Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Enph5g0627 ATGGCTTTTTTTGGTAGAGTTGGGAATTTACTAAGACAGGCTGCAAATAAGCAGCTCAGTTCAGAGTTACGTTCAGCTCCATATATTTTCCAGGCTATACGGTGCATGTCATCTGCTGCAACTTCAAGGGTGTTTGTAGGAGGATTGTCATATTCCACTGATGAGCAAAGTTTGAGAGAGACTTTTGCAAAATATGGCGAAATAGTTGATGCAAGGATAATTATGGATCGTGACACTGGTAGATCTAGAGGATTTGCCTTTGTTACTTTCACATCAGTTGAGGAAGCATCAAGTGCCATTCAGGCTTTGGATGGACAGGACCTTCATGGTCGCCGAGTTAGGGTGAATTACGCTAATGATAGGCCTCGTGGATTTGGTGGTGGTGGTGGTTTTGGTGGTCCTTATGGTAATGCTGGCTATGGAGGTGCTGGTGCTGGTTACGGAGGTGGTTATGGCAACCCTTCCTATGGTGGTTCTGGGGCATATGGTGGCAATGCTGCTGGAGGTTATGGTGGCGGTGGATATGGTGGAGCAAGCTATGGACCAGGTGGCAATTTCAGTGGCAGCACTGACAATAACTATGCTTCTAACAGTTTTGGAACTGAAACTGCAGGTAGCAGTTATGGGAATGATGCTAACATTGGGAGTGGAAGCCCTTATGCTGGTGGAAGCAGTGGAGGATATGGTGGTAACACTGGAAGTGGAGTTGCCGCTGACAGTTTTGGTTCTGGAAGTGCTGGGGGCAGCTTTGGTGGGAGTACATATGCTGGTGGCAGTAGTGGAGGCTATGGTGGCAATGGTGGGAACTTTGGTGTTGCTGGCGGTGGTGGAGGTATTGATAGCTTTGGCAGTGCTGGATTTGGCAACAGTGATAACTTTGGCAGTTCAGCTGGTTTTGGTGCTAGTGGTTGTTCAGGCTCGAGCAGCAGCTTTACCAGTGGATATGGTGGAGACACTGGCAGTGGCGATCAAATAGATGGCAAAGAAAGCAGCAGTAGAGTTAATTTTGAGGATGTTGAAGATATTAAGGATCCGATAGAGGAAAACTATCGGGATGATGATGATGCTGGTAATTTTGCCAAAAGGGCTTGA 1092 0.4716 MAFFGRVGNLLRQAANKQLSSELRSAPYIFQAIRCMSSAATSRVFVGGLSYSTDEQSLRETFAKYGEIVDARIIMDRDTGRSRGFAFVTFTSVEEASSAIQALDGQDLHGRRVRVNYANDRPRGFGGGGGFGGPYGNAGYGGAGAGYGGGYGNPSYGGSGAYGGNAAGGYGGGGYGGASYGPGGNFSGSTDNNYASNSFGTETAGSSYGNDANIGSGSPYAGGSSGGYGGNTGSGVAADSFGSGSAGGSFGGSTYAGGSSGGYGGNGGNFGVAGGGGGIDSFGSAGFGNSDNFGSSAGFGASGCSGSSSSFTSGYGGDTGSGDQIDGKESSSRVNFEDVEDIKDPIEENYRDDDDAGNFAKRA 363
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Enph5g0627 363 Pfam RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain) 44 114 IPR000504 GO:0003723
Enph5g0627 363 Gene3D - 12 137 IPR012677 -
Enph5g0627 363 ProSiteProfiles Eukaryotic RNA Recognition Motif (RRM) profile. 42 120 IPR000504 GO:0003723
Enph5g0627 363 PANTHER HETEROGENEOUS NUCLEAR RIBONUCLEOPROTEIN 87F-RELATED 31 246 - -
Enph5g0627 363 MobiDBLite consensus disorder prediction 330 363 - -
Enph5g0627 363 MobiDBLite consensus disorder prediction 300 329 - -
Enph5g0627 363 SMART rrm1_1 43 116 IPR000504 GO:0003723
Enph5g0627 363 MobiDBLite consensus disorder prediction 300 363 - -
Enph5g0627 363 SUPERFAMILY RNA-binding domain, RBD 41 152 IPR035979 GO:0003676
Enph5g0627 363 CDD RRM2_NsCP33_like 43 118 - -
Enph5g0627 363 SMART rrm2_1 43 116 IPR003954 GO:0003676
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Enph5g0627 Enph-Chr5 5045895 5048931 Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Enph5g0627 40 134 C2H2 Transcription Factor Family AT2G19380 31.579 2.26e-10 60.1
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Enph5g0627 K12741 - gmx:100799124 204.912