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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Glsi03g1869 ATGTCTGCCTTTCCGGTTGGCACTCATTCGTCCCTATTCCAACATTTGCGTAACCGATCAGTTCACTCTCCATTTCACGACCTTCGTAGTTTGGAGTCTTTTTTATCATCTTGCCCCTTCTTTGGCCCTTCTTCTTGTATAACTAGAGGTCTCGGGATGCTTAGTAATCATGTATTAGCACGGGTAGAAGACCAAGCTAGAGGTTCTACTTCTTCGTTTCAGCCACAACAAGCTCAACAAACTTTCGAGAAACAGTTACAGAACTTGACTTCAGAATCTGGAACTTGTGATCTGCTATCAGCTGCAACTGGAGCAGTGGCAATTAACCAGTCTTGGGAAGCTGCTAATCAAGATCTTGCTATGGCTTTGCTATTTGCAATAGGATATGCAGGCATCATATTTGGAGAATTTCTAGCCTTCAATAAAAGTGGAGTAGGACTTTTGATGGCCGTAAGCTTATGGGTGATACGGAGTATTGGGGCTCCTTCAACTGATATAGCTATTTCAGAGTTCACACATGCATCCGCAGAAGTCAGTGAAATAGTGTTTTTCTTGCTTGGCGCAATGACCATTGTTGAGATAATTGATGCTCATCAAGGTTTTAAGTTGGTTACTGACAAAATAACAACTCGAAAGCCCCGCCTTCTCCTTTGGGTGATTGGGATTGTCACATTTTTTCTCAGTTCAGTCCTAGACAACCTGACAACTACCATAGTCATGGTTTCTCTGTTGCGGAATCTAGTGCCTCCATCAGAGTATCGAAAGATTCTTGGAGCTGTTGTTGTTATAGCTGCAAATGCTGGTGGTGCATGGACTCCTATTGGTGATGTTACCACTACTATGCTATGGATACATGGTCAAATATCCACTTTGCCAACAATGAAGGGGTTGTTTGTACCTTCAGCTATTTCTCTAGCTGTCCCTCTAGCTCTTATGTCCCTGACTAGTGAAGTTAATGGGAAGGGACTGGATTCTCCCAATATCTTGGCATCTGAACAGATGGCTCCTCAAGGGCAGCTTGTTTTCTCTGTGGGTCTAGGAGCTTTGATTTTTGTGCCAGTGTTCAAGGCCCTTACAGGCTTACCTCCTTACATGGGTACATTGCTTGGACTTGGTGTACTTTGGATCCTCACTGATGCTATTCACTATGGTGAATCTAAAAGACACAAGCTAAAAGTACCACAAGCCTTGTCAAAGATAGACACTCAAGGAGCACTATTCTTCCTTGGAACTCTATTATCTGTTAGCAGCCTGGAGGCAGCGGGGATTCTTCGGGAAATAGCAAATTACCTTGATGCTCATATTCCAAATGCTGAATTGATTGCAAGTGCTATTGGAGTCATATCTGCAATAACAGACAATGTTCCATTAGTTGCAGCAGCTATGGGAATGTATGATCTCTCCTCTGTCCCTCAGGATTCTGAGTTTTGGCAGTTGATTGCGCTTTGTGCCGGTACTGGTGGATCCATGTTAGTTATTGGCTCGCCTGCTGGAGTTGCATTGATGGGGATGGAAAACGTCCACTTCTTTTGGTACTTACGGAAGGTTAGTGGCTTTGCTTTGGCAGGTTATGCTACTGGTATTGCTGCATATTTATTAGTTAATAACCTCCACATCAACTTACCTACAGCTCTGGGTGAGGTTCCTTTTCTTTCTAGTATATAA 1665 0.433 MSAFPVGTHSSLFQHLRNRSVHSPFHDLRSLESFLSSCPFFGPSSCITRGLGMLSNHVLARVEDQARGSTSSFQPQQAQQTFEKQLQNLTSESGTCDLLSAATGAVAINQSWEAANQDLAMALLFAIGYAGIIFGEFLAFNKSGVGLLMAVSLWVIRSIGAPSTDIAISEFTHASAEVSEIVFFLLGAMTIVEIIDAHQGFKLVTDKITTRKPRLLLWVIGIVTFFLSSVLDNLTTTIVMVSLLRNLVPPSEYRKILGAVVVIAANAGGAWTPIGDVTTTMLWIHGQISTLPTMKGLFVPSAISLAVPLALMSLTSEVNGKGLDSPNILASEQMAPQGQLVFSVGLGALIFVPVFKALTGLPPYMGTLLGLGVLWILTDAIHYGESKRHKLKVPQALSKIDTQGALFFLGTLLSVSSLEAAGILREIANYLDAHIPNAELIASAIGVISAITDNVPLVAAAMGMYDLSSVPQDSEFWQLIALCAGTGGSMLVIGSPAGVALMGMENVHFFWYLRKVSGFALAGYATGIAAYLLVNNLHINLPTALGEVPFLSSI 554
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Glsi03g1869 554 PANTHER SODIUM/PROTON ANTIPORTER 1-RELATED 77 552 IPR045016 GO:0006814|GO:0015297
Glsi03g1869 554 Pfam Citrate transporter 133 485 IPR004680 GO:0016020|GO:0055085
Glsi03g1869 554 NCBIfam sodium:proton antiporter NhaD 146 376 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Glsi03g1869 Glsi-ChrGlsi03 80397288 80402744 Dispersed/Proximal
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Glsi03g1869 1 552 Antiporters AT3G19490 69.573 0.0 744