGTGGATGACACTGGCGAATGCTCCTCATCTAGTGTATTAGTCATGGATGCCCCTGTAGAAGACCTATCAGCAAAGGATTTCTGCGTCAAAATTTTAAGAAGCCATGGACTCCTTGGAGAAGATTCTCATGCTCCTACTGTAGCTTCTCAAGTGCAGGTGGCTACCTCTGGTAATAGTTGCAGTTCCCGGTCATGCAAAATATGTGGCCATTTAGATGGCTCATTGAGCATGCTTATATGTGATCATTGTGAAGAGGCACACCATCCATCCTGCATGGTTCCGCGTGTGAAAAAGTTACCAATTGATGAATGGTTTTGTCATTCATGTATAAAAAGGAAGCAGAAAATTCTTAAGGAGTCAATTATTAGACGTTCACCAACTAGTGAAATGGAATTATGCAGATCTTCCTCAGTCAATGGAGGATTGAATCCTATACTGTTGATGTTGAATGATTCTGAGCCAAGTAAAAGTGGTGTACGGGTTGGTAAAGGTTTTCAAGCAGAAGTTCCTGAATGGTCAGGTCCAATAGGAAGTGATGATGACTGTGCTGAACCGTTGGAAATTGGTTCTTCAGCAATTTCCAGTTTGCTGGAAAAGAATCTCAAAAGGTCAACAAGACCCAGCTCCATTGGTAATTGGCTTCAGTGTCAAGAGGTTGTAGATAGAGCCAAAGGAACTATATGTGGTAAATGGCGCAGGGCTCCTCTTTTTGAAGTCCAAACTGATAATTGGGAGTGTTTCTGTGCCATCCAGTGGGATCCGGCTCATGCTGATTGTGCTGTACCTCAGGAGGTGGAAACAGATCAGGTTCTGAAGCAACTGAAGTATATAGAAATGTTGAGGCCGCGACTTGCCGCAAAACGTTCAAAATTAGACAACAAAAGGGGTGGTGAATGA 2409 0.4251 MLMQSSLPSSIEAALFHVSDKGKEDALCDWIPSAETWQVCLKCKRCPLTCCRKVETMQEQEDRRNDDVPCCRNVEAMQEQEDRNDDDVPCRRNVEAMQEQEDRNNDDVLCCREVEAVQEQEDRRNDDAPCRRNVEAMQEQEDRSNDDGLCCREVEAVEAMQEQEDRRNDDVLCCREVEAVQEQEDRRNDDIPCRRKIDAMQEQEGRRNDDVPCCRNVEAMQEQEDRSNDDVPCCREVEAVQEQEDRRNDDVPCCRKIDAMQEQDDRRNDDVPCCRNVEAMREQEDRRNDDVPCCREVEAMQEQEDRRNDDVPCCRKIDAMQEQEDRRNDDVPCCRKIDVIQEQEDRSNDDVLCCRNVESMQEQEDRRNDDVPCSSNCLSSLDRLPTASTMTGHAVPNLVYRRKKLRKNSTVPVLKIGPMSVPASASCPLFISPCAHRLTLEHQPASSQIERVTEMVNDPDAPIVLCETAVDSSIPKNLGINSIYDSCSSSKSNMEIVSDSIETGVDDTGECSSSSVLVMDAPVEDLSAKDFCVKILRSHGLLGEDSHAPTVASQVQVATSGNSCSSRSCKICGHLDGSLSMLICDHCEEAHHPSCMVPRVKKLPIDEWFCHSCIKRKQKILKESIIRRSPTSEMELCRSSSVNGGLNPILLMLNDSEPSKSGVRVGKGFQAEVPEWSGPIGSDDDCAEPLEIGSSAISSLLEKNLKRSTRPSSIGNWLQCQEVVDRAKGTICGKWRRAPLFEVQTDNWECFCAIQWDPAHADCAVPQEVETDQVLKQLKYIEMLRPRLAAKRSKLDNKRGGE 802
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pral4333g00019 802 ProSiteProfiles Zinc finger CW-type profile. 711 771 IPR011124 GO:0008270
Pral4333g00019 802 SUPERFAMILY FYVE/PHD zinc finger 552 618 IPR011011 -
Pral4333g00019 802 ProSitePatterns Zinc finger PHD-type signature. 569 613 IPR019786 -
Pral4333g00019 802 SMART PHD_3 568 614 IPR001965 -
Pral4333g00019 802 Gene3D Zinc/RING finger domain, C3HC4 (zinc finger) 485 626 IPR013083 -
Pral4333g00019 802 Pfam ELM2 domain 663 774 IPR000949 -
Pral4333g00019 802 ProSiteProfiles Zinc finger PHD-type profile. 566 616 IPR019787 -
Pral4333g00019 802 PANTHER BROMODOMAIN ADJACENT TO ZINC FINGER DOMAIN PROTEIN 1A 562 633 IPR047171 GO:0006338
Pral4333g00019 802 Pfam PHD-finger 569 615 IPR019787 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pral4333g00019 Pral-Chr4333 414552 427066 Tandem
       

Transcription factors information

Select Regulatory Factors Family Gene Hmm_acc Hmm_name E_value Clan
TR PHD Pral4333g00019 ELM2 9.5e-05 No_clan
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Pral4333g00019 - - gmx:100800660 530.406