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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Lele25g1301 ATGATTGAAATTGGCCTTAACTCATCAAGGCTAGCTGTGGAGCCTCATCAGAATAATTTGACTGTAAATAATGCTGAACTTTGTCCTGGATTATTACGCCATGATGGTTATTCTAGCAAATGTGAATACTTAAAGGCGAATCCACAGTGTAATTCTGGAGGAATTTTTGATCACATAAGATTTTTATGTTGTACATGTCAGAATTTTCAAGGGCTGGGCTACCTAATATTGGGTATATGGCTAGCTGCATTGTTCTACCTACTTGGGAACACAGCTGCAGACTTCTTCTGTCCATCTCTGGAGTTTCTCTCAAGGCTCTTGAAATTTCCTCCAACTGTTGCTGGGGTTGTGCTCCTTCCACTTGGAAATGGTGCACCTGATGTGTTTTCCAGTATTGCATCCTTTGTTGGCACAGATACAGGGGAAGTGGGACTTAATAGCGTGTTAGGTGGTGCTTTGTTTGTTACCTGTGTTGTTGTTGGAACTGTTTCTCTTTGTGTGTCCGGTAAAGGAATTCAAATTGATAGAAGATGCTTTATAAGGGATGTTAGCTTCTTTCTGTTCACTCTTTTCTCGCTTTTGCTGATTCTGGTTGTCAGGAAGGTGGGAGTTGGGGCTGCCATCGCTTTCATATCGATTTACATTGTTTATGCATTTTTTGTTGCTGCAAGTGAGATATTTTGGAAACATGCACGAAGGTTGAAATTGGATGCTGTCACACCGATGCTTCATGTCCGTGGAGGTATGTTCGCCCTTGTATCTGAAGAAGAATATTCTGTATATAGCTCTTTTCTTGACATAGACACGGACGATGATCCTCCCCATCTCCCTCCTTCCTTGCCACAGTGGATGTGGTTCTCAAATGTGGCAATCTATTCAAACCAGGCTAATAAAGCTTATATGATGGATGACGAAAGGCCTCCTTGGGGATGGAGTGATGGGAGCAAGGAAACCACCAATTCTACTTTCACTGTAGCAAAACTATTTTTATTAATGGAGATGCCGCTGACAATTCCTAGACGGCTAACAATTCCCTTGGTCCATGAGGAAGTTTGGTCAAAAAAATATGCTGTGGTAAGTGCTTTACTGGCTCCACTTCTCCTGACCATTTTGTGGAACACTCAAGATAATGTGGGTTATCTGAGTGCTATACTTTCCTATTGCATTGGTGGTGTTCTTGGATGCACACTTGGTGTTCTTGCCTATAAATACACTTTACCCGATTATCCACCGCAGAGGTTTTTGATTGCTTGGGTTCTTGGAGGATTTGTCATGAGCATAGTGTGGTTCTACATAATAGCAAATGAGCTTGTTGCTGTATTGGTGTCATTTGGTGTAATTTTAGGAATTAATCCATCTATCCTGGGATTAACTGTATTAGCATGGGGTAATTCAATGGGGGATTTGATGTCAAATGTTGCCTTGGCAATAAATGGAGAAGATGGAGTTCAAATTGCTTTATCTGGATGCTATGCAGGGCCCATGTTCAACACGCTTGTTGGTTTGGGGATCTCGATGCTGCTAGGGGCCCTGTCGGCGAAACCTGAAACTTACTTGGTTCCCAAAGACCGAAGCTTATTTTACACTATGGGATTTCTTATCTCAGCGCTGATCTGGGCCCTTATCGTTGTCCACTACTGTGGGGCTCATACCAGTGGCTGGCTTAGCTTGACATTTGAGAAGTTGAGAGCTGTGATCGAATTGGGCATGGGTTCTACATCTATGAAGATCAAAAGTTCATCTGCTGTATAG 1752 0.4247 MIEIGLNSSRLAVEPHQNNLTVNNAELCPGLLRHDGYSSKCEYLKANPQCNSGGIFDHIRFLCCTCQNFQGLGYLILGIWLAALFYLLGNTAADFFCPSLEFLSRLLKFPPTVAGVVLLPLGNGAPDVFSSIASFVGTDTGEVGLNSVLGGALFVTCVVVGTVSLCVSGKGIQIDRRCFIRDVSFFLFTLFSLLLILVVRKVGVGAAIAFISIYIVYAFFVAASEIFWKHARRLKLDAVTPMLHVRGGMFALVSEEEYSVYSSFLDIDTDDDPPHLPPSLPQWMWFSNVAIYSNQANKAYMMDDERPPWGWSDGSKETTNSTFTVAKLFLLMEMPLTIPRRLTIPLVHEEVWSKKYAVVSALLAPLLLTILWNTQDNVGYLSAILSYCIGGVLGCTLGVLAYKYTLPDYPPQRFLIAWVLGGFVMSIVWFYIIANELVAVLVSFGVILGINPSILGLTVLAWGNSMGDLMSNVALAINGEDGVQIALSGCYAGPMFNTLVGLGISMLLGALSAKPETYLVPKDRSLFYTMGFLISALIWALIVVHYCGAHTSGWLSLTFEKLRAVIELGMGSTSMKIKSSSAV 583
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Lele25g1301 583 Gene3D - 320 561 IPR044880 -
Lele25g1301 583 Gene3D - 109 239 IPR044880 -
Lele25g1301 583 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 419 544 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
Lele25g1301 583 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 79 221 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
Lele25g1301 583 PANTHER NA+/CA2+ K+ INDEPENDENT EXCHANGER 23 549 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Lele25g1301 Lele-ChrLele25 8800559 8802393 Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Lele25g1301 28 544 Antiporters AT5G17850 41.176 2.99e-110 339