Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Dere05g0400 ATGCTAAATGGCTTATTTGGTTCAAGGCGTAGAAGCTTTCGGGGAATTTTCAGTTTCCTTTGTGCCGTGGTTTTGTTTTTCTTCTTTTACAATCGGGAAGATGTTATTCGTAACCCTCTTCTCAGGCAGTCTGCATATTTGGTAAATCATCATTTGCCTCCAAGAGCGGTGATTCACCGTCGAACAGTTGAAATCGGCCTTAACTCTTCAAGTATAGTTGATGAGCCTCACGACAACAATTTAGCTGTAAATAATGCTGGATCTTGTAATGGATTGTTCCACCATGATGGTTATGCCAGCCCATGTGAATACTTAAAGGCAAATCCACAGTGTAATTCGGGAGGGTTTCTTGATTACATAAGGTTCTTATATTGTACGTGTCAAAATTTTAGAGTGCTTGGCTACCTAGTATTGGGTATATGGCTAGCCGCTTTGTTCTATCTATTGGGGAACACTGCAGCAGACTTCTTTTGCCCTTCTCTTGAGCATCTGTCAAGGCTCTTGAAATTTCCTCCAACTGTTGCTGGGGTTGTGCTCCTTCCACTTGGGAATGGAGCACCTGACGTGTTTGCCAGTATTGCTGCCTTTGTCGGTACAGATACAGGTGAAGTGGGACTCAATAGCGTGTTAGGCGGTGCTCTGTTTGTTACTTGTGTTGTTGTTGGAACTGTTTCTCTATGTGTGTCAGATAAAGGAATACAAATTGATCGAAGATGCTTCATAAGGGATATTGGCTTCTTTCTATTCACTCTTTTGTCTCTGTTGTTGATTTTGGCTGTCGGCAAGGTGAGTGTTGGGGCAGCCATTGCTTTCGTATCAATTTACTTTGTTTATGCAATTTCTGTTGCTGCGAATGAGATATTTTGGAAACATGCACGGCGGTTGAAACTGGATGCTATCACTCCATTGCTTCCTGTCCAGGGAGGTATGTTCTCCCTTGGATCAGAAGAGGAATGTTCTGTTTACAGCTCTTTGCTTGACATAGACACCAAAAATGATCCTCCCCATCTCCCACCTTCATTGCCACAGTGGATGTGGTCTTCCAATGTGGCGATTTATTCGAACCAGGCTAATAAAGTTAATATGTTGGATGATGAAAGGCCTCCCTGGGGATGGAGTGATGGCAGTGAGGAAAATAACAGTTCGTCTTTCTCTGTTGGAAAACTTTTTTTATTGATGGAGATGCCACTGACAATTCCCAGACGGCTAACAATTCCCTTGGTCAATGATGAATTATGGTCAAAGAAATATGCTGTGGCTAGTGCTTCACTGGCCCCAATTCTCCTTGCCTTTTTGTGGAACACCCAAGATAATGTGGGTTATCTGAGTGCTATACTTTCCTATTGCATTGGTGGTGTTGTTGGATGCACACTTGGTATTCTTGCCTATAAATACACATTTTCTGATTATCCGCCACATAGGTTTTTGATTCCCTGGGTTCTTGGAGGATTTATCATGAGCATAGTGTGGTTCTACATAATAGCAAATGAGCTTGTAGCTCTTTTGGTGTCATTTGGTGTAATTTTAGGGGTTAATCCATCCGTCCTGGGATTAACTGTATTGGCATGGGGGAATTCGATGGGGGATTTGATGTCAAATGTTGCATTAGCTATAAATGGAGAAGATGGAGTTCAGATTGCTTTATCTGGATGCTATGCAGGGCCTATGTTCAACACACTTGTTGGTTTGGGGATTTCAATGCTGCTCGGGGCCTGGTCAGTGAAACCTGAATCATACATGGTTCCTGAAGACCATAGTTTATTTTACACTATGGGATTTCTTATCTCAGCACTGCTATGGGCACTTGTTGTTTTGCCTCGCAACGACATGCATCCCAGCAGAAAACTAGGAGTGGGTCTCATCACGCTTTACTTGATATTTCTTTCGTTCAGGGTGTGCACTGCCATGGGGTTCATTTCAGTGGCTGGTTTAAGTTGA 1938 0.4283 MLNGLFGSRRRSFRGIFSFLCAVVLFFFFYNREDVIRNPLLRQSAYLVNHHLPPRAVIHRRTVEIGLNSSSIVDEPHDNNLAVNNAGSCNGLFHHDGYASPCEYLKANPQCNSGGFLDYIRFLYCTCQNFRVLGYLVLGIWLAALFYLLGNTAADFFCPSLEHLSRLLKFPPTVAGVVLLPLGNGAPDVFASIAAFVGTDTGEVGLNSVLGGALFVTCVVVGTVSLCVSDKGIQIDRRCFIRDIGFFLFTLLSLLLILAVGKVSVGAAIAFVSIYFVYAISVAANEIFWKHARRLKLDAITPLLPVQGGMFSLGSEEECSVYSSLLDIDTKNDPPHLPPSLPQWMWSSNVAIYSNQANKVNMLDDERPPWGWSDGSEENNSSSFSVGKLFLLMEMPLTIPRRLTIPLVNDELWSKKYAVASASLAPILLAFLWNTQDNVGYLSAILSYCIGGVVGCTLGILAYKYTFSDYPPHRFLIPWVLGGFIMSIVWFYIIANELVALLVSFGVILGVNPSVLGLTVLAWGNSMGDLMSNVALAINGEDGVQIALSGCYAGPMFNTLVGLGISMLLGAWSVKPESYMVPEDHSLFYTMGFLISALLWALVVLPRNDMHPSRKLGVGLITLYLIFLSFRVCTAMGFISVAGLS 645
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Dere05g0400 645 Gene3D - 415 633 IPR044880 -
Dere05g0400 645 Gene3D - 170 297 IPR044880 -
Dere05g0400 645 PANTHER NA+/CA2+ K+ INDEPENDENT EXCHANGER 18 640 - -
Dere05g0400 645 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 480 631 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
Dere05g0400 645 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 140 280 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
Dere05g0400 645 FunFam Cation/calcium exchanger 5 417 633 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Dere05g0400 Dere-ChrDere05 5742322 5744259 Dispersed/Transposed
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Dere05g0400 75 637 Antiporters AT5G17850 41.725 1.76e-122 373