Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Glsi06g2070 ATGCTGAATATGGCTTGGAATCTGAAGCCAAAGTTATATGTTCCTGTCGTGTTTTTACTGTTATCCATTCTTTTGTTTGGAATTTCAAACGCTGAAGTTGAACATGAAGTTTCACAAAAGCTTAGAGCTGCCCCACATAAGAATGTAGGAAGCAAGGTCATTGATGGCACTGGTGTAGAGAATTCCTTTTCTTTTGAGGACACCAATAGTGTGCTGGGTGATAGGAAGGGTAGAAGCAGTAAAGTTTCTGTTTCAACAGTCGCATTATTCACCTTGGCAATGGCAGCTGCCACCGGTTTAGGTGCTGTACCCTTCTTCTTTGTGGAACTTGATCCACAGTGGGCTGGATTATGCAATGGAATGGCAGCAGGTGTCATGTTGGCTGCAAGCTTTGATCTCATACAGGAAGGGCAGGATCACGGTGCTGGAAACTGGGTTGTGACTGGGATTCTTGCTGGTGGCATTTTTATTTGGCTATGTAAGAAGTTTCTAGAGCAATATGGGGAAGTAAGTATGTTGGATATAAAGGGTGCTGATGCAACAAAAGTTGTTCTAGTTATTGGAATAATGACCCTCCATTCTTTTGGGGAGGGTTCTGGGGTTGGGGTCTCCTTTGCTGGCACAAAGGGTTTCTCTCAAGGCCTGTTGGTTACTTTGGCTATTGCTGTTCACAACATACCAGAGGGATTAGCAGTGAGCATGGTGCTAGCATCAAGGGGTGTTTCCCCACAGAATGCTATGTTATGGAGTGTAATAACTTCTTTACCTCAGCCAATTGTAGCAGTTCCTTCATTTATATGCGCTGATGCATTCAGTAAGTTCCTGCCTTTCTGTACGGGGTTTGCTGCTGGATGTATGATCTGGATGGTTGTTGCAGAAGTGCTACCTGATGCATTCAAGGAAGCCTCTGCTTCCCAGGTTGCATCAGCAACAACCCTTTCTGTAGCATTTATGGAAGCTCTCAGCACCTTCTTTCAGAATTTCAGCCATGATTACAACTCTGAAGATGCTTCTGGCTTCTTTGTTTCATTACTTTTTGGCCTTGGCCCATTACTTGGGGGCATCATTCTGGTTGCATTTGCTCTTGCTTTCCATCTTAAGCATGCTCTCCTTATGGGCACCGCTTGTGGGATTGCCTTTGTTCTTGGTGCTTGGCGACCAGTGCAGCTTATTTTGTCTTCAAAATTGGGATTTTTTCCTGTTGTGTTACTCATTGCAATGGGGGCTGCTTTCGTCCATGTCTCTAGCTCTGGTGTATTGAAGGTGGCAGTTCGCAAAAAAGCTTCAGTCAATGACTTACCTACACTCACTGGGTTCCCACTGAGTGTTCACACCCTTCAATCATTCATATCATGCGGAACAGTTGCTTTTCATGCTTTGGCTGAAGGACTTGCGTTGGGAGTGGCTGCACCAAAAGCTTATGGACTTGGTCGTCACATGGTCCTTCCAGTCTCTCTACACGGCCTCCCTAGGGGAGCAGCTGTGGCTAGCTGCATCTTTGGTGCTACTGATAGTTGGCATGCTTCCCTTGCTACAGCTGCCATAATTGGATTTATGGGCCCAATATCAGCAATTGGAGCTATTCTCGCCGGCATTGATTATAGTGGTCTTGACCATGTGATGGCTTTTGCTTGTGGCGGATTAATTCCAAGCTTTGGAAATGTCGTTAAAAGAGCGCTAAGTTTGGATAAGCAGAAGAGCACCTGCGGCCTCATTATGGGTATTGGGTTTGCTATTTTATGTCTGACTTTCACGAGGTTGGTTTGCTTGCATACACCTTACTGCAATTCTGCACCAGAAGCTGTCAGATAA 1812 0.4531 MLNMAWNLKPKLYVPVVFLLLSILLFGISNAEVEHEVSQKLRAAPHKNVGSKVIDGTGVENSFSFEDTNSVLGDRKGRSSKVSVSTVALFTLAMAAATGLGAVPFFFVELDPQWAGLCNGMAAGVMLAASFDLIQEGQDHGAGNWVVTGILAGGIFIWLCKKFLEQYGEVSMLDIKGADATKVVLVIGIMTLHSFGEGSGVGVSFAGTKGFSQGLLVTLAIAVHNIPEGLAVSMVLASRGVSPQNAMLWSVITSLPQPIVAVPSFICADAFSKFLPFCTGFAAGCMIWMVVAEVLPDAFKEASASQVASATTLSVAFMEALSTFFQNFSHDYNSEDASGFFVSLLFGLGPLLGGIILVAFALAFHLKHALLMGTACGIAFVLGAWRPVQLILSSKLGFFPVVLLIAMGAAFVHVSSSGVLKVAVRKKASVNDLPTLTGFPLSVHTLQSFISCGTVAFHALAEGLALGVAAPKAYGLGRHMVLPVSLHGLPRGAAVASCIFGATDSWHASLATAAIIGFMGPISAIGAILAGIDYSGLDHVMAFACGGLIPSFGNVVKRALSLDKQKSTCGLIMGIGFAILCLTFTRLVCLHTPYCNSAPEAVR 603
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Glsi06g2070 603 Pfam ZIP Zinc transporter 179 303 IPR003689 GO:0016020|GO:0030001|GO:0046873|GO:0055085
Glsi06g2070 603 PANTHER ZINC/IRON TRANSPORTER 89 314 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Glsi06g2070 Glsi-ChrGlsi06 67910906 67916168 Dispersed
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Glsi06g2070 06 67910906 67916168 Glsi07g2211 07 67270203 67276369 CCT
Glsi06g2070 06 67910906 67916168 Glsi06g2070 06 67910906 67916168 ECH