Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Gabi1554g00010 ATGGCTACAACTGTAGTTTCTGTGTCCAAACGCATGGGTTTCACCTTGTTGTTGAACACCTTGTTCCTCGTTATGCTTTGTGCTTTGGTGATTGTTCATTTCCACTCTTCAGAACATGTTGTTCTGAGGAGGATCAACCCCTTTGGCTTGGGGGGCGGTGGTGACCAAGGTTGCAAGAGCTTCCACAGTCTGGGTGACTATAAAGCTAAGTGCTTGTACCTGAAATCCAATGACCCTTGTGTCTCTCAGGGCTTTGTTGATTACCTTTACCTTTTCTATTGCAAACTTGGGGGATTCCCTTTATTGGGTCACAGTGTTTTGTTTCTTGGGTTATTGGTACTGTTCTATCTGCTGGCTAACACAGCTTCTGAATACTTTTGTCCTTCCCTTGAAAAATTGTCCAAATTGCTGAGGCTCTCACCTACAATTGCTGGAGTGACTCTTCTCTCTCTTGGCAATGGTGCATGTGATGTTTTTGCTACCCTTGTTTCTTTTAATGGTAGTGGGACCCGCGGCATTGCCTTTAACACTGTGCTTGGTGGTTCTTCCTTTGTGTCCTGTGTTGTGGTGGGAATAGTGAGCATTTCAATTCGTCACAGGGGAATTCGGGTTAAGAAGGATGCTTTGATAAGAGATGTTTGTTTTCTTCTCCTTGTTCTTCTATGCTTGTTCATCATTTTGATCGCTGGTGAGATCAATGTTCTTGGGTCAATTGGTTTTTGTTTGCTTTATGCGGTGTATGTTATTGCTGTTTATGTCTCATCTACCCGAAGGAAGGGTGTCTGTGAGGATGCTGAAAGTGATGGCGATTCAAGACATGGCAGTGATTTAGGTGTCCCTCTGCTATGTGAGATGGAGAAAGGACAGATTGATTGTGCTGCAAATGGAGCTCAGGAATGTGACTTGAATATTAAGAAATGTTGCTGTAAGAAATTTTCAATACGTGGAGTGTTACTTTATGTCTTGGAGATGCCCCTTTACTTGCCTAGGAGATTGACAATACCTGTTGTTTGTGAAGAGAGATGGTCCAAACCTTATGCAGTTTCTTCAGCTATGCTAGCACCACTTCTCTTGTCTTTCCTATGGATGGGAAAGGAAAACAATGACCTTAACTCGAGCCTTATATTTTATGGAATTGGATCATTGATTGGAATTATATTAGGGGTAACTGCATTTTTCACAACTGAGGTGCCAAGCCCACCAAAAAAGTACTTGTTTCCTTGGCTTGCAGGAGGGTTTGTGATGAGTGTGACCTGGAGCTACATTACAGCTCAGGAATTGGTGGGGTTGTTGGTTTCACTTGGTTACATATGTGACGTAAGTCCTTCAATACTGGGGCTAACGGTTCTTGCCTGGGGAAATTCACTTGGGGATTTAGTAACAAATTTGACAATGGCTTTAAATGGTGGACCAGAAGGTGCTCAAATAGCAATATCAGGTTGTTATGCTGGCCCTATCTTCAATACAGTAGTAGGATTGGGCTTATCTCTTCTGAGCTCTACTTGGTCAGTGTACCCTTCATCTGTTGTGATCCCTAGAGATCCATATCTGTGGGAGACATTGGCACTTTTGGTGGTTGGATTGGTTTGGGCACTTGTAGTTTTGATTAGAAGAGATATGAAGCTTGATGCACTCTTAGGAGGAGGGCTTTTAGTTGTTTACTTCATATCTATGTTCCTGAGGCTGATTCAAACACTTGGGTCTCTCCAATTCCAGGATATGTTAGGCTTCATCTTCAAAAGATGA 1746 0.4273 MATTVVSVSKRMGFTLLLNTLFLVMLCALVIVHFHSSEHVVLRRINPFGLGGGGDQGCKSFHSLGDYKAKCLYLKSNDPCVSQGFVDYLYLFYCKLGGFPLLGHSVLFLGLLVLFYLLANTASEYFCPSLEKLSKLLRLSPTIAGVTLLSLGNGACDVFATLVSFNGSGTRGIAFNTVLGGSSFVSCVVVGIVSISIRHRGIRVKKDALIRDVCFLLLVLLCLFIILIAGEINVLGSIGFCLLYAVYVIAVYVSSTRRKGVCEDAESDGDSRHGSDLGVPLLCEMEKGQIDCAANGAQECDLNIKKCCCKKFSIRGVLLYVLEMPLYLPRRLTIPVVCEERWSKPYAVSSAMLAPLLLSFLWMGKENNDLNSSLIFYGIGSLIGIILGVTAFFTTEVPSPPKKYLFPWLAGGFVMSVTWSYITAQELVGLLVSLGYICDVSPSILGLTVLAWGNSLGDLVTNLTMALNGGPEGAQIAISGCYAGPIFNTVVGLGLSLLSSTWSVYPSSVVIPRDPYLWETLALLVVGLVWALVVLIRRDMKLDALLGGGLLVVYFISMFLRLIQTLGSLQFQDMLGFIFKR 581
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Gabi1554g00010 581 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 409 561 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
Gabi1554g00010 581 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 109 252 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
Gabi1554g00010 581 Gene3D - 348 562 IPR044880 -
Gabi1554g00010 581 Gene3D - 139 263 IPR044880 -
Gabi1554g00010 581 PANTHER NA+/CA2+ K+ INDEPENDENT EXCHANGER 309 570 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Gabi1554g00010 Gabi-Chr1554 100284 102832 Tandem
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Gabi1554g00010 9 570 Antiporters AT5G17850 52.632 3.73e-171 495
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Gabi1554g00010 K13754 - gmx:100787016 768.459