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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Mtr1g4243 ATGGCGGTTGAAGGTGTAAATTCATTGAGGTTATCTCAAACAAAAAACCTCATAATCCAAGTTATCACAGGACGATGGTTCGTGGTGTTTGCTTCTTTTCTAATCATGTCAGCTTCAGGAGCCACCTACATGTTTGGTCTTTACTCTAGTACCATAAAAACATCCTTAGCCTATGACCAAACAACTCTTAACCTCCTTAGTTTCTTCAAAGACTTAGGTGGCAACCTTGGTGTTTTCTCTGGCTTAATCAATGAAATCACACCACCTTATGTTGTTCTTGCAATTGGTTCCCTTCTTAACTTCTTTGGTTACTTTATGATATGGTTAGCAGTGACTAAAAAAATACCAAAACCGAAAGTTTGGCAAATGTGTCTTTACATTTGTATAGGTGCTAATTCTCAGTCTTTTTCAAACACTGGTTCACTTGTTACTTGTGTTAAGAATTTCCCCGAAACTCGTGGTGTTGTGTTGGGGATTTTAAAAGGTTATGTTGGTCTTAGTGGTGCTATTATCACACAACTTTATTCTGCTATTTATTTTGATGACCCAAAAGCTTTGATTTTGCTTATTGCTTGGCTTCCAGCTGCAATTTCCTTTCTTTTTCTTCGAACAATTCGATACATGAAACCGGTTAAACAGAACAACGAACTTGGTGTTTTTTACAAGTTTTTGTATATTTCACTCGGTCTAGCTGGTTTTTTAATGGTTATGATCATATTACAGAAAAAAGTGTCTTTTAAACAGAGTGAGTATATTGGAAGTGCTTCAGTTGTTCTAATTTTGCTGTTCCTACCTCTTGCTGTTGTCTTTGTTGAACAGAAAAAGAGTCAAAAGCTTGCATTTGTCGATCCATTTTCAGTTAAAATAGTAACTGATCAAGAAGTGAAAGAGTCTGCAGCAAAAAATTGTGATACTAATGCAATGGTTTGTGTTGTTGAAGTAAAAGAAACTAGATGGTGGCAAAATATTTTTAGTCCACCTGAACAAGGTGAAGATTTTACTATATTACAAGCCCTTTTCAGCATAGACATGTTATTGCTATTCTTTGCTGGCACATGTGGTGTTGGTGGAACTTTAACAGCAATTGATAATTTAGGTCAAATTGGAACCTCACTTGGATACCCAAAAACAAGCATAAGCACATTTGTTTCATTAGTGAGTATTTGGAATTATCTAGGAAGAGTTTTTTCTGGTTTTGTTTCTGAACATGTTTTAACAAAGTACAAATTTCCACGACCACTCATGTTCACATTGATTATGTTTTTATCCTGTGTCGGTCACTTATTGATAGCCTTTGATGTGCAAAATGGCATCTATTTTGCTTCAGTAATCATTGGATTTTGTTTTGGTGCACAATGGCCATTGGTTTTTGCCATAATTTCGGAGTTGTTTGGGTTGAAATATTATTCAACTTTGATGAACTTTGGTGGGGTAGCTAGTCCAATTGGATTATATTTTCTTAATGTTAGGGTCGCTGGTCATTTATATGACAAAGAAGCTAAGAGGCAATTGATTGAAAAAGGAGTAAAAAGAAAATTGGGTCAGGAATTGAATTGTGTAGGAGCAAGTTGTTTCAGATTGTCTTTCATTATTATCACTGCAGCTACTTTGTTTGGTGCCATTATTTCACTTATTTTAGTGGCCAGAACAAATAAGTTTTATAAAGGTGATATATACAAGAGGTACCGATCAGAGCAGGTTGAAGTTGAAGGAGCTACGGCTGAGATGACGGTGGTCCAAAATGACGGCAAGAGAGGAAAGGAAGAAGCAAAAGCTACAGTGATGTGA 1788 0.3596 MAVEGVNSLRLSQTKNLIIQVITGRWFVVFASFLIMSASGATYMFGLYSSTIKTSLAYDQTTLNLLSFFKDLGGNLGVFSGLINEITPPYVVLAIGSLLNFFGYFMIWLAVTKKIPKPKVWQMCLYICIGANSQSFSNTGSLVTCVKNFPETRGVVLGILKGYVGLSGAIITQLYSAIYFDDPKALILLIAWLPAAISFLFLRTIRYMKPVKQNNELGVFYKFLYISLGLAGFLMVMIILQKKVSFKQSEYIGSASVVLILLFLPLAVVFVEQKKSQKLAFVDPFSVKIVTDQEVKESAAKNCDTNAMVCVVEVKETRWWQNIFSPPEQGEDFTILQALFSIDMLLLFFAGTCGVGGTLTAIDNLGQIGTSLGYPKTSISTFVSLVSIWNYLGRVFSGFVSEHVLTKYKFPRPLMFTLIMFLSCVGHLLIAFDVQNGIYFASVIIGFCFGAQWPLVFAIISELFGLKYYSTLMNFGGVASPIGLYFLNVRVAGHLYDKEAKRQLIEKGVKRKLGQELNCVGASCFRLSFIIITAATLFGAIISLILVARTNKFYKGDIYKRYRSEQVEVEGATAEMTVVQNDGKRGKEEAKATVM* 596
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Mtr1g4243 595 PANTHER UNCHARACTERIZED NODULIN-LIKE PROTEIN 9 590 - -
Mtr1g4243 595 Pfam Nodulin-like 25 270 IPR010658 -
Mtr1g4243 595 PANTHER MFS TRANSPORTER 9 590 - -
Mtr1g4243 595 CDD MFS_Mch1p_like 24 540 - -
Mtr1g4243 595 Gene3D MFS general substrate transporter like domains 339 555 IPR036259 -
Mtr1g4243 595 SUPERFAMILY MFS general substrate transporter 25 552 IPR036259 -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Mtr1g4243 Mtr-Chr1 54084889 54087017 Dispersed/Tandem
       

Functional genes information


Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Mtr1g4243 15 565 Nodulin-like Gene Family AT2G39210 68.165 0.0 774
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Mtr1g4243 - - gmx:100808975 897.501
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Mtr1g4243 1 54084889 54087017 Mtr1g4243 1 54084889 54087017 ECH