Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Lele52g1496 ATGGAAAAGATTTGCTATAGAAGAAGCAAAAACAAAACGGTGCGTTTAAAGGAATTGGCATCAGCAGCTTCCTTCCGATATTCTTTCAGTCCGAGCTTCTCGCCGACGGAACGAACTGCGGGCTGCTTTTCAGGCGAACTCCTGCAATCCGGCACTCATGTTCATTTCCTCTTTTTCACAGCCTCTACTGCTTCAAAGTTGGAAGTAATACTCCAGACTTGTTGCTCCCTTAAAAAGAAAGTTGGAACACCTTTCAATGGACGCATGAACAAGGAAACTAATATCAGAGAATTGGAGCAAATGGGAACATCAGCAATGAACAAGGAAAAATTGAATGATGGTAAATGCAGTAATCGTAGTATGAGTGAACGGTGGAAGCAAAAGGAGTTATTCCTTCTGATAGCTTATGCATTTGTTTTCTATGCCGTCATCATCCGCCGGTCTCTTCAACTTTCTAATGATTACTACCAACGGCTCTATGGCTTACGTCCAGGATGGCTCACACCTCATCCCCTCAATGATGTCTCAGATGCCCAATGGAGGAACTTTCGAGGAAATATACCTGTTCTTACTATTGTCTTTGGAATTTTCACTCTACTGGCGAAATTGATGAGATCATTCTTTAGTTTAGAAGTGAGGGGAATGTCCACTGTCTGGCTTTTGTTTTCTTTGATATACCTCTCATATCTGCATGGAGCGTGCATCGTTTTTTTGCTATCAATAGCCACAGTTAACTTTCTTCTGGTAAAGATATTTGCGCGGAAGAAGTATTTTACCCTCATAATTTGGAGTTATAGCTTATTTTTTCTTCTTTGCAATCGTGTTTATGAAGGATATCCATTCTCTTCATTTGGGAAACAATTGGCATTTTTGGACAACTACCGAGGCACTTTTAGATGGCACATTTGCTTCAACTTTGTTGTTCTGCGTATGATAAGCTTTGGATTGGATTATCATGGGTTAAATCAAGAGTCTCATTTTGATCAGGAGAAGCATTATCAACGTTGCCATCTTTGTAAATCAGGAAAACCTTGCTACCAAATTTTGCAGGAGAGAAGTTTACCGAGTGACAAGTTCAGATATACCACATACCTTTGTTATCTGCTATATGCGCCACTTTACATTGCTGGTCCAATAGTTAGCTTCAATGCTTTTGCCTCTCAGCTAGATGTTCCCCGGGGTTTAAACAGAAATGTGATATCCTATGGTTTCCGCTGGGTATTGAGTCTTCTTCTTATGGAGTTAATGACACATATATTTTATTATAATGCCTTTGCAATCAGTGGTTTGTGGAAGCACTTGTCTCCTATGGATGTATTCATAATTGGATATGGGGTCTTAAACTTCATGTGGCTAAAATTCTTACTGATCTGGCGCTATTTCCGTTTCTGGTCACTAATAAATGGCATTGAGGTTCCAGAGAATATGCCAAAGTGTATCAATAATTGCCACAGCTTGGAGGGCTTTTGGAAAAATTGGCATGCTTCCTTTAACAAGTGGCTTGTGAGGTACATGTACATTCCTCTTGGGGGGTCTCAAAAGAAGCTACTGAATGTATGGGTCATATTCACATTTGTTGCCATCTGGCATGATGTGGAGTGGAAGCTTCTTTCATGGGCTTGGTTGACATGTTTATTCTTTATCCCTGAGTTGGTGTTGAAGTCAGCAGCAAAGGCATTTCAGGCTGAAAGTGGTTTTGGGGAATATTTATTTCGTGAGCTCAGTGCTGTTGCTGGTGCCGTCACAATTACTTGTCTCATGGTGGCAAATCTGGTTGGCTTTGTTATTGGACCTGGAGGCATCAACTGGTTGCTTTCTTCTTTCATTCAAAAAGAAGGACTGCCAGTTCTTGGTGGCTTACTTCTGTCGTTTTATGTAGGAACGAAGCTTATGTTCCACATAGCTGAAGCAAAGCAAAGGTCGCCTTGA 1929 0.409 MEKICYRRSKNKTVRLKELASAASFRYSFSPSFSPTERTAGCFSGELLQSGTHVHFLFFTASTASKLEVILQTCCSLKKKVGTPFNGRMNKETNIRELEQMGTSAMNKEKLNDGKCSNRSMSERWKQKELFLLIAYAFVFYAVIIRRSLQLSNDYYQRLYGLRPGWLTPHPLNDVSDAQWRNFRGNIPVLTIVFGIFTLLAKLMRSFFSLEVRGMSTVWLLFSLIYLSYLHGACIVFLLSIATVNFLLVKIFARKKYFTLIIWSYSLFFLLCNRVYEGYPFSSFGKQLAFLDNYRGTFRWHICFNFVVLRMISFGLDYHGLNQESHFDQEKHYQRCHLCKSGKPCYQILQERSLPSDKFRYTTYLCYLLYAPLYIAGPIVSFNAFASQLDVPRGLNRNVISYGFRWVLSLLLMELMTHIFYYNAFAISGLWKHLSPMDVFIIGYGVLNFMWLKFLLIWRYFRFWSLINGIEVPENMPKCINNCHSLEGFWKNWHASFNKWLVRYMYIPLGGSQKKLLNVWVIFTFVAIWHDVEWKLLSWAWLTCLFFIPELVLKSAAKAFQAESGFGEYLFRELSAVAGAVTITCLMVANLVGFVIGPGGINWLLSSFIQKEGLPVLGGLLLSFYVGTKLMFHIAEAKQRSP 642
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Lele52g1496 642 PANTHER ACYLTRANSFERASE 126 639 - -
Lele52g1496 642 Pfam MBOAT, membrane-bound O-acyltransferase family 306 557 IPR004299 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Lele52g1496 Lele-ChrLele52 18949802 18957846 Dispersed/Wgd
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Lele49g1292 49 8734442 8741588 Lele52g1496 52 18949802 18957846 hybridization
Lele50g1538 50 20578551 20590606 Lele52g1496 52 18949802 18957846 hybridization