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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Lan16g0788 ATGAATTATAACCATTCATTGTTTAAGGAATTTATTGTCCTAAACCAAAGTCAAAATTTCAATATCTATAATGTTTCTATTGATCTTCCACCACATATAACATCAGAAGGCTTATGGGCTGATTATAATCATGGTGGGGGGAAATCACCATTGCAATCCCCATTTACAATCCTTCAGCTTCAAATAGTCACCATTTTCTTCATCACACAATGTTGCCATTTCTTGCTTAAGTCATTGGGGGTCCCTTATTTTATTTCATCTGCATTGGCTGGGATTCTATTAGGCCCTACAATTAAGTCTGATACATTGAACAAATACAAGCAATTATTGTTTCCATTTGGGAGTGAAGACACATTGCAATTGATATCAGCTTTTGGTTACACATTCTACTTATTCTTGAATTATGTACAAATGGATTATTCAATGATCACAAGAACAGGAAAAAGAGCTTGGGCTATTGCTTTATCCTCATTAGTACCAATATGTCTTGGTTTTGCATTCTATGTAGAATGTTATCCTTTTATACATAAAGCTGTTGGTGAAAAAGAAATTAATAGCATGCCTACAGTGTTTATATCTCACAGCATTTGCTCTTTCCCAGTCATTGCTAGCTTACTCACTGAGCTCGAAATCCTTAACTCCGAAATCGGGCGCCTTACTCTTTCATCAGCTCTAGTATTAGATATAACTGGCACTGCAGTCACAGGAATCGCAACTAGCATGGTTGTTAGCTCGAATAAAGGTCTAGAAGCATACATTATCAATGTCGGTGGACTAATTGCATTATTCGTCATAATATTAACTATTGGACGCCCTTTGATGAAGTTAGTGGTGAGACATACTCAACAAGGTAGGCCAGTGAAGAAAATATTCATCTACATCATTGTCTTCCTTGTCATAATTTTCGGGTTGATGGAAACCGAATTAGTCCAACCTTTCTTTGGTGGTGCTGTTATGCTTGGTCTTGCTGTGCCAGAGGGTCCTCCTTTAGGGTCTGAATTGGTGAAGCAACTTCAATTGTTCTCAACTTGGTTCCTTATGCCTCTATTTGTCACAAGCTGCATCATGAAGGTTGATCTAGACCTATGGAACATGAACAAAAATCTGGTTATGATTATATTTGGCCTAATAATTATGGTCACTTTGGTTAAAATACTATTGTGTGTGGGAATTTGCCAGTTTTGTAGCATGCCTATCATTGACTCTATTTGCATTGCTCTCATTTTGAGTTGCAAAGGCGTCGTCGACATTTGCGCCTATATCTTACTATATGATGCTAAGAGATACACTAGTGGAGAAGTAAGTATTATGGTTATCTCGGGTTTGATTTTGGCAACCATTTCAAAGATTGGTGTGAAATCATTGTATGACCCTTCAAGAAAATATGCAGGGTATCAGAAAAGGAACATTTTATACTTGAAGCCTAATACAGAGCTTCGAGTTGTGGCATGCGTCCACAAACCATGTCACATAGTTCCAGTAAGAAATTCGTTGGACCTTTTTAGTCCTACACCAACAAATCCATTAGTGGTTGATGTCTTGCATCTCATGGAGCTAATTGGAAGGACTTCTCCGATTTTCATCTCACATCGCAATCAGCAAATGAGTGTTGGGTCAAGTCATCATAATTTCTCAGGGGAAATCATTGTAACCTTTAGCCTTTATGAGCATGAGTATGCAGGTGCCGCGACCGTGAATGCCTATACAGCTATATCTCCATTCACCTTTATGCATGATGATATTTGTTATCTTGCTATGGACAAAGTAGCATCATTTATAATACTTCCTTTTCATTTAAGATGGAGAGACGATGGCACGGTCGAATCAGACAATAATAACATAAGGACACTTAATATTAAGGTCATGGAAAAGGCACCATGCTCAATTGGGATTCTAGTGAATCGCGGATCTTGTACATCTATTTCATCAAGTTATGTAGTGGCCATGATTTTCTTGGGTGGTTCAGATGATAGAGAAGCTTTGTGCTTAGCTAAAAGATCAGCTAAAGAATTAAATAATCACTTGTTTGTGTATAGATTGGTTGGACCAGATTCTGAAACAACAAATTGGGATAGCATGCTTGATGCTGAAGTGCTAAGGGGTGTACAAGGAACATATGGTAGACTTGAAAATGTGACATTTGAACAAATAACAATAGATGATCCATCTCAAATAACATCATTCCTAAATGATGTGGTGACTAAATTTGATTATATTATAGTTGGGAGAAGACATGGAGTCAAATCTCCTATCACAAGTGCAATGGTAAATTGGACTGAGTTTCCAGAGTTGGGTGTAATTGGTGATTTACTTGCTTCACCAGATATGGAGACTAAAGCTTCCATTTTAGTTGTTCAACAACAACAAATGCCCACAAAATGGTGA 2385 0.3748 MNYNHSLFKEFIVLNQSQNFNIYNVSIDLPPHITSEGLWADYNHGGGKSPLQSPFTILQLQIVTIFFITQCCHFLLKSLGVPYFISSALAGILLGPTIKSDTLNKYKQLLFPFGSEDTLQLISAFGYTFYLFLNYVQMDYSMITRTGKRAWAIALSSLVPICLGFAFYVECYPFIHKAVGEKEINSMPTVFISHSICSFPVIASLLTELEILNSEIGRLTLSSALVLDITGTAVTGIATSMVVSSNKGLEAYIINVGGLIALFVIILTIGRPLMKLVVRHTQQGRPVKKIFIYIIVFLVIIFGLMETELVQPFFGGAVMLGLAVPEGPPLGSELVKQLQLFSTWFLMPLFVTSCIMKVDLDLWNMNKNLVMIIFGLIIMVTLVKILLCVGICQFCSMPIIDSICIALILSCKGVVDICAYILLYDAKRYTSGEVSIMVISGLILATISKIGVKSLYDPSRKYAGYQKRNILYLKPNTELRVVACVHKPCHIVPVRNSLDLFSPTPTNPLVVDVLHLMELIGRTSPIFISHRNQQMSVGSSHHNFSGEIIVTFSLYEHEYAGAATVNAYTAISPFTFMHDDICYLAMDKVASFIILPFHLRWRDDGTVESDNNNIRTLNIKVMEKAPCSIGILVNRGSCTSISSSYVVAMIFLGGSDDREALCLAKRSAKELNNHLFVYRLVGPDSETTNWDSMLDAEVLRGVQGTYGRLENVTFEQITIDDPSQITSFLNDVVTKFDYIIVGRRHGVKSPITSAMVNWTEFPELGVIGDLLASPDMETKASILVVQQQQMPTKW* 795
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Lan16g0788 794 Gene3D - 57 463 IPR038770 -
Lan16g0788 794 PANTHER CATION/H + ANTIPORTER 12 792 - -
Lan16g0788 794 PANTHER CATION/H+ EXCHANGER 2 12 792 - -
Lan16g0788 794 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 63 446 IPR006153 GO:0006812|GO:0015299|GO:0016021|GO:0055085
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Lan16g0788 Lan-Chr16 13890597 13893882 Dispersed/Transposed
       

Functional genes information


Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Lan16g0788 29 785 Antiporter Super Family AT3G44900 35.741 5.65e-144 442
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Lan16g0788 - - gmx:100778180 846.269