Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Gabi2415g00002 ATGGCTATAACAGTTTCTATGCCTAAACGCATGGGTTGCTACACCTTGTTCTTGAACATCTCTTTCCTTATGGGGATTTGTGCTTTCATGATTGTTCATTTTCACTCTCATGAAGCTTTGGTTATGAGCAACAACTCTTCCTCTGATGACAATGATGAGGATGATTGCAAGAGCTTACACCACATGGGTGACTACAAAGCCAAGTGCATGTACCTGAGATCCAATGACCCATGTGACTCTCAGGGCTATATTGATTACCTTTACCTTTTCTATTGCAAATTTGGGAGATTCCCTCTATTGGGTCATAGTCTCTTGTTTCTTTGGCTCCTAGTTCTACTTTATCTGTTGGCTAACACAACTTCTGAGTATTTTTGTTCTTCCCTTGAAAACCTGTCCAAGTTACTGAGATTGTCCCCTACAATTGCTGGAGTCACCCTCCTCTCTCTTGGCAATGGTGCCTGTGATGTTTTCTCAAGCCTTGTCTCTTTCCAGGGAAGTGGGACCCAAAGCATTGGTTATAACACAGTACTTGGGGGTGTTTCTTTTGTGACCTGTGTTGTGGTGGGGATAGTGAGCATTTCAATACGTCACAGGAGGGTTCAAGTCATAAAGTCTGCTTTCGTAAGAGATGTTTGTTTTCTCCTTTTGGTTCTTCTTTGCTTGTTTATTATTTTTGTCACTGGTGAGATCAATGTTTTTGGAGCAATTGGTTTTACTTTGATGTATGTGGTGTATGTAATTGTTGTTTATCTCTCGTCTACCCGATGGAAGGAGGGTTATGGTGGTGATGTTGAAAGGAATGTTAATAATATTTCAAGTTATGGCAATGACTTGAGTTTGAGTGTGCCTCTTCTCAGTGGTATGAAGAAAGGACCGATTGATTGTGTTGAAAATGGTGGTCAAGAATATGATTTGAATATCAATAACAATTGCTGCTTGATGAGATCTTCGATATGTCGAATGTCACTTTATGTGCTGAATTTGCCACTTTACTTGCCTAGGAGATTGACAATTCCTGTTGTTTGTGAAGAGAGGTGGTCAAAGCCTTATGCAGTTTGCTCAGTGATACTAGCACCACTTCTCATGTCTGTTATATGGACCACTAACAAGGAAAAAAGTTTCTTCAGCAGCACAAACCTAATTGTTTATGGAATTGGACTCTTGGTTGGAGTTACATTTGGTGTAACTGCATATTTTACAACAGAAATGTCAATGCCACCAAAGAAGTGCTTATTTCCTTGGCTTGCAGGAGGGTTTATAATGAGTGTTACTTGGAGCTACATTTTAGCTCAGGAGTTGGTGGGGTTGCTGATATCAATTGGCTACATTAGTGGAATAAGTCCTTCAATATTGGGATTAACAGTTCTTGCTTGGGGGAATTCAATTGGTGATTTGATGACAAATTTAACAATGGCTTTAAATGGTGGACCTGAGGGTGCTCAAATAGCAATATCAGGTTGTTATGCTGGCCCTATCTTTAATACTGTAGTTGGATTAGGCTTGTCTCTTGTAACTTGTACATGGTCAGAGTACCCACAACCTGTTGTGATTCCTAGAGATCCATATCTCTGGGAAACATTGGCATTTTTGGTGGTGGGATTAGTTTGGGCACTTGTGGTTTTGATAAGAAGAGATATGAAGCTTAATGGACTCTTAGGAGGAGGGCTTTTAGTTGTTTACTTCATTTCTCTGTTTCTGAGGCTGATTCAGACACAAAGGTCTCTCCAATTTTATGATTTTTTAGGCTTAAATTCTTAG 1758 0.3982 MAITVSMPKRMGCYTLFLNISFLMGICAFMIVHFHSHEALVMSNNSSSDDNDEDDCKSLHHMGDYKAKCMYLRSNDPCDSQGYIDYLYLFYCKFGRFPLLGHSLLFLWLLVLLYLLANTTSEYFCSSLENLSKLLRLSPTIAGVTLLSLGNGACDVFSSLVSFQGSGTQSIGYNTVLGGVSFVTCVVVGIVSISIRHRRVQVIKSAFVRDVCFLLLVLLCLFIIFVTGEINVFGAIGFTLMYVVYVIVVYLSSTRWKEGYGGDVERNVNNISSYGNDLSLSVPLLSGMKKGPIDCVENGGQEYDLNINNNCCLMRSSICRMSLYVLNLPLYLPRRLTIPVVCEERWSKPYAVCSVILAPLLMSVIWTTNKEKSFFSSTNLIVYGIGLLVGVTFGVTAYFTTEMSMPPKKCLFPWLAGGFIMSVTWSYILAQELVGLLISIGYISGISPSILGLTVLAWGNSIGDLMTNLTMALNGGPEGAQIAISGCYAGPIFNTVVGLGLSLVTCTWSEYPQPVVIPRDPYLWETLAFLVVGLVWALVVLIRRDMKLNGLLGGGLLVVYFISLFLRLIQTQRSLQFYDFLGLNS 585
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Gabi2415g00002 585 PANTHER NA+/CA2+ K+ INDEPENDENT EXCHANGER 20 574 - -
Gabi2415g00002 585 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 106 250 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
Gabi2415g00002 585 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 415 567 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
Gabi2415g00002 585 Gene3D - 137 267 IPR044880 -
Gabi2415g00002 585 Gene3D - 350 568 IPR044880 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Gabi2415g00002 Gabi-Chr2415 189310 191113 Dispersed/Tandem
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Gabi2415g00002 17 571 Antiporters AT5G17850 52.952 1.72e-175 507
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Gabi2415g00002 K13754 - gmx:100813848 773.081