Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Lal10g0494 ATGGTTTCTGTGTCTAAACCCATGGGTTTCACTTTCACCTTGTTCTTGAACACCTCCTTCATCATGGTGTTATGTGCTTTGGTGATTTTTCATTTCCACTCTTCAGAGAAAGATATTGTTCTGAGAAATCACTTTACCTTTGGTGGCAGTAGTAGTGAGAAGGATTGTAAGGGTTTACATAGTCTAAGTGATTATAAAGCTAAGTGCTTTTATGTGAAATCCAATGACCCATGTGTCTCTCAGGGCTATGTTGACTACCTATACCTTTACTATTGCAAATTTGGGGAATTCACTCTATTGGGTCACACCCTTTTGTTTCTTTGGCTCCTAGTTCTGTTTTATCTTTTGGCCAATACAGCTTCAGAATACTTTTGTCCTTCCCTTGAAAACTTGTCCAATTTGCTGAGGTTGTCCCCTACAATTGCGGGGGTTACCCTTCTCTCTCTTGGCAATGGTGCTAGTGATGTTTTTGCCACCCTTGTCTCTTTCAATGGTAGTGGGACACATGGAATTGGCTTTAACACTGTGCTAGGGGGTGCTTCCTTTGTGTCCTGTGTTGTGGTTGGAATTGTGAGCATATCAATTCGTGGTAGGGGAATTCGCATCAAGAAGTCTGCATTGATAAGAGATGTTTGTTTCTTACTTTTGGTTCTGCTGTGCTTGTTCACCATTTTGGTGAGTGGTGAGATCAATGTTTTTGGAGCAATTGGTTTCTGTTTGATGTATGTGGTGTATGTGGTTGTTGTTTATGTCTCGTCCACACGGTGGAAGGGTGTGTGTGGTGATGCTGAAATTGATGGTGATTCAAGTCATGGCAGTGATTTAAGTGTGCCTCTTCTCATTGGGATGGAGACGGGACTAATTGGTAGTGCTGAAAATGGAGCTCAAGAATGCGACATGAAAATTGAGAAGGCGAAATTTTCAGTATGTAGAATGTTACTTAACGTCTTGGAGATACCACTCTACTTGCCTAGAAGATTAACAATTCCTGTTGTTTGTGAACACAGATGGTCGAAGCCGTATGCAGTTTGTTCAGCTATGCTAGCACCAATTCTTGTGTCTTCATTGTGTACCTCAAACAAGGACAACATTTCCTCCATCTCAAACCTTATAATTTATGGAATCGGCTTCTTGGTTGGAATTACATTAACCGTAATTGCATTTTTCACCACCGAGATGTCAAGTCCGCCGAAGAATTACTTGCTCCCTTGGCTTGCTGGCGGGTTCGCGATGAGTGTGTGTTGGAGCTACATTTCAGCTAAGGAACTAGTTGCATTGTTGGTTTCACTTGGTTACATATGTGGTATAAGTCCTTCAATATTGGGGTTAACCGTTCTTGCATGGGGAAATTCACTCGGCGACTTGATCACAAATTTAACATTGGCTTTAAATGGTGGACCAGAAGGTGCTCAAATTGCAATATCAGGTTGTTATGCTGGTCCTATCTTCAATACAGTTATTGGATTAGGCTTATCTCTTGTGTTCTCTACTTGGTCACAGTATCCATTATCTGTTATGATACCTAAAGATCCATATCTGTGGGAAACATTAGCACTTTTGGTGGTTGGGTTGGTTTGGGCACTTGTGGTATTAATAAGAAGAAATATGAAGCTTGATGCAGTCTTAGGAGGAGGGCTTTTAGTTATTTACTTCATTTCTCTGTTTCTGAGGCTAATTCAGACACTTGGTACTCTTCAATTTCAGGATATGTTAACCTTAGTCTTTGAAAATATGATAAGTTATGGAAAACTACACTGA 1758 0.4061 MVSVSKPMGFTFTLFLNTSFIMVLCALVIFHFHSSEKDIVLRNHFTFGGSSSEKDCKGLHSLSDYKAKCFYVKSNDPCVSQGYVDYLYLYYCKFGEFTLLGHTLLFLWLLVLFYLLANTASEYFCPSLENLSNLLRLSPTIAGVTLLSLGNGASDVFATLVSFNGSGTHGIGFNTVLGGASFVSCVVVGIVSISIRGRGIRIKKSALIRDVCFLLLVLLCLFTILVSGEINVFGAIGFCLMYVVYVVVVYVSSTRWKGVCGDAEIDGDSSHGSDLSVPLLIGMETGLIGSAENGAQECDMKIEKAKFSVCRMLLNVLEIPLYLPRRLTIPVVCEHRWSKPYAVCSAMLAPILVSSLCTSNKDNISSISNLIIYGIGFLVGITLTVIAFFTTEMSSPPKNYLLPWLAGGFAMSVCWSYISAKELVALLVSLGYICGISPSILGLTVLAWGNSLGDLITNLTLALNGGPEGAQIAISGCYAGPIFNTVIGLGLSLVFSTWSQYPLSVMIPKDPYLWETLALLVVGLVWALVVLIRRNMKLDAVLGGGLLVIYFISLFLRLIQTLGTLQFQDMLTLVFENMISYGKLH 585
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Lal10g0494 585 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 106 250 IPR004837 GO:0016021|GO:0055085
Lal10g0494 585 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 405 557 IPR004837 GO:0016021|GO:0055085
Lal10g0494 585 PANTHER CATION CALCIUM EXCHANGER 3 566 - -
Lal10g0494 585 PANTHER NA+/CA2+ K+ INDEPENDENT EXCHANGER 3 566 - -
Lal10g0494 585 Gene3D - 342 558 IPR044880 -
Lal10g0494 585 Gene3D - 137 266 IPR044880 -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Lal10g0494 Lal-Chr10 11669061 11670818 Proximal
       

Functional genes information


Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Lal10g0494 8 563 Antiporters AT5G17850 54.064 1.11e-170 494
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Lal10g0494 K13754 - gmx:100787016 768.844