Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Mal6g1895 ATGGTTATCTATCATGTTTTAATATTTATTGGTTTGACAAACAGAATGCTAATTGGCGGTAATATAGGAAGAAGGAATTTGGCGGGGCTGGGTTCATGCATGGCTACAAACCCCATTGACAGGTGTTGGAGGTGTGATCCTAAATGGGCAATCAACCGCAAGAAGCTTGCAGATTGTGTGCAAGGTTTTGGAAGGATGACTACTGGTGGAAGAGACGGTCCTATCTATGTGGTAACTGACCCCTCAGATAGTGACATGGTGAATCCACGTCCTGGTACCCTTAGGTATGCAGTTACAAGAAATGGACCTTTGTGGATCACCTTCGCTCGTAGCATGAAAATTAGGCTCAGCCAGGAACTCATAATGACGAGTAACAAGACCATTGATGGACGAGGAGCTAGTGTTGTCATTGCCAAGGGTGCTGGTATTACTCTCCAGTTCATCAGCAATGTGATCATCCATGGGATCAAAATTTTTGACATTCAGATTGGAAGTGGTGGCCTGATTAGAGATGATGAGGACCATTTTGGTCGAAGGACTATGAGTGATGGTGATGGAATTTCAATTTTTGGCTCCAGCAATATTTGGATTGACCATGTTTCCATGAGAAACTGCAGAGATGGACTCATTGATGCCATTATGGGATCCACTGCTATTACCATCTCCAACAACCATTTCACAGATCACAACAAGGTGATGTTGTTTGGTGCAAGTGATAGCTTTGACGGTGATAAGAAAATGCAGATCACAGTTGCATTCAACCACTTTGGTAAGAGATTAATCCAAAGGATGCCAAGGTGCAGATTTGGTTTTATCCATGTGCTTAACAATGACTACACTCACTGGGAAATGTATGCCATTGGTGGCAGCATGAATCCTACCATTATTAGTGAGGGTAACAAATTCATAGCCCCTAACAATGGCCATGCTAAAGAGATAACAAAGAGGGAGTACGTAACAGAGTCAGTATGGAAAAACTGGCAATGGAGATCAATCAACGATGTGTACTTGAACGGAGCTTTTTTCAGACAAAGTGGAGCTGAGCTGACTAACAGACCATTCTCAAGCAAGGACATGATCAAAGCTAAGCCCGGAACTGATGTGGGAAGGCTTACTCGTTATTCTGGCCGACTTAAATGCATAGTGGGGAGGCCTTGTTAG 1161 0.4332 MVIYHVLIFIGLTNRMLIGGNIGRRNLAGLGSCMATNPIDRCWRCDPKWAINRKKLADCVQGFGRMTTGGRDGPIYVVTDPSDSDMVNPRPGTLRYAVTRNGPLWITFARSMKIRLSQELIMTSNKTIDGRGASVVIAKGAGITLQFISNVIIHGIKIFDIQIGSGGLIRDDEDHFGRRTMSDGDGISIFGSSNIWIDHVSMRNCRDGLIDAIMGSTAITISNNHFTDHNKVMLFGASDSFDGDKKMQITVAFNHFGKRLIQRMPRCRFGFIHVLNNDYTHWEMYAIGGSMNPTIISEGNKFIAPNNGHAKEITKREYVTESVWKNWQWRSINDVYLNGAFFRQSGAELTNRPFSSKDMIKAKPGTDVGRLTRYSGRLKCIVGRPC* 387
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Mal6g1895 386 Gene3D - 36 379 IPR012334 -
Mal6g1895 386 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 183 204 IPR018082 -
Mal6g1895 386 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 357 380 IPR018082 -
Mal6g1895 386 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 263 282 IPR018082 -
Mal6g1895 386 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 119 135 IPR018082 -
Mal6g1895 386 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 285 304 IPR018082 -
Mal6g1895 386 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 59 76 IPR018082 -
Mal6g1895 386 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 83 108 IPR018082 -
Mal6g1895 386 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 327 351 IPR018082 -
Mal6g1895 386 SMART amb_all 111 308 IPR002022 -
Mal6g1895 386 Pfam Pectate lyase 120 302 IPR002022 -
Mal6g1895 386 SUPERFAMILY Pectin lyase-like 37 376 IPR011050 -
Mal6g1895 386 PANTHER PECTATE LYASE 18-RELATED 21 386 IPR045032 GO:0030570
Mal6g1895 386 PANTHER PECTATE LYASE 21 386 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Mal6g1895 Mal-Chr6 40023743 40025253 Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Mal6g1895 4 386 Polysaccharide Lyase AT1G14420 64.213 0.0 511
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Mal6g1895 K01728 - gmx:100796307 619.772