Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Lan6g2246 ATGAAGAAAAAAACATTTTCATCCAATCTCTTACTCTTCCTAATACCCTTATTGTTTCAAACCACATTCGAGTTTGGAGACAGAGGAGAGAATATTACAATACACCCAACCCTAGTTTTTGAAAACAACCGCATCAGGAACGCTTACGTGGCACTCCAAGCGTGGAAGCAAGCTATTTTCTCTGATCCTAATAACATAACCCTAGATTGGCTGGGATCTGATGTGTGCAACTATACCGGAGTGTTCTGTGCAACCGCACTTCATAACCGTAAGGTAAGGACTGTTGCTGGCATTGACCTCAACCATGGTGATATTGCTGGTTATTTACCGGAGGAGCTAGGGCTTCTCTCCGATCTTGCGCTTTTCCATATTAATAGTAACCGCTTCTGTGGAAAGGTTCCTAGAAACTTCGAGAAGCTCAAGATTCTGTTCGAGTTGGATCTTAGTAATAATCGATTTGCTGGTAAGTTCCCGGTGGTGGTTTTAGGGTTACCCAAGCTCAAGTTTCTAGATCTGAGGTTTAATGAATTTGAAGGAACGGTGCCGAAGGAGCTGTTTGATAAGGACTTGGACGCGATTTTCATTAATGATAATCGATTTGTGTTTGATATTCCTGACAATTTTGGGAATTCGCCGGTGTCAGTGATTGTTCTGGCAAATAACCATTTCCATGGTTGTGTTCCGGCGAGTCTTGGTAACATGTCGAATCTGAATGAGATTCTTTTGTTGAACAATGCGCTACGTTCGTGTTTTCCACCGGAGGTTGGGCTTTTGAAGAATCTTACGGTGTTCGATGTTAGCTTCAACCAGCTTTTGGGACCGTTGCCGGAGACTATCGGAGGAGCGGTGAGTTTGGAGCAGCTTAATGTGGCGCATAATTTGTTGTCTGGGAATATTCCGGCGAGTATTTGTAAACTTCCGAATCTGCAGAATTTTACTTATTCATATAACTTCTTCACTGGAGAGCCACCAAAGTGTTTGGCGTTGCCGGCGGTTGATGATCGGAGGAATTGTATTCCGGCGAGACCGGTGCAAAGGACTGAGAGGCAATGTAAGTCGTTTTTGTCAAAACCTGTGGATTGTAACTCTTTTAGGTGTAAGCCTTTTGTTCCTTCCTTGCCCCCACCACCGGTTGCTCTTCCTCCACCAGTCTATTCGCCGCCATCACCACCACCACCTACTCCTGTATTCTCCCCACCACCACCTGTACCCTACTCCTATTACTCACCACCTCCACCATCGTCACACTCCCCTCCACCGCCACCTCACTCCCCTCCACCACCACCTCACTCCCCTCCACCACCACCACCACCTCATTCACCTCCACCACCACCTCACTCCCCTCCACCACCACCACCACCTCATTCACCTCCACCACCACCTCACTCCCCTCCACCACCACCACCACCTCATTCACCTCCACCACCACCTCACTCCCCTCCACCACCACCACCACCTCATTCACCTCCACCACCACCTCACTCCCCTCCACCACCACCACCACCTCATTCACCTCCACCACCACCTCACTCCCCTCCACCACCACCACCACCTCATTCACCTCCACCACCACCTCACTCCCCTCCACCACCACCACCACCTCATTCACCTCCACCACCACCTCACTCCCCTCCACCACCACCACCACCTCATTCACCTCCACCACCACCTCACTCCCCTCCACCACCACCACCACCTCATTCACCTCCACCACCACCTCACTCCCCTCCACCACCACCACCACCTCATTCACCTCCACCACCACCTCACTCCCCTCCACCACCACCACCACCTCATTCACCTCCACCACCACCTCACTCCCCTCCACCACCACCACCACCTCATTCACCTCCACCACCACCTCACTCCCCTCCACCACCACCACCACCTCATTCACCTCCACCACCACCTCACTCCCCTCCACCACCACCACCACCTCATTCACCTCCACCACCACCTCACTCCCCTCCACCACCACCACCACCTCATTCACCTCCACCACCACCTCACTCCCCTCCACCACCACCACCACCTCATTCACCTCCACCACCACCTCACTCCCCTCCACCACCACCACCACCTCATTCACCTCCACCACCACCTCACTCCCCTCCACCACCACCACCACCTCATTCACCTCCACCACCACCTCACTCCCCTCCA 2163 0.5257 MKKKTFSSNLLLFLIPLLFQTTFEFGDRGENITIHPTLVFENNRIRNAYVALQAWKQAIFSDPNNITLDWLGSDVCNYTGVFCATALHNRKVRTVAGIDLNHGDIAGYLPEELGLLSDLALFHINSNRFCGKVPRNFEKLKILFELDLSNNRFAGKFPVVVLGLPKLKFLDLRFNEFEGTVPKELFDKDLDAIFINDNRFVFDIPDNFGNSPVSVIVLANNHFHGCVPASLGNMSNLNEILLLNNALRSCFPPEVGLLKNLTVFDVSFNQLLGPLPETIGGAVSLEQLNVAHNLLSGNIPASICKLPNLQNFTYSYNFFTGEPPKCLALPAVDDRRNCIPARPVQRTERQCKSFLSKPVDCNSFRCKPFVPSLPPPPVALPPPVYSPPSPPPPTPVFSPPPPVPYSYYSPPPPSSHSPPPPPHSPPPPPHSPPPPPPPHSPPPPPHSPPPPPPPHSPPPPPHSPPPPPPPHSPPPPPHSPPPPPPPHSPPPPPHSPPPPPPPHSPPPPPHSPPPPPPPHSPPPPPHSPPPPPPPHSPPPPPHSPPPPPPPHSPPPPPHSPPPPPPPHSPPPPPHSPPPPPPPHSPPPPPHSPPPPPPPHSPPPPPHSPPPPPPPHSPPPPPHSPPPPPPPHSPPPPPHSPPPPPPPHSPPPPPHSPPPPPPPHSPPPPPHSPPPPPPPHSPPPPPHSPPPPPPPHSPPPPPHSPPPPPPPHSPPPPPHSPP 721
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Lan6g2246 721 Pfam Leucine rich repeat 121 176 IPR001611 GO:0005515
Lan6g2246 721 MobiDBLite consensus disorder prediction 409 721 - -
Lan6g2246 721 PRINTS Proline rich extensin signature 424 441 - -
Lan6g2246 721 PRINTS Proline rich extensin signature 383 404 - -
Lan6g2246 721 PRINTS Proline rich extensin signature 406 422 - -
Lan6g2246 721 PANTHER LEUCINE-RICH REPEAT EXTENSIN-LIKE PROTEIN 3-RELATED 22 446 - -
Lan6g2246 721 PANTHER LEUCINE-RICH REPEAT EXTENSIN-LIKE PROTEIN 3-RELATED 22 446 - -
Lan6g2246 721 Pfam Leucine rich repeat N-terminal domain 51 83 IPR013210 -
Lan6g2246 721 Gene3D Ribonuclease Inhibitor 47 337 IPR032675 -
Lan6g2246 721 SUPERFAMILY L domain-like 50 330 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Lan6g2246 Lan-Chr6 32719469 32721998 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Lan6g2246 24 423 Leucine-rich Repeat extension Gene Families AT3G24480 69.327 0.0 582
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Lan6g2246 - - zju:107431856 602.053