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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Lele40g0113 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2180
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Lele40g0113 2180 ProSiteProfiles Trp-Asp (WD) repeats circular profile. 2065 2100 - -
Lele40g0113 2180 Gene3D - 677 934 IPR015943 GO:0005515
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Lele40g0113 2180 SMART WD40_4 1932 1972 IPR001680 GO:0005515
Lele40g0113 2180 SMART WD40_4 758 803 IPR001680 GO:0005515
Lele40g0113 2180 SMART WD40_4 2109 2155 IPR001680 GO:0005515
Lele40g0113 2180 SMART WD40_4 235 286 IPR001680 GO:0005515
Lele40g0113 2180 SMART WD40_4 1832 1869 IPR001680 GO:0005515
Lele40g0113 2180 SMART WD40_4 470 512 IPR001680 GO:0005515
Lele40g0113 2180 SMART WD40_4 1977 2023 IPR001680 GO:0005515
Lele40g0113 2180 SMART WD40_4 1886 1921 IPR001680 GO:0005515
Lele40g0113 2180 SMART WD40_4 2058 2097 IPR001680 GO:0005515
Lele40g0113 2180 SMART WD40_4 688 746 IPR001680 GO:0005515
Lele40g0113 2180 Pfam RAVE protein 1 C terminal 813 1288 IPR022033 -
Lele40g0113 2180 Pfam RAVE protein 1 C terminal 1287 1350 IPR022033 -
Lele40g0113 2180 Pfam WD domain, G-beta repeat 2065 2097 IPR001680 GO:0005515
Lele40g0113 2180 FunFam Transducin family protein / WD-40 repeat family protein 1838 2115 - -
Lele40g0113 2180 SUPERFAMILY WD40 repeat-like 34 288 IPR036322 GO:0005515
Lele40g0113 2180 Gene3D - 1837 2142 IPR015943 GO:0005515
Lele40g0113 2180 PANTHER RABCONNECTIN-RELATED 30 1287 - -
Lele40g0113 2180 ProSiteProfiles Trp-Asp (WD) repeats profile. 2065 2106 IPR001680 GO:0005515
Lele40g0113 2180 SUPERFAMILY WD40 repeat-like 1845 2161 IPR036322 GO:0005515
Lele40g0113 2180 Gene3D - 33 365 IPR015943 GO:0005515
Lele40g0113 2180 SUPERFAMILY Quinoprotein alcohol dehydrogenase-like 472 806 IPR011047 -
Lele40g0113 2180 SUPERFAMILY WD40 repeat-like 726 892 IPR036322 GO:0005515
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Lele40g0113 Lele-ChrLele40 805356 818825 Wgd
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Lele40g0113 40 805356 818825 Lele40g0113 40 805356 818825 ECH
Lele37g0108 37 862039 875256 Lele40g0113 40 805356 818825 hybridization
Lele38g0111 38 849834 862772 Lele40g0113 40 805356 818825 hybridization