Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Lal14g0035 ATGGAGTCTTCCGCAAACTCGTTCACGTTTTTAGTTATGGTTATGGCGCTGCTTTCAACTTGTGCCATGGCAATCAATGAGAATCAGAACATTGTAGGTATGGAGTGGTTGCAGAGATTGAAGAACTCTTCAATGGCGGAAAGATCAAGTGATGCTGCTACTTTAAATGAACATGCCGTTGATAACCCAGAGGAGATAGCTTCTATGGTTGAAATGAGCATTCACAATCATACAGCAAGGAGGAATCTGAATTTCTTCTCATGTGGAACTGGTAACCCAATTGATGACTGCTGGCGCTGTGATAAGACTTGGTATGCTCGACGAAAGCGGTTAGCTGATTGCGCCATCGGCTTCGGGCACAATGCCATTGGTGGCCGTGATGGAAGGTACTATGTTGTGAGTGATCCAGGTGATGATGACCCTGTCAACCCCAGACCAGGTACCCTCCGCCATGCAGTTATTCAAGACAGGCCCTTGTGGATTGTTTTCAAGAGGGACATGGTTATCACTTTGAAGCAAGAGCTGATTATGAATAGCTTCAAGACCATAGATGCTCGTGGTGTCAATGTGCACATTGCTTATGGTGCTTGTATTACAATCCAGTTCATTACCAATGTCATCATCCATGGCCTTCATATCCATGACTGCAAGCCTACTGGCAATGCCATGGTCCGTAGTTCACCCTCACATTATGGATGGCGGACCATGGCTGATGGAGATGGAATTTCCATTTTTGGTTCAAGCCATATATGGATTGACCACAATTCATTGTCTAATTGTGCAGATGGCCTTATTGATGCCATTATGGGATCAACTGCCATTACAGTTTCCAACAACTACTTCACCCACCACAATGAGGTGATGCTACTGGGTCACAGTGACACTTACGTAAGAGACAAGCAGATGCAAGTGACTATTGCCTACAACCATTTTGGGGAGGGCCTTATTCAAAGAATGCCAAGGTGCAGACATGGGTATTTCCATGTGGTAAACAATGATTATACCCACTGGGAAATGTATGCAATTGGTGGCAGTGCTAATCCAACAATTAACAGCCAAGGTAATCGATACCTTGCGCCTCAGAACCCTTTCGCTAAGGAGGTAACACATAGGGTGAATGCAGGGGACCAATGGAAAGAATGGAATTGGAGGTCTAAGGGAGACCTACTACTGAATGGAGCATTTTTCACTGCTTCAGGAGTCAGAACTGCTGCAAGCTATGCTAGAGCCTCAAGTCTTGGTGCCAAATCCTCTTCTTTGGTTGGAACTCTCACTTATGGTGCAGGTGTTCTTAACTGCCGCAGGGGCACCATGTGTTAA 1320 0.4545 MESSANSFTFLVMVMALLSTCAMAINENQNIVGMEWLQRLKNSSMAERSSDAATLNEHAVDNPEEIASMVEMSIHNHTARRNLNFFSCGTGNPIDDCWRCDKTWYARRKRLADCAIGFGHNAIGGRDGRYYVVSDPGDDDPVNPRPGTLRHAVIQDRPLWIVFKRDMVITLKQELIMNSFKTIDARGVNVHIAYGACITIQFITNVIIHGLHIHDCKPTGNAMVRSSPSHYGWRTMADGDGISIFGSSHIWIDHNSLSNCADGLIDAIMGSTAITVSNNYFTHHNEVMLLGHSDTYVRDKQMQVTIAYNHFGEGLIQRMPRCRHGYFHVVNNDYTHWEMYAIGGSANPTINSQGNRYLAPQNPFAKEVTHRVNAGDQWKEWNWRSKGDLLLNGAFFTASGVRTAASYARASSLGAKSSSLVGTLTYGAGVLNCRRGTMC 439
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Lal14g0035 439 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 114 131 IPR018082 -
Lal14g0035 439 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 138 163 IPR018082 -
Lal14g0035 439 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 174 190 IPR018082 -
Lal14g0035 439 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 238 259 IPR018082 -
Lal14g0035 439 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 318 337 IPR018082 -
Lal14g0035 439 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 340 359 IPR018082 -
Lal14g0035 439 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 381 405 IPR018082 -
Lal14g0035 439 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 410 433 IPR018082 -
Lal14g0035 439 SMART amb_all 166 363 IPR002022 -
Lal14g0035 439 Pfam Pectate lyase 195 355 IPR002022 -
Lal14g0035 439 SUPERFAMILY Pectin lyase-like 69 433 IPR011050 -
Lal14g0035 439 Gene3D - 91 432 IPR012334 -
Lal14g0035 439 PANTHER PECTATE LYASE 18-RELATED 12 436 IPR045032 GO:0030570
Lal14g0035 439 PANTHER PECTATE LYASE 12 436 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Lal14g0035 Lal-Chr14 489125 498320 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Lal14g0035 35 439 Polysaccharide Lyase AT4G13710 76.456 0.0 666
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Lal14g0035 K01728 - gmx:100809277 768.459