Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Gma06g01826 ATGTGGTGTGCAGAATATAACTTCAGTGTTTATGTCTTTTCTCAGGTTGCAGGAATGGCTTTCTTTGGTAGAGTCGGGAATATACTGAGACAAGCAACGAATCAGAAGATCGGTTTGGAGATACGTTCTTTGTCATCTGTTTTCCAGGCTACACGGTGCATGTCAAATGCTCCAAATTCAAGGCTGTTTATAGGAGGTGTTTCGTATTCTATTGACGCGCAAAGTTTGGGGGAAATTTGTTCACAATATGGCCAAGTTGTTGATGCAAGGATAATTATGGATCGTGAAACTGGTAGGCACAGAGGATTTGGTTTTATCACTTACAGTAATGTTGATGAGGCATCGCGTGCCCTTCAAGCCTTGGATGGACAGGATCTTGACGGTCGTCGGGTTGAGGTAAAATTTGCAATTGAAAGATCCCATGGATTTGGTGGTGGCGGCTTTGGTGGATCTTATGGCAATACTCCCTATGATGCTGGAGCTGGCACTGGGCATCCAGGTAGTTATGGCAACACTCCATATGGTGCTGCAAGTGGTGGGTATGACAATACTGGTGGTGGCAATGCTGCTGGAGTTTATGGCAGGGGTGAAGATGGTGGAGGTGGCAATTGGCCGAGTGGTAATTTTGGGGGAAGCAGCTTTGGTAATAACTATGGCGATGCTGGTGTCTATGCTGGCAATTCTGCTGGAGGTTATGACAACAATGGATATGGTGGAGGATCTGGCGGTGACGCGGGTCCCTATGGTAGCAATGCTGCTAGAGATTATGACAACGGCGTTGGAGGATCAGGTAGCAGTTTTGGGGACAGAAGCTCTGGCAAGAACTATGGTGATGCCGGTGCCTTCAGAGCCAATGCTGCCAGTGAATATGGTGGAGGATCAGGTGGCAGTTTTGGGGACAGCAGCTCTGTCAACAACTATGGTGCTGGTGGTGGTTATAATGGAACCGGAACGAGTTACAggaatgctggtagctttgcaaccagtaacccttacaacgatggaccaggtgctgccggatttggcaagaataataattatgacagttctgcaggatttggtagtggcagtaggtatggtagtgctgctgctgctggaggaaggcagagttttgccggtagtcagcaccctggaagtgccatggcgaatgccagtgacggtacagatactggaaatggctttgctggtggaagttatgggaatgctggtagctttgcaaccagtaaaacatacaatgatggaacaggtgctgctggatttggcaagaataataagtatgacagttctgcaggatttggtagcagcagtaggtatgatagtgctgcctctgttggcaaccagagttttgccggtaaacagcaccctggaatggtgaatggcagtgatggtacaggtactggaaatggctttgctggtggaagttatgggaatgctggtagctatgcaaccagtaacactgacaaggatggaacaggtgctgccggatttggcaagaataataattatgacagttctgctggatttggtagtggcagtaggtatggtagtgctgctgctggtggaaggcagtgttttgccggtagtcagcaccctggaattgccatggcgaatgccagtgatggtacagatactggaaatggctttgctggtggaagttatgggaatgctggtagctttgcaacatgtaacagttacaacgatggaacaggtactgctggatttggcaagagtaataagtatgacagttctgcaggatttggtagcagcagtaggtatggtagtgctgctgctgttggcagccagagttttgccagtagtcagcaccctggaagtgccatggcgaatgccagtaatggtacaggtaccggaaatgactttgctgATAGATATCATGGCAGCGGTGGCCAATTCGGTAGCAATCAAAGCAGCAATGTGGGTCAACATGGTCGAGATTTTGGAGGCTCGTTCGACGAAGATTTCAGGATCGGCAATTATGAAAATGATGCCTTTGCTGGACGGGCATGA 2025 0.2598 MWCAEYNFSVYVFSQVAGMAFFGRVGNILRQATNQKIGLEIRSLSSVFQATRCMSNAPNSRLFIGGVSYSIDAQSLGEICSQYGQVVDARIIMDRETGRHRGFGFITYSNVDEASRALQALDGQDLDGRRVEVKFAIERSHGFGGGGFGGSYGNTPYDAGAGTGHPGSYGNTPYGAASGGYDNTGGGNAAGVYGRGEDGGGGNWPSGNFGGSSFGNNYGDAGVYAGNSAGGYDNNGYGGGSGGDAGPYGSNAARDYDNGVGGSGSSFGDRSSGKNYGDAGAFRANAASEYGGGSGGSFGDSSSVNNYGAGGGYNGTGTSYRNAGSFATSNPYNDGPGAAGFGKNNNYDSSAGFGSGSRYGSAAAAGGRQSFAGSQHPGSAMANASDGTDTGNGFAGGSYGNAGSFATSKTYNDGTGAAGFGKNNKYDSSAGFGSSSRYDSAASVGNQSFAGKQHPGMVNGSDGTGTGNGFAGGSYGNAGSYATSNTDKDGTGAAGFGKNNNYDSSAGFGSGSRYGSAAAGGRQCFAGSQHPGIAMANASDGTDTGNGFAGGSYGNAGSFATCNSYNDGTGTAGFGKSNKYDSSAGFGSSSRYGSAAAVGSQSFASSQHPGSAMANASNGTGTGNDFADRYHGSGGQFGSNQSSNVGQHGRDFGGSFDEDFRIGNYENDAFAGRA 674
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Gma06g01826 674 Gene3D - 31 154 IPR012677 -
Gma06g01826 674 ProSiteProfiles Eukaryotic RNA Recognition Motif (RRM) profile. 60 138 IPR000504 GO:0003723
Gma06g01826 674 PANTHER HETEROGENEOUS NUCLEAR RIBONUCLEOPROTEIN 87F-RELATED 19 582 - -
Gma06g01826 674 Pfam RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain) 62 131 IPR000504 GO:0003723
Gma06g01826 674 MobiDBLite consensus disorder prediction 635 658 - -
Gma06g01826 674 SMART rrm1_1 61 134 IPR000504 GO:0003723
Gma06g01826 674 MobiDBLite consensus disorder prediction 635 649 - -
Gma06g01826 674 SUPERFAMILY RNA-binding domain, RBD 56 167 IPR035979 GO:0003676
Gma06g01826 674 PANTHER GLYCINE-RICH RNA-BINDING PROTEIN 3, MITOCHONDRIAL 19 582 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Gma06g01826 Gma-Chr6 19363160 19366867 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Gma06g01826 58 141 Eukaryotic Initiation Factors Gene Family AT3G16380 39.080 7.70e-10 60.1
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Gma06g01826 K12741 - gmx:100801928 1141.72
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Gma06g01826 06 19363160 19366867 Gma06g01826 06 19363160 19366867 ECH