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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Gabi3532g00001 ATGACTATCACAGTTTCTATTTCCAAACGCATGAGTTACATTTACACTTATAATTACACCTTCTTCTTGAACAAGTTGTTCCTCCCTGTGTTTTTTGCTTATGTGATTGTTCATTATTTCCACTCTCCCGAAGTTGTGGTTGAGACTAACCTCTCTTCCTTTGATGGCAATAGTGAGAATGATTGCAAGAGCTTAAACACCATTGGTGACTACAAAGCCAAGTGTATGTACCTTAAATCCAATGACCCATGTGTCTCTCAGGGCTATATTGATTACCTTTACCTTTTCTATTGCAAATTTGGGAGTTTCCCTTTATTGGGTCCTAGTCTCCTAATTTGTTGGCTCTTAGTCATGTTTCATCTATTGGCTAACACAACTTCTGAATATTTCTGTCCTTCCCTTGATAACCTATACAAATCACTGAGGTTGTCCCCAACAATTGCTGGAGTGACCCTTGTCGCTCTTGGCAATGGTGCCAATGATGTTTTCTCAAGCCTTGTCTCTTTTCAGGGTAATGGGACTCACAGCATTGGCTTTAACACAGTTCTTGGGGGTGTTTCCTTTGTGTCCTGTGTTGTGGTGGGGATAGTGAGCATTTCAATAAGTCAAAGGGGGATCCGAGTGATAAAATCTGATTTTCTGAGAGATGTTTGTTTTCTTCTTTCGGCTATTGTCTACTTGTTTAGTATTTTGATCACGGGTGAGATCAATGTTTTTGGAGCAATTGGTTTTCTTTCTATGTATGTGGTGTATGTGATTGTTGTTTGTGTCTCTTCTTCTACCGGATGGAAGGGTGGCTCTGTTGATGATGCTAAAATGAAGAGTACTAGTTCAAGTTCTGGTGATGACTTGAATGTGCCTCTTCTCATAAATGGTACAGATAAAGGATCAATTGATTGTGTTGAAAATGGTGCTCAAGTATGTGACATGAATTTGATATCTTCAATATATCGAATGTCGCTTTATATCATGGAGATGCCCCTTTACTTGCCTACAAGGTTGACAATTCCTATTGTTGGTGAAGAGAATTGGTCAAAGCCTTATGCAGTTTCTTCAGTGATATTAGCACCTCTTCTCTTGTCTGTCCTGTGGTACCCTTATAAGGAAAACAGTTTTTCGAGCACAAATTTTACTGTTTATGGAATTGGATTATTGGTTGGAATTATATTTGGTGTGATTGCATTTTTCACAACAGAAATGTCAAAGCCACCAAGGCACTTTGCTTGGCTTGCAGGAGGGTTTGTAATGAGTGTGACTTGGAGCTACATTTTAGCTCAAGAGTTGGTGGGGTTGTTGGTTTCAATTGGCTACATATGTGGAATAAGTCCTTCAATATTGGGGTTAACAGTTCTTGCTTGGGGGAACTCACTCGGGGATTTGATGACAAATGTGACTATGGCTTTAAATGGTGGACCAGAGGGTGCTCAAATAGCAATATCAGGTTGCTATGCTGGTTCTATCTTCAATGCTGTTGTTGGGTTGGGCTTGTCTCTTGTGTCTTCAACATGGTCACAGTACCCACAACCTGTAGTGATTCCTAGAGATCCATATCTCTTGGAGACATTGGCATTTTTGGTTGTTGGATTGGTTTGGGCACTTGTGGTTTTGATAAGAAGAGATATGAAGCTTGATGGACTCTTAGGAAAAGGGCTTTTAATTGTTTACTTCATTTCTTTGTTGAAGAGGCTGATTTAG 1695 0.3976 MTITVSISKRMSYIYTYNYTFFLNKLFLPVFFAYVIVHYFHSPEVVVETNLSSFDGNSENDCKSLNTIGDYKAKCMYLKSNDPCVSQGYIDYLYLFYCKFGSFPLLGPSLLICWLLVMFHLLANTTSEYFCPSLDNLYKSLRLSPTIAGVTLVALGNGANDVFSSLVSFQGNGTHSIGFNTVLGGVSFVSCVVVGIVSISISQRGIRVIKSDFLRDVCFLLSAIVYLFSILITGEINVFGAIGFLSMYVVYVIVVCVSSSTGWKGGSVDDAKMKSTSSSSGDDLNVPLLINGTDKGSIDCVENGAQVCDMNLISSIYRMSLYIMEMPLYLPTRLTIPIVGEENWSKPYAVSSVILAPLLLSVLWYPYKENSFSSTNFTVYGIGLLVGIIFGVIAFFTTEMSKPPRHFAWLAGGFVMSVTWSYILAQELVGLLVSIGYICGISPSILGLTVLAWGNSLGDLMTNVTMALNGGPEGAQIAISGCYAGSIFNAVVGLGLSLVSSTWSQYPQPVVIPRDPYLLETLAFLVVGLVWALVVLIRRDMKLDGLLGKGLLIVYFISLLKRLI 564
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Gabi3532g00001 564 PANTHER NA+/CA2+ K+ INDEPENDENT EXCHANGER 315 563 - -
Gabi3532g00001 564 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 113 255 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
Gabi3532g00001 564 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 410 560 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
Gabi3532g00001 564 Gene3D - 349 561 IPR044880 -
Gabi3532g00001 564 Gene3D - 143 281 IPR044880 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Gabi3532g00001 Gabi-Chr3532 9825 11519 Dispersed
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Gabi3532g00001 11 564 Antiporters AT5G17850 50.177 7.12e-163 474
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Gabi3532g00001 K13754 - gmx:100813848 686.797