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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Lele38g0111 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6111 0.4242 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2036
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Lele38g0111 2036 Gene3D - 33 365 IPR015943 GO:0005515
Lele38g0111 2036 SUPERFAMILY WD40 repeat-like 83 851 IPR036322 GO:0005515
Lele38g0111 2036 ProSiteProfiles Trp-Asp (WD) repeats circular profile. 1978 2013 - -
Lele38g0111 2036 SUPERFAMILY WD40 repeat-like 1758 2021 IPR036322 GO:0005515
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Lele38g0111 2036 SMART WD40_4 127 171 IPR001680 GO:0005515
Lele38g0111 2036 SMART WD40_4 758 803 IPR001680 GO:0005515
Lele38g0111 2036 SMART WD40_4 1799 1834 IPR001680 GO:0005515
Lele38g0111 2036 SMART WD40_4 470 512 IPR001680 GO:0005515
Lele38g0111 2036 SMART WD40_4 235 286 IPR001680 GO:0005515
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Lele38g0111 2036 SMART WD40_4 1971 2010 IPR001680 GO:0005515
Lele38g0111 2036 PANTHER RABCONNECTIN-RELATED 29 1287 - -
Lele38g0111 2036 Gene3D - 720 908 IPR015943 GO:0005515
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Lele38g0111 2036 Pfam RAVE protein 1 C terminal 1288 1353 IPR022033 -
Lele38g0111 2036 Pfam WD domain, G-beta repeat 1978 2010 IPR001680 GO:0005515
Lele38g0111 2036 Gene3D - 1756 2025 IPR015943 GO:0005515
Lele38g0111 2036 ProSiteProfiles Trp-Asp (WD) repeats profile. 1978 2019 IPR001680 GO:0005515
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Lele38g0111 Lele-ChrLele38 849834 862772 Dispersed/Wgd
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Lele38g0111 38 849834 862772 Lele38g0111 38 849834 862772 ECH
Lele38g0111 38 849834 862772 Lele39g1319 39 21618087 21630541 hybridization
Lele38g0111 38 849834 862772 Lele40g0113 40 805356 818825 hybridization