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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Lja4g3809 ATGAAGGAGTCATTCGTGACATTGATGAGTCAAGGTGAAAAGTTTGAAGGTGGTGTGTTAAAAGTGGAACCTATTGTGGAAAGTATTGTAGAGGGTGGAGTTTATCAGTTATCGAACTTCCTTATTATTCACAATACTGGTGCACAACGTTTTACAAGTCATGGATACAGGCTGATTTTGGATAGTAGAAGCTCAATCGTTCCAGCTGAAGATGATCGAATTCCTGCGCATGGGTGGTCTTTCTTTCACATTGAGAATGTGATGATAGTTGGAGATAAATTTGGTTATTTAGTGGATGTCATTGGAGTGCTATCAGCTGCATCAAAGGGGAAACTTTTGATTAAAAATAACAGAGTTTACAAGATGATGGTTATTGAGTTATTTGATTTAAGTGGCAAGTGTAATTGTGTGGTGATTGGGGATGCTGTTGATAAGACTGCTGAATACTTGAGTTTGGATTGGTTAAATAGGCCTATTATTGGTTTGCGGTATGTTGATGTAAGAAAGGTTGATGGAAAAACTGTGATTAATTGTATCCCTAATTTCTCTAAGATTTACATCAATCATAATTACGAAGAAGATTGGGTAATTGGTGATAGATTTGCTGGTGTTAAATGCGCCGTTCCGGTTGATTGTATTGCAAGATCCGATTCTATTGGGGATATTAAACATGACATGCTTAATTCTCATGCAAAGACATGTATTGCTGAATTATTAAACATTGAAGAGCGAGGTGTTGCAGTTGTTAAAGCTTGTATTAATGCCTTTATCAATGACTGTCCATGGTTCTATAATTCTTGTTGGTGTCACATGGAAGTTGAAGTTGATAATGATGTTTTTAGATGTAACCGTTGCTTTCGAGATATTGCTAAAACAATTCGCAGATATCGGATTAAGCTGGAGGTTTTTGATGGCTATGATAACACAATATTTATGCTTAATGATTCTCAAGTAAATCAAATTGTGGGAATCCAATGTGAAGAATTGCTTAGTTTGACTCAGGATCAACCACTTGGTAGGTATCCGATTCAACTTGTGGAAACAATGCTTAGCAAAGAATTTCTTTTCAAAGTTGTCACTGGTGGTGGTACTACCTATTATGGTGAAAAGGTGTTCGAGGTCATTAGGATTTGTGAAGATGTTGGTGTCATATCTTTGTTCAATTTAGGTGGTTCACTTGTCACACCCTTGAAGGCTAAGTTCACCCCGCCTTTTACGAAGCTTGAGGACATTTCTGATGGTGCTCTTAGAAAACACACAGAGGGACCAATGGTGGAGGGAAGCATACAAGATGCTGATGTTAGTAATGTTGGGGCATTGCATTTGTCAAGTTATGGTTCTGGTTCCAGTCATACATCCATTAATCAAGTTATTCTTAATCGACCAATCAAAAGGAAATTGTTTCAAGAATTTGAAGATTCAGCTGAAGAATGTGACCAGCTACTTCAACCTGTTCAAGAGCGTGTGCGCTTTAAAATGTTCCGGAAGCATCAATTTTATTCGAGAGGAGAATGTAGTAAAACTAATTGTGCTGAGTCTGATGTTAAAAGTGGTGATCAAGTATCTGAAGATTTTGATGATGAAGATTCTAAGAATTGCGATGTTAATTTAAAGGAAGAGGAAATAGACATGAATTTGAAGTCTGGTTTTTCTGTTGTTGCTGAACCTGTTAACAAAGTTTGTGATGACTGTGAAATTCCAACAATGCTGAATGTTGGTGAAGGTTTGCAAAGTTTAGGTAAGAACTTGAGGCATATTGAAATTGTTGATTTGACGCTCTTGGATGATGAAGGGGAAGATATCTGTGTAGAAGATGTTTGTATGAAGGAATGCATTGATCTTTCTGAGTCAGAAATGAGTGATAACTTTGTTATTTTAGTTGAAGAGGAGCATGAAGATGGGGAGTGCATTGAGGTTGTTTATTTGTCTGACTAA 1935 0.3695 MKESFVTLMSQGEKFEGGVLKVEPIVESIVEGGVYQLSNFLIIHNTGAQRFTSHGYRLILDSRSSIVPAEDDRIPAHGWSFFHIENVMIVGDKFGYLVDVIGVLSAASKGKLLIKNNRVYKMMVIELFDLSGKCNCVVIGDAVDKTAEYLSLDWLNRPIIGLRYVDVRKVDGKTVINCIPNFSKIYINHNYEEDWVIGDRFAGVKCAVPVDCIARSDSIGDIKHDMLNSHAKTCIAELLNIEERGVAVVKACINAFINDCPWFYNSCWCHMEVEVDNDVFRCNRCFRDIAKTIRRYRIKLEVFDGYDNTIFMLNDSQVNQIVGIQCEELLSLTQDQPLGRYPIQLVETMLSKEFLFKVVTGGGTTYYGEKVFEVIRICEDVGVISLFNLGGSLVTPLKAKFTPPFTKLEDISDGALRKHTEGPMVEGSIQDADVSNVGALHLSSYGSGSSHTSINQVILNRPIKRKLFQEFEDSAEECDQLLQPVQERVRFKMFRKHQFYSRGECSKTNCAESDVKSGDQVSEDFDDEDSKNCDVNLKEEEIDMNLKSGFSVVAEPVNKVCDDCEIPTMLNVGEGLQSLGKNLRHIEIVDLTLLDDEGEDICVEDVCMKECIDLSESEMSDNFVILVEEEHEDGECIEVVYLSD* 645
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Lja4g3809 644 Gene3D - 73 203 IPR012340 -
Lja4g3809 644 SUPERFAMILY Nucleic acid-binding proteins 244 371 IPR012340 -
Lja4g3809 644 Pfam Replication factor-A C terminal domain 249 359 IPR013955 -
Lja4g3809 644 Gene3D - 215 377 IPR012340 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Lja4g3809 Lja-Chr4 70573297 70578044 Dispersed/Transposed
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Lja4g3809 27 329 Core DNA Replication Machinery Family AT4G19130 24.451 2.56e-08 55.5
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Lja4g3809 - - lja:Lj4g3v0472980.3 1292.33