Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Mal6g4064 ATGGCACCTTATACTTTCACTTCCAACTCCAAATCACAACCAAAAAAACTCACTCTTCTCCTCAACACATCCTTCCTCTTCATCTTATTTTTTTCCCTCAAACTTTATATCAATCCTTCAAATTCTAATTCTCATTTTCATCGTGTTTCCTCAAAACTCTTCAATCATGCTAGAATCCTCACTAGTGACATCATAGTTGATTCATGCTCAGAACTTCACAAGTACTCAAATTACACCTCTAAGTGCATTTATGTCAAAACACATTCTGATTGTAGATCCAAAGGTTACATAAACTATCTTCAAATCTTTTATTGCAACCTTGGAAACTCACCAATTCTTGGTCACACACTACTTGTGTTATGGCTTGTAGTTTTGTTCTATCTTTTAGCAGACACGGCTTCAAATTACTTTTGCACCTCCCTAGAAGGTTTGTCTAACATCTTAAGACTATCTCCAACCATAGCTGGTGTAACATTACTCTCTCTAGGTAATGGTGCTCCTGATTTCTTTGCTAGTGTAGTTTCTTTCACAAGTTCTAATAATGGTGCAGTTGGTTTAAATAGCATTTTGGGGGGTGCATTTTTTGTCTCCACGGCTGTTTTAGGCATCATAAGTTTTATAGTTAGTTCAAATGAAGTTTCAGTTGATAAAGCTAGTTTCATTAGAGATGTCATTTTCTTCCTTTTCTCTTTGTTCATTCTTCTCATCATCATTTCCATTGGGAAAATTAGTCTTTTTGGTTCAATTTGCTATCTTTCTATCTATTTTCTTTATGTTTGCGCCGTCTCGGCCACACATTTCATCTATGAAGTTGAAAGAAAAGAAGTTGAATCTTCATCATCTTGTGATGATTTAGTTGAATCCGGCATACCATTATTAGGTTATGTTGACGATGATAGTGATATTGATAATGATTCTTTTCAAAAACCGATTTTACAAAATGAAGTTGGTATTGGTATTGAAGAAAAAGAGAAAAAGAGAGAAATTTTTAGTACCTATTACTTGTGGAAGTTTCTAGAAGTACTTGAATTACCACTTTGTTTACCAAGAAAACTCACTATACCAGTTGTGAGTGAGGAAAACTGGTCGAAACCCTACGCAGTTATATCAGTTACCTTAGCACCGATTTTATTCGCAATTCTTTGCAATACACAAATGGAAAATGTGGATTCAAAGAGTAGTTTAGTTGCATATTTAACATCATCATTAATTGGAATTGTGTTTGGAAACATGGCATGTGTGACAACAAAGAGTACAAGACCACCAAGAAGGTGTTTGTTTCCTTGGCTAGCTGGTGGATTTTCAATGAGTGTGACATGGACTTATATAATTGCTGAGGAACTTGTTTCACTTTTGATATCAATTGGATATGTAATTGGTGTTAGTCCTTCAATTTTAGGGTTAACTGTCCTAGCTTGGGGAAATTCTCTAGGTGATTTGATTGCAAATGGTGCTATGGCTAAAAATGGTGGTGTTGATGGTGCACAAATTGCTGTTTCAGGTTGTTATGCTGGTCCTATGTTTAATATTTTGATGGGTTTAGGGTTACCTCTTGTTCTTTCAGCTTGGGGTGAATACCCTAATTCTTATGTTGTGCCTAAGGATAGTTCACTTTTAGGGACAATTTTGTTTTTGATGGTAGGGGTACTTTGGTCACTTGTTGTATTGGTTAAGAAGAATATGAGGCTTGATAAGTTTTTAGGGGCTGGTCTTTTGACCATTTACCTTTGTTTTTTGTTTTTAAGGTTAGCCATGGCAATTGGTGTTCTTAATTAG 1776 0.3536 MAPYTFTSNSKSQPKKLTLLLNTSFLFILFFSLKLYINPSNSNSHFHRVSSKLFNHARILTSDIIVDSCSELHKYSNYTSKCIYVKTHSDCRSKGYINYLQIFYCNLGNSPILGHTLLVLWLVVLFYLLADTASNYFCTSLEGLSNILRLSPTIAGVTLLSLGNGAPDFFASVVSFTSSNNGAVGLNSILGGAFFVSTAVLGIISFIVSSNEVSVDKASFIRDVIFFLFSLFILLIIISIGKISLFGSICYLSIYFLYVCAVSATHFIYEVERKEVESSSSCDDLVESGIPLLGYVDDDSDIDNDSFQKPILQNEVGIGIEEKEKKREIFSTYYLWKFLEVLELPLCLPRKLTIPVVSEENWSKPYAVISVTLAPILFAILCNTQMENVDSKSSLVAYLTSSLIGIVFGNMACVTTKSTRPPRRCLFPWLAGGFSMSVTWTYIIAEELVSLLISIGYVIGVSPSILGLTVLAWGNSLGDLIANGAMAKNGGVDGAQIAVSGCYAGPMFNILMGLGLPLVLSAWGEYPNSYVVPKDSSLLGTILFLMVGVLWSLVVLVKKNMRLDKFLGAGLLTIYLCFLFLRLAMAIGVLN* 592
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Mal6g4064 591 Gene3D - 150 278 IPR044880 -
Mal6g4064 591 Gene3D - 364 584 IPR044880 -
Mal6g4064 591 PANTHER CATION/CALCIUM EXCHANGER 1 8 591 - -
Mal6g4064 591 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 119 261 IPR004837 GO:0016021|GO:0055085
Mal6g4064 591 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 430 583 IPR004837 GO:0016021|GO:0055085
Mal6g4064 591 PANTHER NA+/CA2+ K+ INDEPENDENT EXCHANGER 8 591 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Mal6g4064 Mal-Chr6 116143190 116144965 Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Mal6g4064 67 591 Antiporters AT5G17860 52.273 5.96e-178 512