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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Dere08g0186 ATGAAGTCGACCAGAGAGAAAGATAGCAATCGAGGCGTCAGCTTGCAAATGCACAACCTCCATCAACGTCTTCTTGATGCGCTGAACCTAGGCATCAGACATTTTGACGAGAAGACAAATAGATTGAAGTGGCAGAGCGCAAATATTGAAGTACAGAAACAAGTAATACGCTCAATTGATGCCTTCCTTGATTCTATTTCTGGAGATACACGTGCAGCACATCATACTATTGTAAAGGAATCTGTTGCAGATATTTTGGGAGCATTATTATGGATTCTTCAATGCAAAAGTAGACCCTTATTATGTATGGCATCAAATGTAGCAGTAAAGTTAGTTAGCGTTTTACCACATTCAGTACTGCAATCTTATATATTAGATCTTGTCCATGCTCTATCATCCTTGCTATCGTCACCTCAAACAGAAGTTTCTATACCCTGTTCTACTTCCTTGAATTTGGTAATCTCAAATTTAAGTGCTACAAGTGAGAAGGCTGTTTGGGAGGTATTGAAAGAGACGGAATGTGTCATTCATATTGTTGACAAGATAAACGATTTTACTGGAGGTGGAGGTCCGATGAAAATTGATTATTTTGAAGAGATGACTTCACTTTTGAGCTCAATACTGTTGCGGTGGCCTCCAACTCGGTTTCCTGTATGGAATGACGTTAAACTAATGACGGCTTTGGCAGATATGCATATGAGGACAGATAGCTCTATTAAACTTGTAATTTTGAAGTTGTACACATCTTTAGGTATTAATAATATTTTATTCCAGCTCCTCTCCTTACAAGAAGTACTTTTCCTTGTTATATTTGATTCTCAAGCAATTAGGTCAACTGATTTACAATTTATTTTACCAGCTTTATGTGGTTCTGTGGCCGAAAAACTTATGGAGAATGGAGAAGTCTTTGTACAAATGGTTGTGCAATCCATGGGAAAATCAAACCCTCATGCTGTTAGAATAGAAGGCTTTAAACTAGCTCAATGTCTATTGAAATCCCAAGTGAATTTTTTGAAAGTGATGAATACATGTGCTGAAGCTCTTGTTGATGCCATAATTTGTGGGATGGGAGAAACAAGGATGCATTCTAGAAAATTTGGAAATACGAGTAGTTCTATCTTAGTGGAAGCATGTCGATTGGGTTTGGTAACTCGTTGGGTGGGTGAGCATCATATTAAATTTTGGAAGCAAAGAATTGACAGAGTCCTCCTTAATCTTTTAATAGAAAATGTTCAGGATATATCAGATGAACATGTCTTGTCATTGGAAAAACAAATATCCATAGTGAAGGAGGGTTTAAAAGCCAATTATCATCTTGGTGTGAGGGGCTACGTGTGGGACATTCTTGGGTGGCTTGCAATACACTCCGGAGAAAATTTCAACCATTGTACATATGGAACTGAGCTCCACGTCAACTTACTCATCACATGTGCATGCTTGACTTTTGCGGACGTGAGTGAAAAATGGTGCCGAATATGTCAACAGGATGATGGTCATAGTTTTCAAAGTGAACCAGCATCAAGAGCTGTTCTAATGATGATTTATTCTCCATGTAATTACATTTCATCCCAGGCCAGACTCATATTATCTGGTATACTAACAGAGAAAGGCATGCCTTGCTTGAAAAACTTAATACATACTCTAGATTATACCTCATCCCTTGAAAGCTATGGATCATTCGATAAACTCCAACTTGTTATCAACTTGATTGGGTTGACTTGCTTTTCAAGTTTGCCACAGCATCAAAGATGTATAATTGAAAACAAAGGGGTAAAGGCAGTTGGTCTTATTGTAAAACGATGCTTAAGCAATGATATTGACGTAGCAAGGCTCAGCCTGGCTCCTCATTTGCATACAACATTCTATGAAAGATCTTGTTGCTGGATGGGTGCAAAAGATTGGGAAGGTTCCAATATTCTCCTGTTTTATGGTTTGTGGGGCTTGGCTGAATTGGTTCATCAGTGTGTCTCTTTACTAGATAATCCTCACATATTTATTTCTGAGGCAGGATACATTGAAGCTCAATTGGTTAGCAAACTAAATGAGATCTGTACCAGCACCTCTTTCAGTCCTGGATTGAGATGGTATGCAGCTTATATTCTTAGTTATTTTGGTTTTTACGGTTTCCCAAATGAACTAGCCAAAAGGATTGGGAAATGTCTTAATGAGAGAGAGTATGCAGATATACAACTCTTTGTGGCAAACGGTGATACTTTGAGTGTTCATGGTGTTATTCTTGCTGTTCGGTGTCCATCACTGCTACCTCCTGAAGTCTTACATGTTAAAGAAAAAAGAATCAATAGTTTAACTGATAAGGGTGTCATGGAGACCATTAGGGACATTCTTTTGTCTTCTCATGTTGATTATGAATCATTAGTGAAGTTGTTGGAGTACGTTTACTTGGGATGCTTACATGCCAGAGAAGAAACAGTGAAGAAGTTGAAAATTCTTGCTAAGCGCTGCAATCTACAGCCTCTTTTTCAAATGCTTAATAGACAACGTCCAAAATGGGGCACATCATTCCCGAGCTTTGATCTTACTTCATCTCTTATTTCAGCTGGAAGTTGTTTTTCGGATGTCATATTGGAATCTGAAACAGATAAACTTGACAGATGGACATGCTGTATATGCTCTCATTCAGTTCCACATTTGCATGGTCACAAAGTTATATTACAATCTAGCTGTGATTATTTGCAGGGTTTGTTTCGTTCAGGAATGAAAGAGAGCCATTCAGAAACTACAAAGGTTCCTATTAGTTGGGAAGCAATGGCTAAACTTGTGCACTGGTTCTATTCCAATGAGCTACCAAATCCTCCCTCTGGATGTTTGTGGGATAATATGGATGATGAAGAAAAGCTAGTGAATTTGCAACCGTACGTGGAGCTTTATTGGCTTGCTGAATTCTGGACTTTGAAATATATTCAGGAACCCTGCTGGAATGTGATTACGTCTTATCTTGATTCTGCTAAGCAGTTGTCCATTAAAATACTTAAAATGGCTGGCAACCTCTCTTTGTGGAAGTTGGCTAGTGTTGCGGCAAATCACATTGCTCCTTTATATAGTCAATTACGTGATTCTCATGAACTTGAAGAACTGGACGATGTCTTAGTTCACTTAATTTGTTCTGCTTCTACTCAACTTACCCAAGATGGAGGAAACACTTTGCAAGATGCTTGCATTAGTATTGCTAAAGCTGACAGTCCCCTCTCTCTTAGGCTTTTATCTGGGAAGCGAGTAAAATCTGGAGGACCAAGCTTTACTCCTCCTAAATTTCAGACCTCCAGCCGGAAGGAGGTTAGACCAGAGTCAAGGCAACTCTTATTTCAACTCACTATCCTTCGAAGTAGTGTATTGAATACTTCTGGTGGAGGATATGCCATGCTTGACCCCTGTGTGGCATTATTTAAAGGTGGACTATATGCTGGAAATCTGCTGATTAAAATTGTATTGTTTGTTAATTTCAATTCATATTCTCAATGCATGGCTTCAGTTGTGGCTAGCTGGGATGAAGAAACATGTCTTGATAAAAGAGTATTTGGTGAGATCATTGTTCCTTAA 3558 0.3865 MKSTREKDSNRGVSLQMHNLHQRLLDALNLGIRHFDEKTNRLKWQSANIEVQKQVIRSIDAFLDSISGDTRAAHHTIVKESVADILGALLWILQCKSRPLLCMASNVAVKLVSVLPHSVLQSYILDLVHALSSLLSSPQTEVSIPCSTSLNLVISNLSATSEKAVWEVLKETECVIHIVDKINDFTGGGGPMKIDYFEEMTSLLSSILLRWPPTRFPVWNDVKLMTALADMHMRTDSSIKLVILKLYTSLGINNILFQLLSLQEVLFLVIFDSQAIRSTDLQFILPALCGSVAEKLMENGEVFVQMVVQSMGKSNPHAVRIEGFKLAQCLLKSQVNFLKVMNTCAEALVDAIICGMGETRMHSRKFGNTSSSILVEACRLGLVTRWVGEHHIKFWKQRIDRVLLNLLIENVQDISDEHVLSLEKQISIVKEGLKANYHLGVRGYVWDILGWLAIHSGENFNHCTYGTELHVNLLITCACLTFADVSEKWCRICQQDDGHSFQSEPASRAVLMMIYSPCNYISSQARLILSGILTEKGMPCLKNLIHTLDYTSSLESYGSFDKLQLVINLIGLTCFSSLPQHQRCIIENKGVKAVGLIVKRCLSNDIDVARLSLAPHLHTTFYERSCCWMGAKDWEGSNILLFYGLWGLAELVHQCVSLLDNPHIFISEAGYIEAQLVSKLNEICTSTSFSPGLRWYAAYILSYFGFYGFPNELAKRIGKCLNEREYADIQLFVANGDTLSVHGVILAVRCPSLLPPEVLHVKEKRINSLTDKGVMETIRDILLSSHVDYESLVKLLEYVYLGCLHAREETVKKLKILAKRCNLQPLFQMLNRQRPKWGTSFPSFDLTSSLISAGSCFSDVILESETDKLDRWTCCICSHSVPHLHGHKVILQSSCDYLQGLFRSGMKESHSETTKVPISWEAMAKLVHWFYSNELPNPPSGCLWDNMDDEEKLVNLQPYVELYWLAEFWTLKYIQEPCWNVITSYLDSAKQLSIKILKMAGNLSLWKLASVAANHIAPLYSQLRDSHELEELDDVLVHLICSASTQLTQDGGNTLQDACISIAKADSPLSLRLLSGKRVKSGGPSFTPPKFQTSSRKEVRPESRQLLFQLTILRSSVLNTSGGGYAMLDPCVALFKGGLYAGNLLIKIVLFVNFNSYSQCMASVVASWDEETCLDKRVFGEIIVP 1185
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Dere08g0186 1185 ProSiteProfiles BTB domain profile. 727 808 IPR000210 GO:0005515
Dere08g0186 1185 PANTHER OS06G0674800 PROTEIN 5 265 IPR044953 -
Dere08g0186 1185 ProSiteProfiles BTB domain profile. 858 939 IPR000210 GO:0005515
Dere08g0186 1185 SUPERFAMILY POZ domain 883 983 IPR011333 -
Dere08g0186 1185 SUPERFAMILY ARM repeat 45 789 IPR016024 -
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Dere08g0186 1185 Pfam BTB/POZ domain 883 943 IPR000210 GO:0005515
Dere08g0186 1185 SMART BTB_4 727 838 IPR000210 GO:0005515
Dere08g0186 1185 SMART BTB_4 858 986 IPR000210 GO:0005515
Dere08g0186 1185 Gene3D Potassium Channel Kv1.1; Chain A 709 833 IPR011333 -
Dere08g0186 1185 CDD BTB_POZ_ZBTB_KLHL-like 857 935 - -
Dere08g0186 1185 Gene3D Potassium Channel Kv1.1; Chain A 849 1049 IPR011333 -
       

Transcription factors information


Select Regulatory Factors Family Gene Hmm_acc Hmm_name E_value Clan
TR TRAF Dere08g0186 BTB 1.2e-05 CL0033