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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Mtr6g1334 ATGCATAAACCTGCCGCTGCGGGTAGATTCGCTGGAACCGTCGCATGGACCGATGGATTCAGGCGTGATTTTTGTAAATTCTTTGCCGGTGTTGCAGCACCGACAATTAATATTGAAGATATGATTGGTGTCCGATATATGTCTGTTGTAGGAACGACACATCAGGTTGGCCTAATCATAGCAGCTACCTTCAATAAAATTTGGAAATTATGGATGAAAAGGTTGTTCTTCTATGATTCACAGGAAAGTCTAGGGCTTCTTGCTTTATTTGGTTACATGCTCTTCCTATTCTACATTGGTGTCAAAACAGATATGAGTGTAGTCCACAAAACTAGAAGTGGTACCACCATCATAGGCTGTAGTGCTATAGTGGTTCCTTTTCTATGTGGCATTGCGGTTCTAATGTTCATCTCGCAAAGATTCATACACCCCGGGCGAACGAAGATATTTACAATTATCATTGGATTGTTCTGTATGACTCCTTTCCCTGTCATTTCCTCAACATTAAGTGATCTCAAGATCTTGAATTCCGAATTGGGTCGAATCGGCCAATCAGCATCATTAGTCAGTGAAATTTTCAGTGTATTCATAGCATCGTTAATGACGTTTGAGAAATTATACGCGGAGCGTGGTTTAGCAGATGCTTTGCTTTGCATTGCGTCCGCTATCTTCTTTATACTATTGGTTATATTCATTATTCGACCAGCGATGTTTTGGATTATAAAAGAGACGCCGGAAGGTTCTCATGTGAATGATAACTATGTTTATAGTGCACTCATATTTGCTTTGTTATCATCCTATGCTTCATATAAATTTGGATTCTTTAGTCTCTTTGGACCTTTTGTGTTGGGTTTGGCTATTCCAGAAGGACCTCCATTAGGCACAGCTATTATAAAAAAAATTGATACTTTTGTTAATGAGATTTTGATGCCATTGTTTGTGACTACAAGTGTTATGAGGGTAGATTTCAAAGAGTTGTTGAGATGGAGAAATGAAAATGATGGAAGTATTGATGATTTTATGGTGCAAACTTTGGTTCTTATTGTAGTGATTTTTGTTACCAAATTTATTGCTTGCATGATAGTTCCTTTACGCAGTAAGATGCCATTGAAGGATGCTGTGTCTCTAGCTTTGATTATGAGTTCCAAAGGCGTTGTCGAGATTTCTGCTTTCGCTGTGGTTAGAGACTCCCATGAGCTACCAGATAACGTCTTTGCTTTATTGATGATGTCCATCATAGTAAACTTTACATTGATTCCAATGCTGTTGGGTTATATCTATGATCCAGCAAAGAAATATACAGGTTACACAAAGAGAAACATAGCAGATCTCAAAAGTAACTCGGAACTTCGAGTTTTAGCATGTATTCATAGAACAGACAACATTCCAGCAACAATAAATCTTCTAGAAGCAACATATCCAACAAAAGACGAACCACTATTCACTTACGCACTTCAACTCATTGAACTAATAGGAAGAGCTTCACCAATCTTCATTTGTCACCAACTTCAAAAAAAGAAGAAATCAAATTCAAACATATCAATGGCTGAGAAGCTTTTAGAATCATTTCAAAGTTTCGAAAGAGAGTTCAATGATTGTTTAGTTGTCAACACATTCACGGCGATATCACCGGCAGAAATGATGTATGATGATATTTGTACATTAGCACTTGACAAGTTTACATCACTTATTATCCTTCCTTTTCATCGGAAATGGTCGAGCGATGGTAACTCAATCGAGTTAGAAGACGAGTCGTTAAGGGACTTGAATTTTAGGGTTATGGAAAGAGCACCATGTTCTGTTGGTATTTTAATTGAAAGAGCACAAATGACACATATTTTCTCACCAGAAACACCTTATAATGTGTGTTTGATGTTTATAGGTGGGAAAGATGATAGAGAAGCACTTTTTTTCACAAAGAGAATGACTAAGAATCCACATGTTAAACTAACTATTGTTAGGTTCTTGGCTTTTCATGTTGATGAATCAAAGGATTATTGGGAGGGTTTACTTGAAAATGAATTGTTGAGTGAAATTAAGACAAATAATAAAGTTGGTGATGTAAGTGTTAAATATGTTGAAGAAACTGTGAAAGATGGACCTGAAACAGCATTGATTATTAGGTCTTTGGTAACTGAATTTGATTTGATAATTGTTGGGAGACAAGCTGGGATTGAAACTCCTCAAACTTGTGGATTGTTGCAATGGAGTGAGTATCCTGAACTTGGTGTTTTAGGAGATCTGTTGGCTTCAACTGATGCTGCTGATAAAGCTTCTGTTTTTGTCATACAACAACAAAAAACAGCTATGGATGTTTAA 2319 0.3691 MHKPAAAGRFAGTVAWTDGFRRDFCKFFAGVAAPTINIEDMIGVRYMSVVGTTHQVGLIIAATFNKIWKLWMKRLFFYDSQESLGLLALFGYMLFLFYIGVKTDMSVVHKTRSGTTIIGCSAIVVPFLCGIAVLMFISQRFIHPGRTKIFTIIIGLFCMTPFPVISSTLSDLKILNSELGRIGQSASLVSEIFSVFIASLMTFEKLYAERGLADALLCIASAIFFILLVIFIIRPAMFWIIKETPEGSHVNDNYVYSALIFALLSSYASYKFGFFSLFGPFVLGLAIPEGPPLGTAIIKKIDTFVNEILMPLFVTTSVMRVDFKELLRWRNENDGSIDDFMVQTLVLIVVIFVTKFIACMIVPLRSKMPLKDAVSLALIMSSKGVVEISAFAVVRDSHELPDNVFALLMMSIIVNFTLIPMLLGYIYDPAKKYTGYTKRNIADLKSNSELRVLACIHRTDNIPATINLLEATYPTKDEPLFTYALQLIELIGRASPIFICHQLQKKKKSNSNISMAEKLLESFQSFEREFNDCLVVNTFTAISPAEMMYDDICTLALDKFTSLIILPFHRKWSSDGNSIELEDESLRDLNFRVMERAPCSVGILIERAQMTHIFSPETPYNVCLMFIGGKDDREALFFTKRMTKNPHVKLTIVRFLAFHVDESKDYWEGLLENELLSEIKTNNKVGDVSVKYVEETVKDGPETALIIRSLVTEFDLIIVGRQAGIETPQTCGLLQWSEYPELGVLGDLLASTDAADKASVFVIQQQKTAMDV* 773
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Mtr6g1334 772 PANTHER CATION/H + ANTIPORTER 37 769 - -
Mtr6g1334 772 Gene3D - 47 434 IPR038770 -
Mtr6g1334 772 PANTHER CATION/H(+) ANTIPORTER 4 37 769 - -
Mtr6g1334 772 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 57 421 IPR006153 GO:0006812|GO:0015299|GO:0016021|GO:0055085
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Mtr6g1334 Mtr-Chr6 20184536 20188620 Transposed
       

Functional genes information


Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Mtr6g1334 52 767 Antiporter Super Family AT5G22900 36.016 6.61e-159 480
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Mtr6g1334 - - cam:101496863 1134.78