Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Pral4212g00021 ATGGCTTTCTTTGGTAGAGTTGGGAATATACTAAGACAAGCTGCAAATAAGCAGCTCAGCACAGAATTTCGTTCAGCTCCATCTATTTTCCAGGCTATACGGTGCATGTCATCTGCTGCAAGTTCCAGGGTTTTTGTTGGAGGACTGTCATATTCCACTGATGAGCAAAGTTTGAGGGAAGCTTTTGCAAAATATGGAGATATAGTTGATGCAAGAATAATTATGGATCGTGACTCTGGGAGATCTAGAGGGTTTGCTTTTGTCACTTACACATCAGTTGAGGAGGCATCGAGTGCCATTCAGGCCTTAGATGGGCAGGATCTTCATGGTCGCCGAGTTAGGGTAAATTATGCTAATGAGAGGCCTCGCTATGGTGGTGGTGGTGGTTTTGGTGGTTCTTATGGCAGTGCTCCATATGGTGCTGGTGCTGGCTATGGAGGCAGTTATGGTAACCCTCCATATGGTGGCTCTGGTGCTTATGGTGGCAATGCTGCTGGAGGTTATGGTGGTGGTGGATATGGTGGGGGAAGCTATGGATCAGGTGGCAACTTTGGTGCCAGCCCTGGCAATGACTTTGCGTCTAACAATTTTGGAGCTGGAGCTGCAGGTGGCAGTTATGGAAATGATGGTAACTTTGCAAGTGGAAGCCCTTATGCTGGCGGAAGTGGCGGCGGATATGGTGGTGACAGTGGAAGTGGAGCTGCTGCTGACAGCTTTGGAACTGGAAGTGCTACTGGTGGCTTTGGCGGAACCAATTATTCAAATGATGGGAACTTTGCAACTGGAAGCACGTATGCTGCAAGTAGCAGTGGAAGCTTTGGTGGCAATAGTGAGAACTTTGCAAGTGGAAGCACTTATACCAGTGGCAGTGGTGGAGGATATGGTGGCAATGGTGGGAACTTTGGTGTTGCTGGTGGTGGTGGAGGCAGTGATAACTATGGAAGTGCTCCTAGTTTCGGTGCTGCTGTTGGTGGCGGCAGTGATAGCTTTGGCAGTGCCGCTGGATTTGGCAGCAGTGATAACTTTGGCAGTTCGGCTAATTTTGGTAGCAGTGGTGTTCCAGGTTCAGGCAGTAGCTTTGCGGGTGGTCAATTGGATGGTAAAGAAAGCAACAGTATGGGTCAGGATGTTGAAGATTTTGAGGACAAAATAGGTGAAAGCTACCGGATTGGAGATTTTGCAGACAAGATAGAGGAAAACTCCCGGGATGACGATGATGATACCGGGGATTTTGCCAAAAGGGCTTGA 1248 0.4848 MAFFGRVGNILRQAANKQLSTEFRSAPSIFQAIRCMSSAASSRVFVGGLSYSTDEQSLREAFAKYGDIVDARIIMDRDSGRSRGFAFVTYTSVEEASSAIQALDGQDLHGRRVRVNYANERPRYGGGGGFGGSYGSAPYGAGAGYGGSYGNPPYGGSGAYGGNAAGGYGGGGYGGGSYGSGGNFGASPGNDFASNNFGAGAAGGSYGNDGNFASGSPYAGGSGGGYGGDSGSGAAADSFGTGSATGGFGGTNYSNDGNFATGSTYAASSSGSFGGNSENFASGSTYTSGSGGGYGGNGGNFGVAGGGGGSDNYGSAPSFGAAVGGGSDSFGSAAGFGSSDNFGSSANFGSSGVPGSGSSFAGGQLDGKESNSMGQDVEDFEDKIGESYRIGDFADKIEENSRDDDDDTGDFAKRA 415
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Pral4212g00021 415 PANTHER HETEROGENEOUS NUCLEAR RIBONUCLEOPROTEIN 87F-RELATED 25 201 - -
Pral4212g00021 415 MobiDBLite consensus disorder prediction 345 371 - -
Pral4212g00021 415 FunFam Glycine-rich RNA-binding protein 3, mitochondrial 12 145 - -
Pral4212g00021 415 MobiDBLite consensus disorder prediction 345 415 - -
Pral4212g00021 415 ProSiteProfiles Eukaryotic RNA Recognition Motif (RRM) profile. 42 120 IPR000504 GO:0003723
Pral4212g00021 415 Pfam RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain) 44 114 IPR000504 GO:0003723
Pral4212g00021 415 CDD RRM2_NsCP33_like 43 118 - -
Pral4212g00021 415 SMART rrm1_1 43 116 IPR000504 GO:0003723
Pral4212g00021 415 MobiDBLite consensus disorder prediction 372 398 - -
Pral4212g00021 415 Gene3D - 7 136 IPR012677 -
Pral4212g00021 415 SUPERFAMILY RNA-binding domain, RBD 41 148 IPR035979 GO:0003676
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Pral4212g00021 Pral-Chr4212 117821 120632 Tandem
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Pral4212g00021 40 122 C2H2 Transcription Factor Family AT2G19380 32.530 7.12e-10 58.9
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Pral4212g00021 K12741 - jre:108994219 210.305