Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Cca10g00376 ATGATTGTGAGGATGAAGAGAGTGGACCTGAGATCTTTGTGGTTTGTGTTTAGTGTGTGCTGCTCTTTCATGCTTTATGCTGCAGATTTTTGTTGGACGCTAACAGCTAGACAGGACTTACCTCGTGGCTGGGGACCGCAGATGGATCCAAGTCAATGGAATTCTTACTATGGGCATGGACAGGGTTATGAAGCCTATGCTTATGGGGCTGCTCAAGATCCTTCATTGTATGCATATGGTGCATATGCTGGCTATGCACTGTACCCCCAACAGGTTGAAGGTGCTCAAGACCTTTCGGGTATGTCTGTGCCTACATTGGAACAAAGGGAGGAATTGTATGATCCCGTGACAATGCCTGATGTTGATAAGTTAAATGTTGCATACCTCTCAGTGCATGGAAGTGCCATTTTGGGGCGGTCACTCTGGCAAAAAACCTGTACAGCATCCTTACAGCAAGCCTAA 462 0.4654 MIVRMKRVDLRSLWFVFSVCCSFMLYAADFCWTLTARQDLPRGWGPQMDPSQWNSYYGHGQGYEAYAYGAAQDPSLYAYGAYAGYALYPQQVEGAQDLSGMSVPTLEQREELYDPVTMPDVDKLNVAYLSVHGSAILGRSLWQKTCTASLQQA 153
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Cca10g00376 Cca-Chr10 3973860 3976164 Wgd
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Cca10g00376 - - gmx:100799421 204.912
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Cca10g00376 10 3973860 3976164 Cca10g00376 10 3973860 3976164 ECH
Cca10g00376 10 3973860 3976164 Cca04g00573 04 5773851 5777656 PCT