Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Phco2g01360 ATGTATGAGCATAGAATGTTGTTAAGAATGGCGTTTTGTGGTTCAAAAGTTTCATTACATGTTATATTATATTCTTTATTCGCCATTTATTTTCTTAGGTTTGAGAATTATTGGTGTGTTGATGCACACTCAACCCACTCAACCCTAGTTGTGGATGCTAATAATAAGGTGTCTCCAAGAACAATTCCTAACACTTTCCTTGGAGTATTTGTTGAGGAAATTAATCATGCGTGTGCTGGGGGACTATGGGCAGAACTTGTTAGTAATAGAGGGTTTGAAGCTGGAGGCCTGAACAATACCTCCAATATTTATCCATGGTCAATTATAGGAAACAAATCATTCATTTCTGTATCAATTAACTATACCTCATGCTTTGAGCGTAATAAAGCTGCATTACAAATGGATGTGTATTGTAGTGATCACAACCCTTGTCCAATTGGTGGCGTTGGTATTTCTAACCCTGGTTATTGGGGCATGAATATCGAGCAAGGGAAATGGTACAAGGTGGTCTATCATGTTAAATCAGAAGGAAAGTTTGATTTTCAACTTTCATTCACGGGTGTTGATGTTATAAAGATGACATCAAATATCACACAAGTTTCTGAAGGTGGAAAATGGAAAAGGGTGGAGACGGTGGTGGAAGCAAACGCTACCAATCACTATTCAAGTCTTCAAATAACCACAACCAATGAAGGAAGTTACTTGTTAGACCAAGTGTCAGTGATGCCATTGGACACTTACATGGGTCATGGCTATCGAAAGGATCTTTTCCAAATGGTCGCAGATTTGAAACCAAAATTTATCAGATTTCCTGGTATGTTCAAATTCTATGATTCCAAGGGAGGTGGAACGTATGTTGAAGGAGACTATCTCAAGAATCACTATTTGTGGAAAGATACAATTGGACCATGGGAAGAAAGACCAGGACACTATAATGATATTTGGAACTATTGGAGTGATGATGGAATTGGTTATTTAGAGTATCTCCAACTAGTAGAGGACCTTGGTGCATTGCCCATATGGGTGTTCAATGCTGGTTTCAGTCGTCATGAAGAAATTAATACAACTAATTTAGCACCTTATGTGCAAGATGCCCTTGATGGAATTGAATTTGCAAGAGGATCTCCTAAATCAAAATGGGGTTCTGTTAGAGCTAGATTGGGACATCCAGAACCATTTGATTTGAGATATGTTGCCATTGGAAATGAAGATTGTGAGTTTTCGAATTATCAAGAAAATTACCTTAAGTTCTATGATGCTATAAAATCTGCCTACCCAGATATGAAAATCATCTCAAACTGTGATGCTTCTAGCACACCATTAAACCATCCAGCTGATTTGTTCGATTTTCATATTTATACAAACTCAAGTGACTTATTTTCTAAGTCTACCCAGTTCGATCACACGTCACGATCTGGACCAAAGGCTTTTGTTAGTGAGTATGCTGTATGGAGACAAGATGCTGCAAATGGAAGTCTTCTGGCTGCTTTGGCGGAAGCTGCATTTCTTATTGGCCTAGAAAAGAACAGATGGATCCCCGATGCAATTGTGTTCGACTCTCATCAGCTCTATGGAACACCCAGCTATTGGGTGCAAAAGCTTTTTATTGAGTCTAGTGGAGCAACATTTATTCACTCAAAACTGAAAACAACTTCATCTAATAAACTTATTGCATCTGCAATTAGTTGGCAAAATTCTACAGATAAGAAGAATTACATAAGAATAAAGGTAGTGAACTTTGGAGCAGCCACAGAGACACTTCACATACGCATACATGGGTTCTCAATAAGCCAACTATTTCGTTCTGTAAAGACAGTGATTACATCAACCAACGTAATGGATGAGAATTCTTTCTCACAACCTACCAAGGTGGTGCCACAAACAAGTTCCGCAGTGAATGTTAAAAGGAAGATACATGCAGTTGTTTCTCCCTATTCAGTCACATCATTCGATTTGTTAGTTTATTAG 1968 0.3816 MYEHRMLLRMAFCGSKVSLHVILYSLFAIYFLRFENYWCVDAHSTHSTLVVDANNKVSPRTIPNTFLGVFVEEINHACAGGLWAELVSNRGFEAGGLNNTSNIYPWSIIGNKSFISVSINYTSCFERNKAALQMDVYCSDHNPCPIGGVGISNPGYWGMNIEQGKWYKVVYHVKSEGKFDFQLSFTGVDVIKMTSNITQVSEGGKWKRVETVVEANATNHYSSLQITTTNEGSYLLDQVSVMPLDTYMGHGYRKDLFQMVADLKPKFIRFPGMFKFYDSKGGGTYVEGDYLKNHYLWKDTIGPWEERPGHYNDIWNYWSDDGIGYLEYLQLVEDLGALPIWVFNAGFSRHEEINTTNLAPYVQDALDGIEFARGSPKSKWGSVRARLGHPEPFDLRYVAIGNEDCEFSNYQENYLKFYDAIKSAYPDMKIISNCDASSTPLNHPADLFDFHIYTNSSDLFSKSTQFDHTSRSGPKAFVSEYAVWRQDAANGSLLAALAEAAFLIGLEKNRWIPDAIVFDSHQLYGTPSYWVQKLFIESSGATFIHSKLKTTSSNKLIASAISWQNSTDKKNYIRIKVVNFGAATETLHIRIHGFSISQLFRSVKTVITSTNVMDENSFSQPTKVVPQTSSAVNVKRKIHAVVSPYSVTSFDLLVY 655
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Phco2g01360 655 Gene3D - 537 652 IPR013780 -
Phco2g01360 655 FunFam Alpha-L-arabinofuranosidase 1 536 653 - -
Phco2g01360 655 Pfam Alpha-L-arabinofuranosidase C-terminal domain 510 646 IPR010720 GO:0046373|GO:0046556
Phco2g01360 655 SMART alpha_l_af_c 479 646 IPR010720 GO:0046373|GO:0046556
Phco2g01360 655 SUPERFAMILY (Trans)glycosidases 224 543 IPR017853 -
Phco2g01360 655 Gene3D - 90 238 - -
Phco2g01360 655 Gene3D Glycosidases 239 536 - -
Phco2g01360 655 PANTHER ALPHA-L-ARABINOFURANOSIDASE 1 26 653 - -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Phco2g01360 Phco-Chr2 42498829 42503498 Tandem