Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Mupr3593g00002 GTTTCAGCAATGGCTTTCTTTGGTAGAATTGGGAACTTGTTAAGACAAGCAGCGAGCAGGCAGGCTATACGCTGCATGTCTTCTGCACCAAGCTCCAAGCTGTTTATAGGAGGTGTTTCATATTCTACTGATGAGCAAAGCTTGAGGGAAGCCTTTTCAAAATATGGTGAAGTTGTTGATGCAAGGATAATTATGGATCGTGAAACTGGTAGATCCAGAGGATTTGGCTTTATTACATACACTTCAGTTGAGGAGGCATCCAGTGCCATTCAGGCCTTGGACGGTCAGGATCTTCATGGTCGCCAGATTAGGGTAAATTATGCTAACGAAAGACCTCGTGGATATGGCGGTGGTGGTGGTGGCTTTGGTGGTTCATATGGTGCTGGAGCTGGTGCTGGCTACGGAGGTGGTTATGGTGGTGGCTATGGTGGAAATGCTGGTGGTGGTTATGGTGGTGGCAGCTATGGTGGAAATGCTGCTGGCGGTTATGGTGGTGGCAGCTATGGTGGAAATGCTGCTGGTGGTTATGGTGGTGGCAGCTATGGTGGAAATGCTGCTGGTGGTTATGGTGGTGGTGGATACGGGAACAGTGGCTCTGGCAATAACTATTCTGCTGCTGACAGTTTTGGAAGTAGCAGTGCTGGTGGCAGTTACAGTGGGAGTGGGATGAATTATGGTAATGATGGAAACACTTACACTGGTGGAAGTAGTGGAGGCAATGGTGGTAACAGTGGAAATTTTGGTGATGCTGGTGGTATAGGCACTCATGAAAGCTCTGCTGGTTTTGCCAGTAGTGGATTTGATGAAAGTGCTGTGGATGGCAGTGGTGGTACAGGTACTGGCACCAGCTTTGCTGATGGAAGTGGGGGGTTTGAATTTGGCGGCAGTGGCCAATTGGATAGCAAGGCAAGCGGCAATGGAGATGAGGATTTGGGAGATTACAGGGATGACAATGATGATACTGATAATTTTGCCAAAAGGGCTTGA 987 0.4843 VSAMAFFGRIGNLLRQAASRQAIRCMSSAPSSKLFIGGVSYSTDEQSLREAFSKYGEVVDARIIMDRETGRSRGFGFITYTSVEEASSAIQALDGQDLHGRQIRVNYANERPRGYGGGGGGFGGSYGAGAGAGYGGGYGGGYGGNAGGGYGGGSYGGNAAGGYGGGSYGGNAAGGYGGGSYGGNAAGGYGGGGYGNSGSGNNYSAADSFGSSSAGGSYSGSGMNYGNDGNTYTGGSSGGNGGNSGNFGDAGGIGTHESSAGFASSGFDESAVDGSGGTGTGTSFADGSGGFEFGGSGQLDSKASGNGDEDLGDYRDDNDDTDNFAKRA 328
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Mupr3593g00002 328 PANTHER HETEROGENEOUS NUCLEAR RIBONUCLEOPROTEIN 87F-RELATED 20 217 - -
Mupr3593g00002 328 SMART rrm1_1 33 106 IPR000504 GO:0003723
Mupr3593g00002 328 MobiDBLite consensus disorder prediction 246 328 - -
Mupr3593g00002 328 Gene3D - 15 127 IPR012677 -
Mupr3593g00002 328 PRINTS Eggshell protein signature 162 177 - -
Mupr3593g00002 328 PRINTS Eggshell protein signature 234 252 - -
Mupr3593g00002 328 PRINTS Eggshell protein signature 189 199 - -
Mupr3593g00002 328 PRINTS Eggshell protein signature 28 44 - -
Mupr3593g00002 328 Pfam RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain) 34 104 IPR000504 GO:0003723
Mupr3593g00002 328 SUPERFAMILY RNA-binding domain, RBD 27 124 IPR035979 GO:0003676
Mupr3593g00002 328 CDD RRM2_NsCP33_like 33 108 - -
Mupr3593g00002 328 ProSiteProfiles Eukaryotic RNA Recognition Motif (RRM) profile. 32 110 IPR000504 GO:0003723
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Mupr3593g00002 Mupr-Chr3593 15149 17834 Dispersed
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Mupr3593g00002 12 178 Eukaryotic Initiation Factors Gene Family AT2G36660 26.163 1.79e-12 66.2
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Mupr3593g00002 K12741 - gmx:100799124 202.216