Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Mtr8g0636 ATGAAGGCTCTGAATGGGTTATTGGGTTTAAAACGCAGAAAAATTCATGGGGTTTTCAATGGTTTATGTGTTATGGTTGTGTTCTTCTTTTTTTACAACAGGGAAGATATAATTCGAAACCCCCTTCTTAGACAATCTGCTTATTTGGTTAATCAACATGGTTTGTCTCAAAATTTGATTTTGAAAAATGGGGTTTCGGTTATTCACCGTAGAATGGTTGAAATTAGGAATAGTACTAATGATTCGAGTTTAGTTGGTAATGAAGATTTGGGTGTGAGTACACCGGGAGTGTGCTTTGGATTGCTTCAGTATGATGGTTATGATAGCCCTTGTGAATTTTTGAAGGTGAATCCTCAGTGTAGTTCTGATGGGTATATTGATTACTTGAGGTTTTTCTATTGTAAATGTCGAGGTTTTAGGGCTCTAGGCTATCTAGTATTGGGTGTTTGGCTTGCTGCTTTGTTTTATCTCTTGGGGAACACTGCAGCGGATTATTTTTGTCCTTCGCTTGAGCATCTCTCGAGGCTTTTGAAGTTGCCTCCTACTGTAGCTGGTGTTGTGTTGCTTCCTCTTGGGAATGGTGCGCCGGATGTGTTTGCTAGTATAGCGTCGTTTGTGGGGACTGATACGGGTGAAGTTGGTCTTAACAGTGTGTTAGGTGGGGCTTTGTTTGTTACTACTGTTGTGGTTGGAACTGTTTCTCTTTGTGTTGCAGAGAGGGATGTTCAAGTTGATCGACGATGCTTTATAAGGGATTTGAGTTTCTTCCTGTTCACTATTTTTTCGCTGCTTTTGATTTTGTTTGTTGGCAAGATTGGTATTGGGGCAGCGATTGGTTTTGTATCGATTTATGTTGTTTATGCTTTCATTGTTGCTGCCAATGAGATATTGCGGAAACATGCACGGAGGTTGAAATTGGATTCTGTGACACCTATGCTTCCTGTCCAAGGAAGCGTGTTCTCTATTGGTTCTGAAGAGGATACTACTATATATAGCTCTTTGCTTGACTTAGACACCGAGAGCGATCCTCCCCGTCTCCCTCCTTCCTTGCCTCAGTGGATGTGGTCTTCGAATGTGGCAATATATTCAAACCAGGCAAGTAAAATCTATCATTTAGACGATGAAAGGCCTCCTTGGGGGTGGAGTGATGGAACCCCAGAAAACACCAGGTCGTCGTTCTCTGTTTCAAAGCTTTTCTTACTCATGGAAATGCCGCTTGCAATTCCTAGACGGCTGACTATTCCAATGGTTCACGACGAAGTATGGTCGAAGCCGTTCGGTGTGGCCAGTGCTTCATTGGCTCCCATTCTCCTAGCCTTTTTGTGGAGCACACAAGATAATGTGAGTTACACGAGTATTATACTTGCTTATTGTTTTGGCATTTCTGTCGGAAGCACACTTGGTATTCTTGCATATAAATACACAGTGTCTGATCGTCCGCCGTCTCAGTATTTGATACCCTGGGTTCTTGGAGGATTCGTTATGAGCATAGTGTGGTTCTACATAATAGCAAATGAGCTTGTGGCTCTATTAGTAGCGTTTGGTTTAATGTTTGGAATTAATCCATCGATTCTTGGTTTAACTGTATTAGCATGGGGAAATTCAATGGGAGATTTAATGTCAAATGTTGCATTGGCATTGGAAGGAGGGGATGGAGTTCAGATAGCTTTATCTGGATGCTATGCAGGTCCTATGTTCAACACACTTGTTGGTTTGGGGTTCTCATTGCTGCTCGGTGCATGGTCGAAGAAACCTTCTTCATACGTGGTGCCTAAAGACGGTAGCTTATTTTACACCATGGGATTTCTTATCACAGGACTGCTATGGGCACTTGTTGTTTTACCGCGCAACAACATGCATCCCACCAGAATGTTGGGATTGGGTCTCATTGCCCTTTATGTGATATTTCTTTCTTTCAGAGTGTGTACTGCAATGGGATTAATAACAATGTATGGTTTAAGTTAG 1965 0.4204 MKALNGLLGLKRRKIHGVFNGLCVMVVFFFFYNREDIIRNPLLRQSAYLVNQHGLSQNLILKNGVSVIHRRMVEIRNSTNDSSLVGNEDLGVSTPGVCFGLLQYDGYDSPCEFLKVNPQCSSDGYIDYLRFFYCKCRGFRALGYLVLGVWLAALFYLLGNTAADYFCPSLEHLSRLLKLPPTVAGVVLLPLGNGAPDVFASIASFVGTDTGEVGLNSVLGGALFVTTVVVGTVSLCVAERDVQVDRRCFIRDLSFFLFTIFSLLLILFVGKIGIGAAIGFVSIYVVYAFIVAANEILRKHARRLKLDSVTPMLPVQGSVFSIGSEEDTTIYSSLLDLDTESDPPRLPPSLPQWMWSSNVAIYSNQASKIYHLDDERPPWGWSDGTPENTRSSFSVSKLFLLMEMPLAIPRRLTIPMVHDEVWSKPFGVASASLAPILLAFLWSTQDNVSYTSIILAYCFGISVGSTLGILAYKYTVSDRPPSQYLIPWVLGGFVMSIVWFYIIANELVALLVAFGLMFGINPSILGLTVLAWGNSMGDLMSNVALALEGGDGVQIALSGCYAGPMFNTLVGLGFSLLLGAWSKKPSSYVVPKDGSLFYTMGFLITGLLWALVVLPRNNMHPTRMLGLGLIALYVIFLSFRVCTAMGLITMYGLS* 655
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Mtr8g0636 654 Gene3D - 428 642 IPR044880 -
Mtr8g0636 654 Gene3D - 179 311 IPR044880 -
Mtr8g0636 654 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 489 640 IPR004837 GO:0016021|GO:0055085
Mtr8g0636 654 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 149 291 IPR004837 GO:0016021|GO:0055085
Mtr8g0636 654 PANTHER CATION/CALCIUM EXCHANGER 4 10 650 - -
Mtr8g0636 654 PANTHER NA+/CA2+ K+ INDEPENDENT EXCHANGER 10 650 - -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Mtr8g0636 Mtr-Chr8 7492687 7495288 Dispersed/Transposed
       

Functional genes information


Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Mtr8g0636 98 646 Antiporters AT5G17850 42.500 3.00e-122 372
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Mtr8g0636 K13754 - gmx:100796101 1083.17
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Mtr8g0636 8 7492687 7495288 Mtr8g0636 8 7492687 7495288 ECH