Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Mepo5g03667 ATGGGCATGGAAAAAATAATGGTAGAAAGTTCTACCAAGATTGCTTTTATTCTCTTGGTTACTTTCGCCATTACTATTCCATGCCTTGAGGCTGCACATGTTTTATCTCCTGCTGAATTTGATGATATTCTCAAAGCTCGAGCTGAAGAAGCCCGTAAACTTGCTCTTGATACATATGTTCCAATTCCTAAAGCAGTTGTTCATGAACTTAATATCGCTGTTCACATGTCAATGGAAGCAGTAGAAAACAACACAAGAAGGGACTTGAGGCAAAAAAATAAAAAACATGGAGGACCATGTGAAGCAACCAACCCAATTGATAGTTGTTGGAGGTGCAAAGCAGATTGGGCTGCAAATAGATTTCAATTAGCTAAGTGTAGTAAGGGCTTTGGAAGAAAGACCACTGGTGGGCTTGGAGGTCCAATCTATGTGGTCACTGATGAGTCTGATAATGACATGGTAAACCCTAAACCTGGAACCCTTAGATTTGGTGCTGTCCAAAAGGGACCATTATGGATCACTTTTGCACGTAGCATGGTCATTAGATTGAAACAAGAATTAATGGTTTCTTCTGACAAAACAATTGATGGTCGTGGAGCTAATGTTCAAATTAGGGATGGTGCTGGAATTACAATGCAATTTGTTAATAATGTTATCATTCATGGACTTCATATTCAAGATATTAAAGCTAAACCAGGTGGTTTGATTAGGGATTCTTTTGACCATGTTGGGCAAAGAACAAGAAGTGATGGTGATGCTATCTCTATTTATGGATCTTCTAACATTTGGATTGATCATCTTTCACTCTCTGAATGTGAGGATGGTCTTGTTGATGTTATCCAAGGTTCTACTGGTATCACAATCTCAAATTGTCACATGACAAAACATAATGATGTTATGTTATTTGGAGCTAGTGATACATACACTGATGACAAGCTTATGCAAATAACAGTAGCATTCAACCACTTTGGACAAGGATTGATTCAAAGAATGCCAAGGTGCAGATATGGTTTTGTTCATGTTTTGAACAATGACTATACTCATTGGATAATGTATGCAATTGGTGGTAGCTCATCACCAACTATTCTTAGCCAAGGAAATCGTTTCATTGCTCCAAACAATGGTGCTGCAAAGGAAGTCACACATAGAGATTATGCTCCACCTAATGTATGGAAGAATTGGCAATGGAGTTCAGAATTGGACGTATTCATGAATGGTGCTAAATTTGTTCCATCTGGTCCACCTATTAATAAGAAACCATTCAAAAAAGCTTATATGATGAAACCAAGAGATGGATCTCATGCTAGTAGACTAACAAGGCATGCTGGTGCCCTAAATTGTGTAGTAGGAAGGCCTTGTTAG 1362 0.3825 MGMEKIMVESSTKIAFILLVTFAITIPCLEAAHVLSPAEFDDILKARAEEARKLALDTYVPIPKAVVHELNIAVHMSMEAVENNTRRDLRQKNKKHGGPCEATNPIDSCWRCKADWAANRFQLAKCSKGFGRKTTGGLGGPIYVVTDESDNDMVNPKPGTLRFGAVQKGPLWITFARSMVIRLKQELMVSSDKTIDGRGANVQIRDGAGITMQFVNNVIIHGLHIQDIKAKPGGLIRDSFDHVGQRTRSDGDAISIYGSSNIWIDHLSLSECEDGLVDVIQGSTGITISNCHMTKHNDVMLFGASDTYTDDKLMQITVAFNHFGQGLIQRMPRCRYGFVHVLNNDYTHWIMYAIGGSSSPTILSQGNRFIAPNNGAAKEVTHRDYAPPNVWKNWQWSSELDVFMNGAKFVPSGPPINKKPFKKAYMMKPRDGSHASRLTRHAGALNCVVGRPC 453
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Mepo5g03667 453 SUPERFAMILY Pectin lyase-like 104 444 IPR011050 -
Mepo5g03667 453 Gene3D - 103 446 IPR012334 -
Mepo5g03667 453 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 394 418 IPR018082 -
Mepo5g03667 453 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 352 371 IPR018082 -
Mepo5g03667 453 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 250 271 IPR018082 -
Mepo5g03667 453 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 330 349 IPR018082 -
Mepo5g03667 453 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 424 447 IPR018082 -
Mepo5g03667 453 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 126 143 IPR018082 -
Mepo5g03667 453 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 150 175 IPR018082 -
Mepo5g03667 453 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 186 202 IPR018082 -
Mepo5g03667 453 SMART amb_all 178 375 IPR002022 -
Mepo5g03667 453 Pfam Pectate lyase, N terminus 38 89 IPR007524 GO:0030570
Mepo5g03667 453 PANTHER PECTATE LYASE 18-RELATED 52 451 IPR045032 GO:0030570
Mepo5g03667 453 Pfam Pectate lyase 184 369 IPR002022 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Mepo5g03667 Mepo-Chr5 45711082 45713761 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Mepo5g03667 18 453 Polysaccharide Lyase AT5G15110 54.915 5.07e-180 509
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Mepo5g03667 K01728 - gmx:100810615 702.205