Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Mal2g4489 ATGGCTTTCTTTGGTAGAGTTGGGAGTTTATTAAGGAATGCAGCAAATACGAAGATCACTTCTGAGTTGAAGTCACGTTCTTTCCCATCTGTTTTCCAAGCCATACGGTGCTTCTCGAGTACTCGGTCTACCAAGCTGTTTGTAGGAGGTATTTCATATAGTACTGATGAACAAAGTTTGAGGGATGTGTTTTCAAAATATGGCGAAGTTGTTGATGTAAGGATAATTATGGATCGTGAAACTGGTAGTTCCAAAGGATATGGCTTTGTTACTTACAGTACTGTTGAGGAGGCATCAATTGCCATTCAGGCCTTGGATGGACAAGATCTGCAAGGTCGCCGGGTTGGTGTAAATTATTCGAAGGAAAGACCCCGTGGATATGGTGGTGGTTTTGATGGACCTTATGGTGGTGGAGGTGGTGGTGGATATTCAGGTGGTTATGGTAACTCTTCATACGGTGCTGCTTCGAACGGTGGTGGGTATAGTGAATATGGGGGTAATGCTGCTGGAGGTTATGGCGGAGGTGGTTATGGAAGCAATTACAATGATGGAACTACTAGCGGAGGTTATGGTGGCAACAATGTGAATTATGGTGCTGCTGTGGGTGGTGGTGAAAGCAATACTGTTAACTATGGTAGTGCTCCTGGTGTTGGTGGTTATGGAGGAAACAATCCAAATTATGGTGCTGCTGTCGGCGTTGAAGGCAATAATATTAACTATGGTAATGCTCCTGCTGCCGGTGGTTATGGTGGTAACAATTTGAGTTATGGTGCTGCTGATACTGCTAACTATGGTAGTACTCCTGGTGTTGGTGGTTATGGCGGTGGTAGCACTGCGAATTATGGTGCTGCTGTAGGTGGTGGAGAAAGCAATTATGTTAACCACGGTAGAGCTCCTGTCGATGGTGGCTATGGCGGTGCTAACAATGCAAATTATGGTGCTGTTGTAGGTGCTAGAGAAAGCAATTCTGTTAACTATGGTAGTGGTCCCGGTGTTGGTGGTTATGGTGGTGGTAACAGTGCCAATTACGGTGGTGGAGAAAGCAATTCTGCTAACTATGGTAGTGCTCCTGGTGTTGGTGGTTATGGCGGTGGTAACAATACCAGTTATGGTGCTGCTGTGGGAGACAGAGAAAGCAATTCTACTAACTATCGTAGTGCTCCTGGGGTTGGTGGTTATGGCGGTGGTAACAATGCCAGTTATGGTGCTGCTGTGGGAGGCGGAGAAAGCAATTCTGTTAACTACGGTACTGCTCCTGTTGATGGTGGTTATGGTGCTGCTACTGGATTTGGCAAGAGTGATAATTATTATAGTACTCATGGTGGTGGTCCCAGCAATGGTTTCTCCGGTAATCAATACCCTGGAAGTGCAATGGGGTATGGCAGTAGCGGTTCAGCTCCCGGGAGCAGCTTTGCTGGTGAATATGATAGAACTGGAGGAATTGGATACGGCGAAAGTGGTCAAGAAAATTTCAAGAATGATGATCATGAAGTTGGTGCTTTTGCTAAACGGGCTTGA 1518 0.4598 MAFFGRVGSLLRNAANTKITSELKSRSFPSVFQAIRCFSSTRSTKLFVGGISYSTDEQSLRDVFSKYGEVVDVRIIMDRETGSSKGYGFVTYSTVEEASIAIQALDGQDLQGRRVGVNYSKERPRGYGGGFDGPYGGGGGGGYSGGYGNSSYGAASNGGGYSEYGGNAAGGYGGGGYGSNYNDGTTSGGYGGNNVNYGAAVGGGESNTVNYGSAPGVGGYGGNNPNYGAAVGVEGNNINYGNAPAAGGYGGNNLSYGAADTANYGSTPGVGGYGGGSTANYGAAVGGGESNYVNHGRAPVDGGYGGANNANYGAVVGARESNSVNYGSGPGVGGYGGGNSANYGGGESNSANYGSAPGVGGYGGGNNTSYGAAVGDRESNSTNYRSAPGVGGYGGGNNASYGAAVGGGESNSVNYGTAPVDGGYGAATGFGKSDNYYSTHGGGPSNGFSGNQYPGSAMGYGSSGSAPGSSFAGEYDRTGGIGYGESGQENFKNDDHEVGAFAKRA* 506
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Mal2g4489 505 MobiDBLite consensus disorder prediction 448 469 - -
Mal2g4489 505 Gene3D - 38 151 IPR012677 -
Mal2g4489 505 PANTHER GLYCINE-RICH RNA-BINDING PROTEIN 3, MITOCHONDRIAL 1 164 - -
Mal2g4489 505 SUPERFAMILY RNA-binding domain, RBD 41 147 IPR035979 GO:0003676
Mal2g4489 505 Pfam RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain) 46 115 IPR000504 GO:0003723
Mal2g4489 505 ProSiteProfiles Eukaryotic RNA Recognition Motif (RRM) profile. 44 122 IPR000504 GO:0003723
Mal2g4489 505 SMART rrm2_1 45 118 IPR003954 GO:0003676
Mal2g4489 505 SMART rrm1_1 45 118 IPR000504 GO:0003723
Mal2g4489 505 PANTHER HETEROGENEOUS NUCLEAR RIBONUCLEOPROTEIN 87F-RELATED 1 164 - -
Mal2g4489 505 MobiDBLite consensus disorder prediction 448 505 - -
Mal2g4489 505 MobiDBLite consensus disorder prediction 489 505 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Mal2g4489 Mal-Chr2 91264503 91268632 Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Mal2g4489 33 153 Eukaryotic Initiation Factors Gene Family AT1G49760 30.075 2.36e-08 54.7
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Mal2g4489 K12741 - ccaj:109815980 198.749
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Mal2g4489 2 91264503 91268632 Mal2g4489 2 91264503 91268632 ECH