Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Lal5g0412 ATGAATTATTATAACCATTCATTGTTTAAAGAATTTATAGTCCTAAACCAAAGTGAAAATTTCAATATCTATAATGTTACTATTACTCTTCCACCACGTATAACATCAGAAGGGTTATGGTATGATCATAATAATGCTGAAGAAGGATCACCATTGAAATCTCCATTTACAATCCTTCAGCTTCAAATACTCACCATTTTCTTCATCACACAATGTTGTCATTTCTTGCTTAAATCATTGGGGGTCCCTTATTTTATTTCATCAGCTTTGGCTGGGATTCTGTTAGGCCCTACAATTAAGTCTGATACATTGAACAAATACAAGCAATTATTGTTTCCCTTTGGGAGTGAAGACACATTGCAATTGATTTCAGCTTTTGGTTACACATTCTACTTATTCTTGAATTATGTACAAATGGATTATTCAATGATCACAAGAACAGGAAAAAGAGCTTGGGCTATTGCTCTATCCTCATTAGTACCAATAGGTCTTGGTTTTGCATTCTTCTTAGGATGCTATCCTTTTATAGTTAAAACTATTGGTGAAAAAGAAATTCATAGCATGCCTGCAGTGTTTATATCTCATAGCATTTGCTCTTTTCCAGTCATAGCTAGCTTACTCACCGAGCTCGAAATCCTTAACTCCGAAATCGGGCGCCTCGCTCTTGCATCGGCTCTAGTCTTAGATATAACTGGCATAGCATTCACAGGAATTGCAACTAGTATGGTTGTTAGCTCGAATAAAGGTGTAGAAGCTTACTTTATCAATGTAGGTGGACTAATTGCGTTATTCGCCTTAATATTAACTATTGGACGCCCTTTGATGAAGTTAGTTGTGAGGCATACTCAAGAAGGTAGACCGGTGAGGAAAATATTCATCTACATTATTGTCTTCTTTGTCATTATTTTCGGGTTGATCGAAACCGAATTAGTCCAACCTTTCTTTGGTGGTGCTGTTATGCTTGGTCTTGCTGTGCCAGAGGGTCCTCCTTTAGGGTCTGAATTGGTGAAGCAACTTCAATTGTTCTCAACTTGGTTCCTTATGCCTATATTTGTTACAAGCTGCATCATGAAGGTTGATCTAGACCTATGGAACATGAACAAAAGTTTGGTTATGATTATATTTGGCCTAATAGTTATGGTCACTTTGATTAAAATACTATTGTGTGTCGGAATTTGTCGATTTTGTAGCATGCCTATCATTGATTCTATTTGCATTGCTCTTATTTTGAGTTGCAAAGGTGTCGTCGACATTTGCACCTATGTCTTACTGTATGATGCTAAGAAATACACTTGTGGAGAAGTAGGTATTATGGTGATCTCGGGTTTGATTTTGGCAACCATTTCAAAGATCGGTGTGAAATCATTGTATGACCCTTCAAGAAAATATGCAGGCTATCAGAAAAGGAACATTTTATACTTGAAGCCTAATACCGAGCTTCGAGTTGTCGCTTGCGTTCACAAACCATGTCACATAGTTCCAGTGAGAAATTCATTAGACCTTTTTAATCCTACACCAACAAATCCAGTAGTGGTTGATGTCTTGCGTCTCATGGAGCTAATTGGAAGGACTTCCCCGATTTTCATCTCGCATCGCGATCAACAAATGAGTGTTGGGGCTAGTCATCACAATTTCTCGGAGGAAATCATTCTACACTTTAACCTTTACGAGCATGAATATGCGGGTGCGGCGACCGTGAATGCCTACACAGCTATATCTCCATTCACCTTTATGCATGATGATATTTGTTATCTTGCTATGGACAAAGTAGCATCATTTATAATCCTTCCTTTTCATTTAAGATGGAGAGACGATGGCACGGTCGAATCGGACGACAATAACATAAGGACACTTAATATTCGAGTCATGGAAAAGGCACCATGCTCAATTGGGATTCTAGTGAATCGCGGAACTTGTACATCTAATTCGTCGAATTATGTAGTAGCCATGATTTTCTTGGGTGGTTCAGATGATAGAGAAGCTTTATGCTTAGCTAAAAGATCAGCTAAAGAATTAAATAATCACTTATTTGTGTATAGATTAATTGGAAAAGATTCTGAAGCAACAAATTGGGATAATATGCTTGATGCTGAAGTGCTAAGGGGTGTACAAGGAACTTATGGTAGAGTTGAAAATGTGACATTTGAACAAATAACAATAGATGATGCATCTCAAATAACATCATTCTTAAATGATGTGGTGATTAAATTTGATTATATTATAGTTGGAAGAAGACATGGAGTAAAATCTTCTATCACAAGTGCAATGGTTAGTTGGACTGAATTTCCAGAATTGGGTGTAATTGGTGATTTACTTGCTTCACCAGATTTGGAGACTAATGCTTCAATTTTAGTTGTTCAACAACAACAAATGCCCACAAAATGGTGA 2388 0.3706 MNYYNHSLFKEFIVLNQSENFNIYNVTITLPPRITSEGLWYDHNNAEEGSPLKSPFTILQLQILTIFFITQCCHFLLKSLGVPYFISSALAGILLGPTIKSDTLNKYKQLLFPFGSEDTLQLISAFGYTFYLFLNYVQMDYSMITRTGKRAWAIALSSLVPIGLGFAFFLGCYPFIVKTIGEKEIHSMPAVFISHSICSFPVIASLLTELEILNSEIGRLALASALVLDITGIAFTGIATSMVVSSNKGVEAYFINVGGLIALFALILTIGRPLMKLVVRHTQEGRPVRKIFIYIIVFFVIIFGLIETELVQPFFGGAVMLGLAVPEGPPLGSELVKQLQLFSTWFLMPIFVTSCIMKVDLDLWNMNKSLVMIIFGLIVMVTLIKILLCVGICRFCSMPIIDSICIALILSCKGVVDICTYVLLYDAKKYTCGEVGIMVISGLILATISKIGVKSLYDPSRKYAGYQKRNILYLKPNTELRVVACVHKPCHIVPVRNSLDLFNPTPTNPVVVDVLRLMELIGRTSPIFISHRDQQMSVGASHHNFSEEIILHFNLYEHEYAGAATVNAYTAISPFTFMHDDICYLAMDKVASFIILPFHLRWRDDGTVESDDNNIRTLNIRVMEKAPCSIGILVNRGTCTSNSSNYVVAMIFLGGSDDREALCLAKRSAKELNNHLFVYRLIGKDSEATNWDNMLDAEVLRGVQGTYGRVENVTFEQITIDDASQITSFLNDVVIKFDYIIVGRRHGVKSSITSAMVSWTEFPELGVIGDLLASPDLETNASILVVQQQQMPTKW 795
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Lal5g0412 795 PANTHER CATION/H+ EXCHANGER 2 13 793 - -
Lal5g0412 795 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 65 445 IPR006153 GO:0006812|GO:0015299|GO:0016021|GO:0055085
Lal5g0412 795 PANTHER CATION/H + ANTIPORTER 13 793 - -
Lal5g0412 795 Gene3D - 58 464 IPR038770 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Lal5g0412 Lal-Chr5 4083399 4086564 Dispersed/Tandem
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Lal5g0412 30 786 Antiporter Super Family AT3G44900 36.160 1.77e-142 438
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Lal5g0412 - - vra:106763250 830.091