Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Dere05g1934 ATGGAGCCGGACGTGAGTATTGAGAGCTCGTCGATGATCCAGGTGGCGGTTCTGCCGATCGGGACAGTGCCGGCAAATGTGCTGCGGGACTATTATTCTATGCTGCTCCCTCTTCATATGATACCTCTCTCGGCGATCAGCTCCTTCTATACAGAGCACCAGAAATCACCGTTTACACATCAACCATGGGACTCGGGGTGCCTCCATTTCAAATTCGTTCTGGGAGGTGCACCTCCAAGCCCATGGGAGGACTTCCAATCTCACCGTAAAACCCTGGCTGTCATAGGCATTTGCCATTGCCCTTCCTCGCCCGATCTTGATTCAGTCATCGATCAATTTTCTAATTCCTGCAAGTCTTACCCTTCCTCGCTTGTGGGTCGCTGCTTTGCATTCTGCCCAGATGATTCGCAGCTTGAGGACGGTGGTAAAAAGGGGGGTAATTTAAGGCTGTTTCCTCCTGCTGATCGTCAAACACTGGAATTCCACTTGAACACTATGATGCAAGAAGTTGCTGCCTCGCTGTTGATGGAATTTGAAAAGTGGGTGCTTCAGGCTGAATCTTCGGGCACCATACTCAAGACACCTTTGGATTCTCAAGCAAGTCTCAGCTCAGAGGAGGTCATTAAGGCTAAAAAACGAAGACTTGGGCGAGCACAGAAAACAATAGGTGATTACTGCTTACTGGCTGGATCGCCAGTTGATGCAAATGCCCATTATTCTACTGCATTGGAGCTTGCCAGGTTGACCGGCGATTGCTTCTGGTATGCTGGCGCACTAGAGGGTAGCGTGTGTGCCTTGCTGATTGATCGCATGGGCCAGAAAGACTCAGTCTTGGAGGAGGAAGTTAGATACCGTTACAACAGCATAATCTTGAATTACAAGAAGTCACAAGATAATGCTCAGAGAGTTTCGCCCCTTAGTTTTGAACTTGAAGCTACTTTGAAATTAGCAAGGTTTCTTTGCAGGAGAGAGCTGGCCAAGGAAGTGGTGGAGTTGTTGACCAATGCTGCTGATGGTGCTAAATCTTTAATAGATGCCAGTGATAGACTCATATTGTTTGTTGAAATAGCTCGTTTATATGGCAGCCTTGGTTACCAGAGAAAAGCTGCTTTTTTTTCAAGGCAGGTTGCTCAGCTATATCTGCAGCAGGATAATCGGTTGGCTGCAATTAGTGCTATGCAAGTTTTGGCAATGACCACTAAAGCATATCATGTTCAAAGTAGAGCATCGATGTTTGACAAATCTCTGCATAATAAAGGAACTGGATCAAGTAATGCAGATAGTGGGAAAAAATATAACCAATCAGCTGTCTCACTATTTGAGTCTCAGTGGAGCACCCTTCAAATGGTGGTATTAAGAGAAATTCTACTTTCTGCTGTTCGTGCTGGAGATCCTCTTGCTGCATGGAGTGCAGCAGCAAGACTTCTCAGATCCTATTATCCTCTAATCACTCCTGTTGGGCAAAATGGTCTAGCTAATGCACTCACAAATTCAGCTGAGAGGCTGCCACCCGGAACTCGTTGTGCTGATCCTGCCTTACCTTTTATAAGGTTGCATTCTTTTCCTCTTCACCCAACACAGATGGATATTGTAAAACGCAATCCAGCTAGAGAAGACTGGTGGGCAGGTTCTGCACCTTCAGGCCCTTTCATATATACACCATTTAGCAAAGGAGAGCCTAATAATGTTAAGAAGCAGGAGCTTATCTGGATTGTTGGAGAACCTGTCCAGGTCTTGGTGGAATTGGCAAATCCATGTGGCTTTGATTTGAAGGTTGATAGCATCTATTTGTCTGTGCATTCAGGAAATTTTGATGCTTTCCCTATGAGTGTAAGCCTTCCGCCTAATTCATCGAAAGTGATCACCTTATCAGGCATTCCAACATCTGTGGGATTAGTTTCAATTCCTGGGTGCATTGTTCATTGTTTTGGTGTTATTACTGAACACCTATTCAAAGATGTTGACAATCTGCTTCTTGGAGCAGCGCAAGGACTTGTCCTCTCTGATCCTTTCCGCTGCTGTGGATCCCCAAAGTTGAAGAATGTATCAGTTCCAAATATTTCTGTTGTACCACCACTTCCATTGCTGGTGTCACGTGTCGTTGGGGGTGATGGTGCCATCATTTTGTATGAAGGTGAAATTTGCGATGTATGGATATGTCTGGCTAATGCAGGCACAGTTCCAATCGAGCAGGCACATATTTCACTGTCAGGAAAAAATCAAGATGCTGTGCTCTCATATTCTTTTGAAACTCTAAAGTCTTGCCTCCCCCTCAAGCCTGGAGCTGAAGTGACTTTACCAGTGACCTTGAGAGCCTGGCAGGTTGGTTCAGTGGATCCTGATACTGGTGCTGGGAAGAGTGCCTCTGGAAGCATTATGAGGCATGTTAAAGATGGAATCAGCCCATCACTATTGATACATTATGCTGGTCCACTGCAAATCTCTGGAGATCCTCTAACTAATGGATCTACTGTGCCCCCTGGTAGACGCCTTGTTGTTCCTCTGCATATTTGCGTTTTACCAGGTTTGTCTTTTGTCAAGGCTCGTCTGCTTTCGATGGAGTTTCCAGCACATGTTGGTGAAAGTCTTCCCAAGTTGGCTGATATAAATAATAATTCCAATGGAAGACATGTTGACTCTCAGACAAAAATGGACAGATTGGTGAAAATTGATCCTTTCAGAGGAAGTTGGGGGTTGCGATTTCTTGAGCTTGAGCTGTCTAATCCAACTGATGTCGTGTTTGAAATTAGTGTCTCTGTCAAACTGGAGAGCTCTAGTGATGAGGATAATATTTCTGCTGATCAGGATGCTGCTGAATATGGCTATCCTAAAACAAGAATTGATAGGGATTGCTCAGCCAGGGTTCTAGTGCCTCTTGAGCATTTTAAACTACCCATTCTTGATGATTCCTTTTTTATGAAGGATACTCTGGCAGACGGGGCTAGTGGAAGCAGGAATGCATCCTTCTCGGAAAAGAACACCAAAGCTGAACTCAATGCTTGTATCAAGAACCTGATATCTAGGATTAAAGTTCGATGGCATTCAGGACGCAATAGCTCTGGAGAGTTAAATATTAAGGATGCTATACAGGCTGCTCTTCAGACCTCAATTATGGATGTCCTGTTGCCTGATCCATTGACCTTTGGCTTCAGGCTCGTCAAAAATGGTTTTGAATCAGAAAAACCTGATCCTGGAAATGAATCTAATATTGATGTGGAGTCTCCTGCATCAAAAGATTCTGTGCTTGCTCATGAAATGACACCCATGGAGGTTCTTGTCCGTAATAACACAAAGGATCTGATCAAAATGAGTCTTAATATTACTTGCAGAGATGTAGCTGGGGAAAATTGTGTAGATGGTACCAAGGCAACTGTTCTATGGACTGGTGTTCTAAATGATATCACTATGGAGATTCCCCCACTTAAAGAAGTTAAACATTCTTTCTGCTTGTATTTTCTTGTTCCGGGAGAGTATACACTTGCAGCGGCTGCAGTGATCAATGATGCAAGTGACATTCTCAGGGCTCGAGCGAGGACCAATTCAGCTGAAGAACCAATTTTCTGTCGTGGACCACCATATCATGTTCGTGTTCTTGGGACTGCATGA 3606 0.4454 MEPDVSIESSSMIQVAVLPIGTVPANVLRDYYSMLLPLHMIPLSAISSFYTEHQKSPFTHQPWDSGCLHFKFVLGGAPPSPWEDFQSHRKTLAVIGICHCPSSPDLDSVIDQFSNSCKSYPSSLVGRCFAFCPDDSQLEDGGKKGGNLRLFPPADRQTLEFHLNTMMQEVAASLLMEFEKWVLQAESSGTILKTPLDSQASLSSEEVIKAKKRRLGRAQKTIGDYCLLAGSPVDANAHYSTALELARLTGDCFWYAGALEGSVCALLIDRMGQKDSVLEEEVRYRYNSIILNYKKSQDNAQRVSPLSFELEATLKLARFLCRRELAKEVVELLTNAADGAKSLIDASDRLILFVEIARLYGSLGYQRKAAFFSRQVAQLYLQQDNRLAAISAMQVLAMTTKAYHVQSRASMFDKSLHNKGTGSSNADSGKKYNQSAVSLFESQWSTLQMVVLREILLSAVRAGDPLAAWSAAARLLRSYYPLITPVGQNGLANALTNSAERLPPGTRCADPALPFIRLHSFPLHPTQMDIVKRNPAREDWWAGSAPSGPFIYTPFSKGEPNNVKKQELIWIVGEPVQVLVELANPCGFDLKVDSIYLSVHSGNFDAFPMSVSLPPNSSKVITLSGIPTSVGLVSIPGCIVHCFGVITEHLFKDVDNLLLGAAQGLVLSDPFRCCGSPKLKNVSVPNISVVPPLPLLVSRVVGGDGAIILYEGEICDVWICLANAGTVPIEQAHISLSGKNQDAVLSYSFETLKSCLPLKPGAEVTLPVTLRAWQVGSVDPDTGAGKSASGSIMRHVKDGISPSLLIHYAGPLQISGDPLTNGSTVPPGRRLVVPLHICVLPGLSFVKARLLSMEFPAHVGESLPKLADINNNSNGRHVDSQTKMDRLVKIDPFRGSWGLRFLELELSNPTDVVFEISVSVKLESSSDEDNISADQDAAEYGYPKTRIDRDCSARVLVPLEHFKLPILDDSFFMKDTLADGASGSRNASFSEKNTKAELNACIKNLISRIKVRWHSGRNSSGELNIKDAIQAALQTSIMDVLLPDPLTFGFRLVKNGFESEKPDPGNESNIDVESPASKDSVLAHEMTPMEVLVRNNTKDLIKMSLNITCRDVAGENCVDGTKATVLWTGVLNDITMEIPPLKEVKHSFCLYFLVPGEYTLAAAAVINDASDILRARARTNSAEEPIFCRGPPYHVRVLGTA 1201
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Dere05g1934 1201 PANTHER TRAFFICKING PROTEIN PARTICLE COMPLEX SUBUNIT 9 1 1195 IPR013935 -
Dere05g1934 1201 Pfam Transport protein Trs120 or TRAPPC9, TRAPP II complex subunit 327 741 IPR013935 -
Dere05g1934 1201 Pfam Transport protein Trs120 or TRAPPC9, TRAPP II complex subunit 201 272 IPR013935 -
Dere05g1934 1201 Pfam Transport protein Trs120 or TRAPPC9, TRAPP II complex subunit 9 191 IPR013935 -