Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Mupr850g00009 ATGATTTCCCAGCTAAATTTAAATGGCTTGTTTGTTTCCCACCCTGCCATGCTTCCAAAACGCGTTTCACCGCAAACCCAAACCCCATGTTTGGTTTCTCGATGCTTTGGCGCTTTCTCTCCACTGAGTTCCTCCAAACGCGTCTCTCGGGTGGTGAGGACTGATGTTCAGCACGCTCTAATGGATTACCTGCACTCCACGCGGGGCTACACCTTCTCTGATGCCGAGTACGTCAGCAAGAACTCGCCGCGTTTTGTTGAATCACTGGCGTCGATCATCGACGACAATCACAAACACGACGTTCCTCGATCGTTGAGGAAGTTCCTCAGGTACAACCCCATTAACGAGTTTGAACCCTTTTTTGAGAGTTTGGGAATTGGCCCTTCCGAGTTGCATTTACTTCTCCCCCGTGGCATTATTTTCTTGGCCGATGATTATCTCTTGCTTGAAAATTTTCACGCTTTGTGTAATTATGGAGTGCCAAGGAACAGAATGGGGAAGTTTTATAAGGAGGCAAAAGAGATTTTTGGTTATGCTAGTGGGTTGTTGCCGTTGAAGTTGCAAGGTTATGAGAATTTGGGTTTGGGTAAATCAACTGTTGTCAAACTTGTTGTTTGTTGCCCTTTGCTTCTGGTTGGTGATGTTAATTGTGAATTTGTTGCTGTGCTTGGTTGGTTGAAAAGAATTGGGATTGAAAGTGATTGGATGGTGAATTACTTGTCTTGTTCAAGGACATATAGTTGGAAAAGGATGCTTGATACCATGCAGTTTCTTCATAAAGTGGGTTATTCTGAGGAACAAATGCACAATTTGTTTAGGGAAAACCCTAAGTTGTTGTTGGAAGGTTTTGGGAGGAAGCTGTACTTATTTTTTGGTCTTTTGCTTAAATTGGGTGTTGAGATGGGTGTGATTTATTCTTACATTGTAGAGTATCACTGTATCTTGTCAAATAAGTGTGCTAAAAATTTGTTGAGAGTGATTGGTTTTTTGTGTGCTATTGGAATGGGGAAAGATGACATTGCACACATTTTGTCTAAGTACATGCATCTCCTGAGTACACGTTCGTTGAAAGGTTATAAAACTGTTTGTAAGGAGTTAAAAGTTGGGAAAGCTGATTTGTGCCAAATCCTAAAGGATGATCCATTGAAGCTAATTAGTTTGGCTTCAAAACAGGAGCAGAAGGGCGACGGAAAGGTATATAGTCATGATCCACGTAATTATTTGGAAAAGACAACTTTCTTGCTGAAATTGGGATATACCGAGAACTCTGAAGAGATGGCAAAAGCATTAAAAATGTTCCGAGGGAGAGGTGATCAATTACAAGAGAGGTTTGATTGCCTGGTAGAAGCTGGTTTGGACTATAACAGTGTGATAGAAATGATAAAACGAGCTCCCATGATTCTAAACCAGAAGAAAGATGTAATTAAAAGGAAGATTGATTTCTTAAGAAATGTTTTGGGTTACCCCCTAGAATGTCTTGTGGGATTCCCAACATACTTTTGCCATGATTTGGAGAAAATTGTTGAAAGACTTTCAATGTATGCGTGGCTGAAGGAGAGGAACGCAGTAAATCCTTCGTTAGCTCTGAGTACCATAGTTGCATCCAATGATAAACGCTTTGTAAAATATTTTGTGAATGTGCATCCTCAAGGTCCAGCCGTTTGGAAGGGTTTAAAAAGTCAAAATCACCCCTTTCATTTCTTCCCTGATACATATGAAAAACCCCTAACAACACAAAACCCATTTCACCTTTTCCCCAAAGCTCCAAGCTTTCCCGGTTCTACATCTATCCATGTTCTTCAAGTTTCAAGGGTGCATTCTATTCATTCACGCTTTTCTGTGAAACGGGTATCTCGGCATGTAAAGGGCAAAGTGCAGGATGTGCTCTTGGATTACTTGCATTCAAGCAGGGGATACAGCTTCACAGATGCTGAATTCATCAGCAAAAACTCACCTTTTTTTGTTAAAGGTTTGGTGTCAGAGTTTCATGGACAGGATGATGATGTTGCCAGGTGTTTGAGGAAATTCCTGAGGTACAACCCCATTAATGAGTTTGAACCATTTTTTGAGAGTTTGGGGATTAGCCCTCGTGAGTTGCCTTTGTTTCTCCCACGTGGCATGATGTATTTGTCTGATGATCATGTTTTGCTTGACAATTTCCATGCTTTGAGTAACTATGGGGTTCCAAGAAATAGGATAGGGAAAATTTATCAGGAGGCAAAAGTGGTTTTTGGGTATCCTAGTGGATTGTTGTTGTCGAAATTTCAAGGTTATGAAAATTTGGGCTTGAGTAGATCCATGGTCATCAAGCTTGTTGTTTCTTGCCCTTCACTTTTGGTCGGTGAAACAAGCAGTGAATTGGTCATGGTTCTGGATTGGTTGAAGAAAATTGGTATTGAACATGATTGGATTGGGGATTACTTGTCTTGTTTGAAGACGTATGAGTCAAGAAGAATGCTTAATGCTATGCAGTTTCTTCATAATGTGGGCTATTCTGACAAACAGATGCACAATTTGTTCAAGGAAAACCCTGCATTATTATTGGAAGGTCTTGAGAAGGTGTATGTCTTCTTGTGTCTAGCATTTAAGTTAGGTCTCAATAAGAATATGATTTATTCTTCTTTTATAGAATATCCCCATATCTTGTCAAATAAATGTGCAAAAAATCTTTTGGGAGTGATTAGCTTTTTGTGCTTTATTGGAATGGATATAGATGACATTTCACATATTTTGTCTAACCACATGCATCTCCTTAGCTCACATCCCTTGAAAGGTCCTAAAGCTGTTTGTTTGCAGTTAAAAATTAGAAAAACTGATCTATGCCAAATCATAAAGAATGATCCACTGAAGCTAATTAGTTTGGCTTCAAAACTGAAACAGAATAGTACTGTACAGTTATCATGTGATGACCCAAGTAAACATTTGGAGAAAACAACATTCTTGCTGAAGTTGGGATATGCTGAGAACTCTGAGGAGATGGCAAAAGCAGTAAAAAGGTTCAGAGGGAGAGGTGATCAATTACAAGAGAGGTTTGATTGCCTGGTTGAAGCTGGTTTGGACTACAACATTGCAATCAAAATGATAAAATGTGCTCCTATGATTCTAAACCAGAACAAAGTTGTGATTCAAAAGAAGATTGATTTCTTAAGAAACATTTTAGGTTACCCATTAGATTGCATTGTGTCATTTCCGGCATACTTATGCTATGATTTGGAGAGAATTATGCTCAGATTTTCAATGTATGCGCGGGTGAAAGAAAGGAAAGCAGCAAAACGTATGATGACCTTGAGCACTATCCTTGCATCCTCTGATGAAAAGTTTGTAAAATATGTTGTCAATGTGCATCCCGAAGGTCCAGTCATCTGGGAAGGTCTAAAAAGGTTATTGCAAAAAGATAATAACTAA 3405 0.3941 MISQLNLNGLFVSHPAMLPKRVSPQTQTPCLVSRCFGAFSPLSSSKRVSRVVRTDVQHALMDYLHSTRGYTFSDAEYVSKNSPRFVESLASIIDDNHKHDVPRSLRKFLRYNPINEFEPFFESLGIGPSELHLLLPRGIIFLADDYLLLENFHALCNYGVPRNRMGKFYKEAKEIFGYASGLLPLKLQGYENLGLGKSTVVKLVVCCPLLLVGDVNCEFVAVLGWLKRIGIESDWMVNYLSCSRTYSWKRMLDTMQFLHKVGYSEEQMHNLFRENPKLLLEGFGRKLYLFFGLLLKLGVEMGVIYSYIVEYHCILSNKCAKNLLRVIGFLCAIGMGKDDIAHILSKYMHLLSTRSLKGYKTVCKELKVGKADLCQILKDDPLKLISLASKQEQKGDGKVYSHDPRNYLEKTTFLLKLGYTENSEEMAKALKMFRGRGDQLQERFDCLVEAGLDYNSVIEMIKRAPMILNQKKDVIKRKIDFLRNVLGYPLECLVGFPTYFCHDLEKIVERLSMYAWLKERNAVNPSLALSTIVASNDKRFVKYFVNVHPQGPAVWKGLKSQNHPFHFFPDTYEKPLTTQNPFHLFPKAPSFPGSTSIHVLQVSRVHSIHSRFSVKRVSRHVKGKVQDVLLDYLHSSRGYSFTDAEFISKNSPFFVKGLVSEFHGQDDDVARCLRKFLRYNPINEFEPFFESLGISPRELPLFLPRGMMYLSDDHVLLDNFHALSNYGVPRNRIGKIYQEAKVVFGYPSGLLLSKFQGYENLGLSRSMVIKLVVSCPSLLVGETSSELVMVLDWLKKIGIEHDWIGDYLSCLKTYESRRMLNAMQFLHNVGYSDKQMHNLFKENPALLLEGLEKVYVFLCLAFKLGLNKNMIYSSFIEYPHILSNKCAKNLLGVISFLCFIGMDIDDISHILSNHMHLLSSHPLKGPKAVCLQLKIRKTDLCQIIKNDPLKLISLASKLKQNSTVQLSCDDPSKHLEKTTFLLKLGYAENSEEMAKAVKRFRGRGDQLQERFDCLVEAGLDYNIAIKMIKCAPMILNQNKVVIQKKIDFLRNILGYPLDCIVSFPAYLCYDLERIMLRFSMYARVKERKAAKRMMTLSTILASSDEKFVKYVVNVHPEGPVIWEGLKRLLQKDNN 1134
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Mupr850g00009 1134 PANTHER CGI-12 PROTEIN-RELATED 630 1114 IPR003690 GO:0003690|GO:0006355
Mupr850g00009 1134 FunFam Transcription termination factor MTEF18, mitochondrial 289 558 - -
Mupr850g00009 1134 FunFam mTERF family protein 94 245 - -
Mupr850g00009 1134 SMART mt_12 201 232 IPR003690 GO:0003690|GO:0006355
Mupr850g00009 1134 SMART mt_12 458 489 IPR003690 GO:0003690|GO:0006355
Mupr850g00009 1134 SMART mt_12 423 453 IPR003690 GO:0003690|GO:0006355
Mupr850g00009 1134 SMART mt_12 873 903 IPR003690 GO:0003690|GO:0006355
Mupr850g00009 1134 SMART mt_12 306 336 IPR003690 GO:0003690|GO:0006355
Mupr850g00009 1134 SMART mt_12 990 1020 IPR003690 GO:0003690|GO:0006355
Mupr850g00009 1134 SMART mt_12 1057 1088 IPR003690 GO:0003690|GO:0006355
Mupr850g00009 1134 SMART mt_12 490 523 IPR003690 GO:0003690|GO:0006355
Mupr850g00009 1134 SMART mt_12 769 800 IPR003690 GO:0003690|GO:0006355
Mupr850g00009 1134 SMART mt_12 1025 1056 IPR003690 GO:0003690|GO:0006355
Mupr850g00009 1134 SMART mt_12 269 300 IPR003690 GO:0003690|GO:0006355
Mupr850g00009 1134 FunFam mTERF family protein 663 813 - -
Mupr850g00009 1134 Gene3D Transcription termination factor 3, mitochondrial 856 1118 IPR038538 -
Mupr850g00009 1134 Gene3D Transcription termination factor 3, mitochondrial 288 556 IPR038538 -
Mupr850g00009 1134 Gene3D Transcription termination factor 3, mitochondrial 670 810 IPR038538 -
Mupr850g00009 1134 Gene3D Transcription termination factor 3, mitochondrial 119 287 IPR038538 -
Mupr850g00009 1134 Pfam mTERF 867 1107 IPR003690 GO:0003690|GO:0006355
Mupr850g00009 1134 Pfam mTERF 432 540 IPR003690 GO:0003690|GO:0006355
Mupr850g00009 1134 Pfam mTERF 823 961 IPR003690 GO:0003690|GO:0006355
Mupr850g00009 1134 Pfam mTERF 255 470 IPR003690 GO:0003690|GO:0006355
Mupr850g00009 1134 Pfam mTERF 723 853 IPR003690 GO:0003690|GO:0006355
       

Transcription factors information

Select Regulatory Factors Family Gene Hmm_acc Hmm_name E_value Clan
TR mTERF Mupr850g00009 mTERF 2e-15 No_clan
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Mupr850g00009 - - aprc:113846643 941.028