Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Lal12g0328 ATGTCTCTTGCACGCTGCACGTGGAGTTCCACCGGCTGTAACCGTGGATTTGGTACTGGTGCTTCTGAATTTGTTGCTAAAAAGCTGAGGTTGAAGTGGATCCACTCTATTCAACAAAACTTTTCATCACTTCACAAAATGTCTCGAGTTGAGGAACGCTGGGAGCGGTTAGTCCGTGCTGCATTGAGGAGGGAAAGGACTGGTGGTGATGCATATGGGCGACCTGTTGGTGGAATTGCAGGAAACGTACCATCAGCACTTGCAAAAAATAGGGATATTGATGAAATTTTAAGAGTTGCAGATGAAATTCAAGATGAGGATCCCAATATCTCTAGGATATTATGTGAGCATGCCTATTCACTATCTCAAAATTTGGACCCTAACAGTGAAGGCCGAGGCGTTTTACAATTCAAGACTGGTTTGATGTCTGTCATTAAGCAAAAGCTGGCTAAAAGAGAAGTTGGAACAATAGATAGAAGTCAGGATATTGCCAGATTACAGGAGTTCTACAAGCTTTATAGAGAGAATAATGAAGTTGACAAATTGCGTGAGGAAGAAACGAAGTTGAGGGAATCTGGTGCTTTCAGCCGGGAGAATCTGGGCGAGCTGGAGCGCAAGACTGTGAAGAGGAAAAGGGTTTTTGCTACCTTAAAGGTTTTAGGAACAGTGCTTGAGCAGCTGAGCAAGGAAATTCCACAGGAGCTCAAGCAGGTCATGGAATCAGATTCTGCATTGACAGAGGACCTGATTGCTTACAACATCATCCCCTTGGATGCCCCTTCTTCAACAAATGCGATTGTTTCGTTCCCTGAGGTGCAAGCAGCAGTTTCGGCTTTGAAGTATTTTAGTGGCTTGCCGGAGTTGCCTAGAGGCTACTTCATTTCTCCTACAAGGAGTCCTGACATGCTTGATTTTTTGCAGTATACTTTTGGATTTCAGAAAGATAATGTAGCTAATCAACGCGAACACATAGTTCACCTGATTGCAAATGAGCAATCCCGGCTTGGAGTTCCAGACGAAACTGATCCTAAATTGGATGAAGCGGCCGTGCAGAATACATTCCTCAAGTCCCTTGAAAATTACATAAAATGGTGTAACTACTTAGGCATTCAGCCTGTTTGGAGCAGTTTGGATTCTGTTCGTAAAGAGAAGAAATTGCTTTATGTTTCTTTATACTTCTTAATATGGGGTGAAGCTGCCAATATCAGGTTTCTGCCAGAATGCTTGTGCTACATATTCCACCACATGGCTAGAGAGATGGATGAGATCTTAAGGCAACAGATTGCACAGCCAGCTAAAAGCTGCACTTCTGAGAATGAGACTGATATCTCATTCCTTGATCAAGTGATCTTTCCACTCTATGACATTGTTGCTGCAGAAGCTGCGAGCAATGATAACGGAAAGGCATCTCATTCATCCTGGAGAAATTATGATGATTTTAATGAATATTTCTGGTCACTCCATTGCTTTGAGCTTAGTTGGCCGTGGCGCAGAAGTTCTTCATTTTTCAATAAGCCACAACACAGATCAAAGAAAATGCTTGTATCTGCCAGTAAGCATCAGGGAAAAACATCTTTTGTGGAGCATCGAAGTTTTTTCCATCTCTACCATAGCTTCCATCGACTGTGGATATTTCTTTTCATGATGTTTCAGGGTCTTTCCATCATTGCTTTCAATAATGGAAATCTTAATGCCAAGACTTTGCGAGAGCTTCTTAGTCTAGGTCCTACATTTTTTGGGATGAAGTTTTTTGAGAGTGTTCTCGACATTCTCATGATGTATGGTGCATATTCAACAACACGCCACTTAGCTGTCTCTCGAATTTTTCTTCGATTTCTGTGGTTTAGCATTGCTTCAGTTGTCATAACTTTCCTTTATGTGAAAGCATTCCAGGAAGAGAGTAAAAGAAATGCAGATTCCATTCTTTTCAGATTATATGTGATTGTCATAGGGGTTTATGCTGGTATCCAATTTTTCATTAGTTTCCTCATGCGGATACCAGCATGTCATCGCCTAACAAATCAATGTGATCATTGGCCTGTACTTCGCTTTGTGAAGTGGTTGCGCCAGGAACGGCATTATGTTGGACTGGGAATGTATGAAAGGAGTACTGATTTCATAAAGTACCTGCTGTTTTGGATTTTTGTCTTGAGTGGAAAATTTTCGTTTGCTTACTTTCTTCAGATCAAGCCGTTGGTGGATCCAACAAGGGATATAATAAAAGAGACTAATATTGATTACTCTTGGCATGATTTTTTCTCAAAAAATAATTATAATGCTTTGACAGTTGCTAGCTTATGGGGTCCAGTGTTTGCTATATACCTTCTGGATATTTATGTATTTTACACACTTGTATCGGCTGTCTGGGGATTCTTGCTAGGAGCAAGAGCTCATTTGGGAGAGATTAAGTCACTAGAAGCGCTACACCAACTCTTTGAGCTGTTTCCCGCAGCTTTTATGGATACCCTGCATGTTCCACTACCCAACAGGAGCTCCCAACCATCGGTTCAGGCTGTGGAGAAGTACAAGTTTGATGCTGGTCGGTTCTCACCCGTTTGGAATGAGATCATAAGAAATCTAAGGGAGGAAGATTATATAACTAACTTTGAAATGGATTTGCTTTTAATGCCTAGGAACTCCGGCAATCTCCCATTGGTTCAATGGCCACTTTTTCTGCTTGCAAGCAAGATATTTTTAGCTAAGGATATTGCTGCTGAGAGTAGAGATAGTCAAGATGAGCTTTGGGATAGGATTTCAAGAGATGACTATATGAAATATGCCGTTCAGGAGTGTTACTATGCTATTAAACACATTTTGACAGAAATACTAGATGAAGTAGGAAGGATGGTTGAGAGAATATATGATGATATTAATGCTTGTATCACAAACAAGAGTAGTCATTCGGACTTCCAACTAAGTAACTTGGCTCTTGTGATATCAAGAATAACTGCATTGATGGGAATTCTGAAAGAGGCTGAAACACCTGAGCTGGAAAGGGGTGCAGTTAGAGCTGTTCAGGATCTGTATGATGTTGTGCGACATGATTTTTTTTCTATAAATATGAGGGAGAATTATGACACATGGAGTATATTAATCAAAGCTAGGGACGAAGGTCGTTTGTTCGCAAAGTTGAAATGGCCCCATAACACAGACTTGAGAGTGCAAGTAAAAAGATTGCATTCACTGTTGACTATCAAAGAGTCAGCCTCAAATATTCCTAAGAATCTTGAGGCTAGGAGAAGATTGGAGTTTTTCACTAATTCGCTTTTTATGAAGATGCCTCTTACAAAACCTATTCGAGAGATTGTTTTCACTCCTTATTATTCTGAGACTGTGCTTTATAGCATGGCTGAACTCTTAAAGAAAAATGAAGATGGCATATCAATTTTGTTCTACCTTCAGAAGATATATCCAGATGAGTGGAAAAACTTTCTTGCCCGAATCGGCCGTGATGAAAATGCACTTCACACAGATCTTTATGATAGTCCTGGTGATATCCTTGAACTGCGTTTTTGGGCTTCTTATCGGGCACAAACACTTGCTAGAACAGTTCGTGGGATGATGTATTATAGAAAAGCTCTTATGCTTCAAACCTATTTGGAGAGGACTACAGCTGGAGATTTGGAGGCTGCAATTGGTAATGATGAAGTGACTGATACACGTGGCTTTGATTTATCCCCGGAAGCACGTGCTCAGGCAGACCTTAAGTTCACTTATGTTGTGACATGTCAAATTTATGGTAAGCAGAAAGAGGAGCAAAAGCCTGAGGCTGCTGATATTGCTTTACTTATGCAAAGAAATGAAGCTCTTCGGGTCGCATTCATTGATGTCGTTGAAACTGTAAGAGATGGAAACGTTAGCACAGAGTACTACTCAAAGCTTGTGAAAGCTGATATCAATGGGAAGGACAAGGAAATATATTCATTGAAATTACCTGGAAATCCCAAACTTGGTGAAGGGAAGCCCGAGAATCAAAACCATGCAATTATATTTACCCGTGGAAATGCCGTCCAGACAATTGACATGAATCAGGATAACTACTTTGAAGAGGCTTTGAAGATGAGGAATCTTCTTGAAGAGTTTAATTCTGATCATGGGCTTCGTTCTCCTACAATACTTGGTGTTAGAGAACATGTCTTTACTGGGAGTGTCTCATCTTTGGCCTCATTTATGTCCAATCAAGAAACTAGTTTTGTTACTATGGGTCAGCGTGTTTTAGCAAATCCTTTGAAGGTCCGTATGCATTATGGTCATCCTGATGTTTTCGATAGAGTGTTCCACATAACCCGTGGTGGCATCAGCAAGGCTTCTCGTGTAATCAACATTAGTGAAGATATATACTCCGGATTCAATTCGACCTTACGTCAAGGAAATATTACACATCATGAATACATTCAGGTTGGTAAGGGAAGAGATGTGGGACTCAATCAGATTGCACTGTTTGAGGGGAAGGTTGCAGGTGGTAATGGTGAGCAAGTACTCAGTCGTGATGTATACAGACTTGGGCAACTTTTTGATTTCTTCCGAATGATGTCTTTTTACTTTACAACAGTTGGATACTACTTTTGTACCATGTTAACTGTGCTAACTGTATATATCTTTCTCTATGGAAAAGCGTACCTGGCATTCTCTGGTGTTGGTGAAACCATTGGAGAAAGGGCTAAGATAACTAAGAACACTGCTCTGAGTACTGCTTTGAATACACAGTTTCTCTTGCAAATTGGTATTTTCACTGCTGTGCCAATGGTCTTGGGCTTCATTCTAGAACAAGGCTTCTTGAGGGCCATTGTTGGTTTTGTGACAATGCAGTTCCAGCTCTGCTCTGTCTTTTTCACATTTTCCTTGGGTACAAGAACACATTATTTTGGTCGGACTATTCTTCACGGTGGTGCAAGGTATCAAGCAACTGGGCGTGGGTTTGTTGTCCGCCATATCAAATTTTCAGAGAATTACAGACTCTACTCTCGGAGCCATTTTGTTAAAGGGTTGGAAGTTGTGCTTTTGATGATAGTATATCTTGCTTATGGCTACAATGAAGGAGGCACAGTTTCTTACATTCTTCTGACTATAAGCAGCTGGTTTATGGCTCTATCTTGGTTGTTTGCTCCATATTTGTTCAACCCATCTGGATTTGAGTGGCAAAAGGTTGTGGAAGACTTCCGAGATTGGACAAATTGGCTTCTTTATAGAGGTGGAATTGGTGTCAAGGGAGAAGATAGCTGGGAAGCTTGGTGGGAAGAAGAACTGGCTCATATTAGGACTTTCGGTTCAAGGATAGCAGAGACCATCTTAAGTCTACGATTTTTCATCTTCCAATATGGCATTGTGTACAAGCTTAACGTGCAGGGAACAGATACTTCATTGACGGTTTATGGCCTGTCATGGATCGTGTTTGCTGTGCTTATAATTCTTTTCAAGGTATTCACCTTCAGCCAGAAGATATCAGTCAATTTCCAGCTTCTGTTGCGCTTTATCCAAGGACTCTCCCTCTTGTTGGCATTGGCTGGTTTAGTTGTAGCAGTTATATTGACTGACCTCTCTGTAGCTGACATATTTGCTTCTATGTTGGCATTCATTCCTACTGGATGGGGAATCCTTTCTATTGCTGTTGCTTGGAAGCCTGTGATGAAGAAATTGGGACTGTGGAAATCCATTCGATCAATTGGTCGACTATATGATGCTGGCATGGGAGTGATCATCTTTTTACCCGTTGTATTCTTTTCGTGGTTCCCATTTGTATCAACATTCCAAACTCGCCTCATGTTTAACCAGGCCTTTAGCCGAGGGTTAGAAATTTCTCTAATCCTTGCTGGGAACAATCCCAATACTGGGATATAG 5838 0.4099 MSLARCTWSSTGCNRGFGTGASEFVAKKLRLKWIHSIQQNFSSLHKMSRVEERWERLVRAALRRERTGGDAYGRPVGGIAGNVPSALAKNRDIDEILRVADEIQDEDPNISRILCEHAYSLSQNLDPNSEGRGVLQFKTGLMSVIKQKLAKREVGTIDRSQDIARLQEFYKLYRENNEVDKLREEETKLRESGAFSRENLGELERKTVKRKRVFATLKVLGTVLEQLSKEIPQELKQVMESDSALTEDLIAYNIIPLDAPSSTNAIVSFPEVQAAVSALKYFSGLPELPRGYFISPTRSPDMLDFLQYTFGFQKDNVANQREHIVHLIANEQSRLGVPDETDPKLDEAAVQNTFLKSLENYIKWCNYLGIQPVWSSLDSVRKEKKLLYVSLYFLIWGEAANIRFLPECLCYIFHHMAREMDEILRQQIAQPAKSCTSENETDISFLDQVIFPLYDIVAAEAASNDNGKASHSSWRNYDDFNEYFWSLHCFELSWPWRRSSSFFNKPQHRSKKMLVSASKHQGKTSFVEHRSFFHLYHSFHRLWIFLFMMFQGLSIIAFNNGNLNAKTLRELLSLGPTFFGMKFFESVLDILMMYGAYSTTRHLAVSRIFLRFLWFSIASVVITFLYVKAFQEESKRNADSILFRLYVIVIGVYAGIQFFISFLMRIPACHRLTNQCDHWPVLRFVKWLRQERHYVGLGMYERSTDFIKYLLFWIFVLSGKFSFAYFLQIKPLVDPTRDIIKETNIDYSWHDFFSKNNYNALTVASLWGPVFAIYLLDIYVFYTLVSAVWGFLLGARAHLGEIKSLEALHQLFELFPAAFMDTLHVPLPNRSSQPSVQAVEKYKFDAGRFSPVWNEIIRNLREEDYITNFEMDLLLMPRNSGNLPLVQWPLFLLASKIFLAKDIAAESRDSQDELWDRISRDDYMKYAVQECYYAIKHILTEILDEVGRMVERIYDDINACITNKSSHSDFQLSNLALVISRITALMGILKEAETPELERGAVRAVQDLYDVVRHDFFSINMRENYDTWSILIKARDEGRLFAKLKWPHNTDLRVQVKRLHSLLTIKESASNIPKNLEARRRLEFFTNSLFMKMPLTKPIREIVFTPYYSETVLYSMAELLKKNEDGISILFYLQKIYPDEWKNFLARIGRDENALHTDLYDSPGDILELRFWASYRAQTLARTVRGMMYYRKALMLQTYLERTTAGDLEAAIGNDEVTDTRGFDLSPEARAQADLKFTYVVTCQIYGKQKEEQKPEAADIALLMQRNEALRVAFIDVVETVRDGNVSTEYYSKLVKADINGKDKEIYSLKLPGNPKLGEGKPENQNHAIIFTRGNAVQTIDMNQDNYFEEALKMRNLLEEFNSDHGLRSPTILGVREHVFTGSVSSLASFMSNQETSFVTMGQRVLANPLKVRMHYGHPDVFDRVFHITRGGISKASRVINISEDIYSGFNSTLRQGNITHHEYIQVGKGRDVGLNQIALFEGKVAGGNGEQVLSRDVYRLGQLFDFFRMMSFYFTTVGYYFCTMLTVLTVYIFLYGKAYLAFSGVGETIGERAKITKNTALSTALNTQFLLQIGIFTAVPMVLGFILEQGFLRAIVGFVTMQFQLCSVFFTFSLGTRTHYFGRTILHGGARYQATGRGFVVRHIKFSENYRLYSRSHFVKGLEVVLLMIVYLAYGYNEGGTVSYILLTISSWFMALSWLFAPYLFNPSGFEWQKVVEDFRDWTNWLLYRGGIGVKGEDSWEAWWEEELAHIRTFGSRIAETILSLRFFIFQYGIVYKLNVQGTDTSLTVYGLSWIVFAVLIILFKVFTFSQKISVNFQLLLRFIQGLSLLLALAGLVVAVILTDLSVADIFASMLAFIPTGWGILSIAVAWKPVMKKLGLWKSIRSIGRLYDAGMGVIIFLPVVFFSWFPFVSTFQTRLMFNQAFSRGLEISLILAGNNPNTGI 1945
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Lal12g0328 1945 PANTHER BNAC03G35120D PROTEIN 47 1943 - -
Lal12g0328 1945 Gene3D - 80 239 IPR023175 -
Lal12g0328 1945 Pfam 1,3-beta-glucan synthase subunit FKS1, domain-1 385 494 IPR026899 -
Lal12g0328 1945 Coils Coil 172 192 - -
Lal12g0328 1945 Pfam 1,3-beta-glucan synthase component 1072 1759 IPR003440 GO:0000148|GO:0003843|GO:0006075|GO:0016020
Lal12g0328 1945 SMART FKS1_dom1_2 383 497 IPR026899 -
Lal12g0328 1945 PANTHER LYST-INTERACTING PROTEIN LIP5 DOPAMINE RESPONSIVE PROTEIN DRG-1 47 1943 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Lal12g0328 Lal-Chr12 2313013 2349568 Tandem
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Lal12g0328 47 1945 Cell Wall Biosynthesis AT3G07160 75.720 0.0 3001
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Lal12g0328 K11000 - gmx:100787540 3335.04