Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Lal8g0197 ATGCCTCACAGAAATGATACTAATTATTCTGCAATACCCATTAGCTCATATCTTGAATTACAGCCTCAAAAAAATGATTCCCCTAAATCACTCCATAAACAAAAAGTATCTTTTGAGGAAACTGGGTTTCTCGGATCTAAGGATGGTGATCATGATGCTGATGATGATGATTTTGAAATTGATATTGATAATTATCCCCTTGTTGTTGTTGGGGGTAATAATCAAGGTTCTGGGGTACCCGGGGCTGTGTTCAATTTAACAACAACAATTATTGGTGCTGGGATCATGGCCCTCCCTGCAACAATGAAAGTTCTTGGTGTTGTTTTAGGGATTGTGTTGATAATCCTTATGGGGATTCTGTCTGAAATTAGTGTCGAATTGTTGGTTCGATTTTCGGTTATTTTGAAAGCTACCTCATACGGTGAGGTTGTTCAACATGCTATGGGAAAGCCTGCTAGGATTTTGTCCGAGATTTGTATTATAGTGAACAATGCTGGTGTTATGGTCGTTTATTTGATAATCATGGGGGATGTCATGTCTGGTTCTATGCACCATTTGGGGGTTTTTGATCAGTTAATGGGAAACGGGTTTTGGGATCATAGAAAGATTGTGGTTCTTGTTGTTATGGTGATTTTTCTTGCACCGCTTTGTTCATTGGATAAGATTGATTCATTGAGCTTGACTTCAGCTGCGTCGGTTGCCCTTGCTGTCGTGTTTGTTGTCGTTGCTTTTACTATTGCTTTCATTAAGCTCGTCGAAGGACGGATCGATTCTCCACGGATGTTTCCTGATTTTAGCTCGAAAAAGGCCATATTGGATTTGCTTGTGGTGATTCCCATCATGACAAATGCATATGTTTGTCATTTTAATGTGCAGCCAATATACAATGAGCTTCAAGGGCGGTCTCCTCAGAAGATGAATCGAGTGGGAAGGATCACCACAATCTTGTGCATCCTGGTTTATGCTTCAACAGCGCTGTCAGGCTATCTACTATTTGGGAATGATACCGAGTCTGATGTGCTTACTAATTTTGATAAGGATCTCGGAATTCGGTTTAGTTCGATCTTAAACTATATTGTCCGAGTTGGATACATTCTCCATTTGATTCTTGTGTTCCCTGTTATTCATTTCTCATTACGGCAAACAGTGGATGCCTTAGTGTTTGAGGGATCACCTCCCCTTTCAGAAAGTAGGAAGAGATCTCTGGGATTGACAGCAGTTCTATTGGTTCTCATATATATCGGATCTACCATGATTCCAAACATTTGGACAGCTTTTAAGTTCACCGGAGCAACAACGGCTGTTTCATTGGGTTTTATATTTCCATCTCTTATTGCTTTAAGATTAAGACATCAGGGGGGTTTGAGCCACGGAGAATGGTTTTTATCATGGTTAATGTTGGTATTAGCTGTATCAGTTAGCATAGTTGGAGTCATTGGCAATATTTATAGCATGCAGAGATCTCTTATATATTGCATTGGCGAGTGTCTACCACTTCCAGAAAATGAGTTAAAGCATAACCTCTTAAACGAGGACTCACTGTTCATCAACATTTTGCATTCTCATTTGCTAATCTAA 1578 0.3973 MPHRNDTNYSAIPISSYLELQPQKNDSPKSLHKQKVSFEETGFLGSKDGDHDADDDDFEIDIDNYPLVVVGGNNQGSGVPGAVFNLTTTIIGAGIMALPATMKVLGVVLGIVLIILMGILSEISVELLVRFSVILKATSYGEVVQHAMGKPARILSEICIIVNNAGVMVVYLIIMGDVMSGSMHHLGVFDQLMGNGFWDHRKIVVLVVMVIFLAPLCSLDKIDSLSLTSAASVALAVVFVVVAFTIAFIKLVEGRIDSPRMFPDFSSKKAILDLLVVIPIMTNAYVCHFNVQPIYNELQGRSPQKMNRVGRITTILCILVYASTALSGYLLFGNDTESDVLTNFDKDLGIRFSSILNYIVRVGYILHLILVFPVIHFSLRQTVDALVFEGSPPLSESRKRSLGLTAVLLVLIYIGSTMIPNIWTAFKFTGATTAVSLGFIFPSLIALRLRHQGGLSHGEWFLSWLMLVLAVSVSIVGVIGNIYSMQRSLIYCIGECLPLPENELKHNLLNEDSLFINILHSHLLI 525
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Lal8g0197 525 Pfam Transmembrane amino acid transporter protein 77 481 IPR013057 -
Lal8g0197 525 PANTHER AMINO ACID TRANSPORTER AVT6E 53 487 - -
Lal8g0197 525 PANTHER AMINO ACID TRANSPORTER 53 487 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Lal8g0197 Lal-Chr8 1312340 1315144 Transposed
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Lal8g0197 6 486 Amino Acid or Auxin Permease AAAP Family AT1G80510 73.868 0.0 680
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Lal8g0197 - - gmx:100791860 741.11