Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Car08g01186 ATGTCTTCAAAACATAACAAAACGGACTTCAACTTTAGAACATGCATATATCTACCACCGCGGGTAAATTCGCAAGAACCATGGTGTGTAACAGACAATGGTGACAGGATTTTAGTAAATTCTTTGCCAGTATTGCAAATGCAAATGTGTTTGATCTTTTTTGGAACTCTTTTGTTCAAATCTATCTTGTGTCGAATTGGAATCTCCAAATTCACTTCTATGAGCATTGTTGGTCTAATCTTAGCAAATACCTTCAATGCACATTGGACATTAAGAATGAAGACAATATTCTTCTTTGATTCACAACAAAATCTTGGACTAGTTTCAGTATTTGGTTACATGCTATTCCTATTTTACATTGGGGTAAAAACAGATATGAGTGTGGTACACAAAACAAGAAGTGGTGCCACAAACATTGGTTCTTTAGCTATAATGGCTCCATTTCTATGTGGCATGGCTGTTCTAAATTTGTACTCATCAAAATACCTAACAAATGACCAAATAAAAATACTTGGAGTCATCATTGGATTATTTTGTATGACACCTTTTCCAGTGATTTCATCTGTTTTAAGTGATCTGAAAATCTTGAATTCGGAATTAGGCCGAATAGGCCAATCCGCATCGTTAGTCAGTGAAATTTTCAGTGTTTTCTTAGCATCAACACTAACATTTGCTAAATTGTATGCGGAATATGGTTTATCAAAAGCATTGGTTTGTATGGCTGCTGCAATCTTGTTTGTACTATTGGTTATGTTCGTCATTCGACCTGCAATGTTTTGGATTATAAAACAGACACCAGAAGGTTCTCATGTGAGTGATAATTATGTTTATAGCATACTTATTATGACTCTGCTATCATCTTATGCAACATATCGATTTGGATTTTTTGTTCTTTTTGGACCTTTTGTGTTTGGTTTGGCTATTCCTGAAGGACCTCCATTAGGCACAGCTATTATTAACAAAATTGACACATTTGTTAATGGGGTTTTTATGCCACTTTTTGTGACTACATGTACGATGAGAGTGGATTTGAAAGATTTTTTGAGATGGAGAAATGAATTGGATGGAAGTGTTGATGATTTTATGGTGCAAACTTTGATTGTTATTGTAGTGAGTTTTGTTACAAAATTTATTGCTTGTATGATACCTCCTTTACGAAGTGAAATGCCATTGAATGATGCTATTTCATTATCTTTGATTATGAGTGGGAAAGGCATTGTGGAAATGGCTGCATTTACTTTGGTCAGAGATACCATAGGTATCCCAGATAACATATTTGCATTGTTAATGATATGTATTGTATTAAACACAACATTAGTTCCATTGTTATTGGGTTATGTGTATGATCCAACAAAGAAATACACTGGTTACACAAAAAGAAACATATGTGATCTAAAAAGCAACACAGAACTTAGAGTATTAGCATGTATTCATAGAACAGACAATATTCCAGCAACAATAAACTTTCTAGAAGCAACATACCCTACAAAACAAAATCCAATTTGTACTTACGTTCTTCAACTCATTGAGTTAGTTGGAAGAGCTTCTCCAATTTTCATTTGTCACCAACTTCAAAAAAAGAAGAAATCAAATTCAAACTCATCTGTGGCTGAAAAACTTGTGGAATTGTTCGAAAGTTTCGAAAAGGAGTTCGATGGTTGTTTAGTTGTTAACACATTCACTGCTATATCGCCGTCCGAAATGATGTATGATGACATATGTACATTAGCACTTGACAAATTTACATCACTTATTGTCCTGCCTTTTCATCGGAAATGGTCGTCCGATGGAAACTCGATCGAGTTGGAAGACGAGTTGTTAAGGGACTTGAATTTTAGAGTTTTGGAAAGAGCACCATGTTCTGTTGGTGTGTTAATTGAAAGAGCACAAATGACACATATTTTTTCATTGGAAACACCTTATAAAGTATGTTTATTTTTCATAGGTGGAAAAGATGATAGAGAAGCACTTTTTTTAACAAAGAGAATGACTAAGAATCCACATGTGAAATTAACTGTTGTTAGATTCTTGACTGTTGATGATTGTGATTCAAAGGGTTGTTGGGAAAGTATACTTGATAATGAATTGTTGAGTGAGATTAAGACAGAGAGTAAAATTGGTGATGTTTATGTGAAATATGTTGAGGAAAGAGGGAAAGATGGACCTCAAACAGCTTTGATTGTTAGGTCATTGGTGAATGAGTTTGATTTGATTGTTGTTGGAAGACAAGCTGGGATTGAGACATCACAAACTTCTGGATTGTTGCAATGGAGTGAGTATCCTGAACTTGGTGTGTTGGGAGATTTGTTGGCTTCAACTGATGCTGGTGGTAAAGCTTCTGTTTTTGTTATTCAACAACAAAGAACAGCTATGGATATTTAA 2382 0.3459 MSSKHNKTDFNFRTCIYLPPRVNSQEPWCVTDNGDRILVNSLPVLQMQMCLIFFGTLLFKSILCRIGISKFTSMSIVGLILANTFNAHWTLRMKTIFFFDSQQNLGLVSVFGYMLFLFYIGVKTDMSVVHKTRSGATNIGSLAIMAPFLCGMAVLNLYSSKYLTNDQIKILGVIIGLFCMTPFPVISSVLSDLKILNSELGRIGQSASLVSEIFSVFLASTLTFAKLYAEYGLSKALVCMAAAILFVLLVMFVIRPAMFWIIKQTPEGSHVSDNYVYSILIMTLLSSYATYRFGFFVLFGPFVFGLAIPEGPPLGTAIINKIDTFVNGVFMPLFVTTCTMRVDLKDFLRWRNELDGSVDDFMVQTLIVIVVSFVTKFIACMIPPLRSEMPLNDAISLSLIMSGKGIVEMAAFTLVRDTIGIPDNIFALLMICIVLNTTLVPLLLGYVYDPTKKYTGYTKRNICDLKSNTELRVLACIHRTDNIPATINFLEATYPTKQNPICTYVLQLIELVGRASPIFICHQLQKKKKSNSNSSVAEKLVELFESFEKEFDGCLVVNTFTAISPSEMMYDDICTLALDKFTSLIVLPFHRKWSSDGNSIELEDELLRDLNFRVLERAPCSVGVLIERAQMTHIFSLETPYKVCLFFIGGKDDREALFLTKRMTKNPHVKLTVVRFLTVDDCDSKGCWESILDNELLSEIKTESKIGDVYVKYVEERGKDGPQTALIVRSLVNEFDLIVVGRQAGIETSQTSGLLQWSEYPELGVLGDLLASTDAGGKASVFVIQQQRTAMDI 793
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Car08g01186 793 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 50 440 IPR006153 GO:0006812|GO:0015299|GO:0016021|GO:0055085
Car08g01186 793 PANTHER CATION/H(+) ANTIPORTER 4 8 790 - -
Car08g01186 793 Gene3D - 45 455 IPR038770 -
Car08g01186 793 PANTHER CATION/H + ANTIPORTER 8 790 - -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Car08g01186 Car-Chr8 13403356 13406304 Dispersed/Transposed
       

Functional genes information


Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Car08g01186 41 788 Antiporter Super Family AT5G22900 37.037 1.45e-172 516
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Car08g01186 - - cam:101496863 1538.86