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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Phco2g02618 ATGGCGCTACTCGTTCTCTCTCTGTGCCTCCTCCTCTTCACCTTCCGCTCCTATGGACAATCGAGCTCCATGGAATCAGTTCCCGATCTTCAGAACACTATGTATGCTTCCATCGAAGGATATCCTTGCGTGCGGCTGCTGAATCTCTCTGGAAACATCGGTTGTTCTAATCCTGGACGAGATAAGGTTGTGGCTCCTATTGTACGGTTCGAAAATGTTGACAAAATAGCTGAGCCGTCTGCTATACTGGTGTCACTAGAGGAGTTTCCAATTCTCTTTACTAGAATATCAGATGACTCTAGATTTGCTAGTAAAGTCAGCGGTGTACTTGTGGAACCAACTACTGATTTGCAGAATAAGTTAAATGGATTTTCTCCCGATCAAAAGTTTCCACAAGGTCAATTTGCGCCTTACCATAATACCGGCTATGAATGGAATCCTATTGGTTCTGGCATTATGTGGAAATCCTACAGTTTTCCTGTGTTTTTACTCACAGAAAGTGGGTCAAAGACTCTTAAAGAGTTTGTAACAAACAATGAGGACAAAAAGAAAGCTTATACTTCTAATGTGGCTGAGTTTGATCTGGTGATGCAGACTGTGAAATCTGGGACACTTGATTCGAAGTCTTGTTTAAAAGAAGAAACATGCCTTCCTTTAGGTGGATACAGTGTCTGGTCATCTCTTCCTCCGATCAACACTTCTTCCTTACAACAGTCTAAGCCCATCTTATTGGCAGTGGCCTCCATGGATTCTGCTTCATTTTTTCGGGACAAAAGCCTTGGGGCAGACTCCCCTATTTCTGGTTTAATTGCATTACTAGCGGCTGTTGATGCACTTTCTCATTTGGACAGTCTTGGTGACCTTAGTAAACAGCTTGTTTTCGCAGTTTTCACTGGAGAGGCATGGGGTTATCTTGGAAGTAGGAGATTTTTGGTAGAACTTGACTTGCACTCAGATGCTGTTCATGGTCTTGATCAGGGATTAATTGAAACGGTCTTTGAAATTGGTTCTGTTGGAAAGGGTCTCAGTGAAGGTGTTAACAAATTTTTTGCTCATACAGAAGGGGATTCTTCTGCCACAAATCAGACAGTGGCTGCCTTGAAACGTGCACAGGAGTCACTGTTATCTGAAAACGTAAAGATAGCATCTGCAAGTTCTTCAAATCCTGGGATACCTCCATCATCTTTAATGTCCTTTTTGGAAAAGAATCCTGCAATCTCTGGTGTTGTCCTTGAAGATTTTGACTCTATCTTTGTCAACAAGTTCTACCACAGTCACCTTGATGATTTATCAAATATAAATTCCTCAGCTGTAGTTGCTGCTGCTTCTCTTGTTGCTCGAACCCTTTACATACTCGCTAGTGAAATTGAAGATGTTCAAGATCCAACTTTGGCTGCTATAAATGTTAATGTCTCACTTGTTGAACAACTTATGGGTTGCTTGTTGGACTGTGATCCTGGTCTTTCTTGTGAATTGGTGAAGAAATATATTTCACCCTTGTCAACCTGTCCAAGCCATTATGTTGGTGTTATCTTGGATGAGCCTTCATCTACACCATATACAGGATACATCAATGATGTTCCCAGGTTCATTTGGAATTTTCTGGCTGACAGAACTTCTATCCCGAGGGAGACTAACAGCTCAGGTTGTCAACATGGTTGTAATGGTAAAGATGCAGTTTGCATCAAAGTAGAGACTGATGGAAAGGGAGTTTGTGTTCTCTCTACAACAAGGTATGTTCCAGCATACTCAACACGGCTAAAATTTGAATCAGGAGTGTGGAATGTTTTGTCTCCTAATTCCTCTGAAAAAATGGGGATTGTGGACCCTGTCTGGACTGAGAGCAACTGGAATTCAATAGGTATGCGGGTCTACACAGTCCAAAATGCTGCTTCTGATCGGTTTGTTTTGTTTGGGGGCATCACTTTGACAATCTTCTCATACCTTGCAATAGCAACTGCAAGAACCTTTTTTTCCAAAGCAATGAAGAGGGATTGA 1998 0.4184 MALLVLSLCLLLFTFRSYGQSSSMESVPDLQNTMYASIEGYPCVRLLNLSGNIGCSNPGRDKVVAPIVRFENVDKIAEPSAILVSLEEFPILFTRISDDSRFASKVSGVLVEPTTDLQNKLNGFSPDQKFPQGQFAPYHNTGYEWNPIGSGIMWKSYSFPVFLLTESGSKTLKEFVTNNEDKKKAYTSNVAEFDLVMQTVKSGTLDSKSCLKEETCLPLGGYSVWSSLPPINTSSLQQSKPILLAVASMDSASFFRDKSLGADSPISGLIALLAAVDALSHLDSLGDLSKQLVFAVFTGEAWGYLGSRRFLVELDLHSDAVHGLDQGLIETVFEIGSVGKGLSEGVNKFFAHTEGDSSATNQTVAALKRAQESLLSENVKIASASSSNPGIPPSSLMSFLEKNPAISGVVLEDFDSIFVNKFYHSHLDDLSNINSSAVVAAASLVARTLYILASEIEDVQDPTLAAINVNVSLVEQLMGCLLDCDPGLSCELVKKYISPLSTCPSHYVGVILDEPSSTPYTGYINDVPRFIWNFLADRTSIPRETNSSGCQHGCNGKDAVCIKVETDGKGVCVLSTTRYVPAYSTRLKFESGVWNVLSPNSSEKMGIVDPVWTESNWNSIGMRVYTVQNAASDRFVLFGGITLTIFSYLAIATARTFFSKAMKRD 665
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Phco2g02618 665 PANTHER NICASTRIN 8 664 IPR008710 GO:0016020|GO:0016485
Phco2g02618 665 Pfam Nicastrin 241 450 - -
Phco2g02618 665 Pfam Nicastrin small lobe 42 199 IPR041084 -
Phco2g02618 665 CDD M28_Nicastrin 36 618 - -
Phco2g02618 665 Gene3D Zn peptidases 173 466 - -
Phco2g02618 665 SUPERFAMILY Zn-dependent exopeptidases 214 452 - -
Phco2g02618 665 FunFam Nicastrin 169 465 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Phco2g02618 Phco-Chr2 55894917 55901956 Dispersed