Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Car05g02601 ATGGGGATAGTAAATATAAACGAAACGTTATTTGTATCAATGACTAATATCAGCCAAACAGCTAATATTACACTTTATAATGTTTGTATTTCCGCCCCACCCCATATTCTTTCAGATGGCATTTGGGGAGGACACACGACCGAAAGGGGTCCCTTAAAGTCATCTTTTCCGGTATTTCTTCTTCAAATTATTCTAATTTATGGCACAACAAGGACTTTACATTTTCCTATGAAAATGTTGGGTTTTCCTGTGCTCATTTCACAAATGATGGCTGGACTTATTTTAGGATCATTTGTGCCGATATTTGAGGAGTACAAGAGAATGTTATTTCCTTATGGAAGTCAAGATACACTCGCATCAATAACAACAATTGGTTTTGTATTCTTCCTGTTTGAGACAGGGGTAAAAATGGATTTTGACATGATCGGACACTCAGGAAAAAAGGGATGGATCATTTCTCTTTTTGGGGTAATAACATCATTGATTGTGGGTGGTATTTCTCGTTCTTCGGAGTTTTTTAGTGTTTTTAATGGCTCAATTAGTGAAGCTAATGTTATATTGATAGGACATAATACAACTTCATTTGCAGTGATTGTTTCTCTATTAAATGATCTTAAACTCTTAAACTCTGAACTTGGAAGATTAGCATTATCTTGTGCTTTGGTTGGTGACGTAATAAGCAACCTTATTGTAACTGTAATTTCAAGTATTGCAAATAACAGTTACGGCATTCCACTTGGGGTTAGGTTGGGATGTTTATTTGCAATAAGCTTATTCATTTTGTTAGTCTATCGTCCTGCAATGTTTTGGGTTATTGAACACACTCCTGAAGGAAAAGAAGTTAAGGATATTTACATCAATATTGTAATTGGGATTCTGTTTTGTTTGTGTTGGTTATCAGGAGTATTAGAGAGGGGTCCTGTGTTTTTACCTTTTATTTTTGGATTAGCTACACCCGAAGGATCTCCATTAGGCTCTACTTTGATCAAAAGGATTCATTTGTTAGGCATTAAATTGTTTTTGCCAATCTTCATGACCACTTGTACAATGAAGGTGGAGTCTTTGGACATATTTGATTTTACACCATCATCATCAACAACACTTAAAATTGCTTTGTTCGTTTTTGTTTTTGGTTATGTGGTCAGAATGGTAGCTAGCCTTGTATCTTCACTCTTTTTCAATGTGCCTTTAAAGGATGCTATTTCTCTTGCCCTCATTTTGAACTGCAAAGGTGTTGTGGAAGTAACAATGTACTCTACTGCATTGGATAGAAATGACATCCAATCGAGAACATATTCAATAATTATAATGATAATGATGGTTTTAATATGCATTACTCACTTGTTGGTAAAACGTATGTACGATCCTTCGAGGAAATATGTTGGGTTTCAAAAGAGGAATATGTTCAGTTTGAAGCCAGACTCAGAACTGAAGATACTAGTTTGCATTCATAAACAACACCATATAAGTCCTATTATAAAAGTTATTGATCTATGTTATCCAACAATAGAAAATCCTATCATTGTAGACGCTTTGCATTTAATCGAGCTAGCTGGGAGGTCCTCACCAATTTTCATTTCTCACAAGAAGAAGAAAGTTGTTTCCTTAAACTTGAATGATTCTTACTCTGATACTGTTGTTCTTAATTTTAAACTCTATGAAAATGACAAACAAGGTGCAGCAATAGTGAACCCTTACACTGCCATATCTCCACTTAACTTAATGCATGAAGATGTTTGTCACCTTGCATTGGACAAAGTTTCATCAATTATGATCCTTCCTTTTCATAAAAAATGGTCTAGTGATGGAAAAGTAATTGAATATGATGACAATAACATAAGGTCTTTAAATTGCAAGGTATTGGAAAAATCTCCATGCTCTGTTGGAATTTTAGTGAGTCGTATGAATGTTCATTCATCAAATCTTCGATTAGGTTTGGTGTTTTTGGGAGGAAAAGATGATAGAGAGGCTTTGTGTTTGGCTAATAGAGCAGCATGTGATTCTAGCATTGAGCTTGTGATATATCACATTTTAGATAAAAATTTGGATGAAAAAGACAAGGAAAATTTGGAGACAGCGCTTGATAAAGCTGTGTTAAAAGAATCTAAGCTAGAACATTCTAGTAAGGGCAATATTGTAACTTTCAAAGAAATAGAAGTGGAGGGTGGGTCCCAAACACTTGATGTTCTTCGTCAAATGGTAGATGAACATGATTTTATTATAGTTGGGAGAAGACATGGTGTCAATTCTCCTCAAACATCTGGGCTTGAAGAATGGAGTGAGTTTCCTGAGTTGGGTTCAATTGGAGATTATTTGGCTTCCTCAGATCTTGATTCCAAAACATCTGTTTTAGTGGTGCAACAACAACAATTGTGCCTATAA 2382 0.3505 MGIVNINETLFVSMTNISQTANITLYNVCISAPPHILSDGIWGGHTTERGPLKSSFPVFLLQIILIYGTTRTLHFPMKMLGFPVLISQMMAGLILGSFVPIFEEYKRMLFPYGSQDTLASITTIGFVFFLFETGVKMDFDMIGHSGKKGWIISLFGVITSLIVGGISRSSEFFSVFNGSISEANVILIGHNTTSFAVIVSLLNDLKLLNSELGRLALSCALVGDVISNLIVTVISSIANNSYGIPLGVRLGCLFAISLFILLVYRPAMFWVIEHTPEGKEVKDIYINIVIGILFCLCWLSGVLERGPVFLPFIFGLATPEGSPLGSTLIKRIHLLGIKLFLPIFMTTCTMKVESLDIFDFTPSSSTTLKIALFVFVFGYVVRMVASLVSSLFFNVPLKDAISLALILNCKGVVEVTMYSTALDRNDIQSRTYSIIIMIMMVLICITHLLVKRMYDPSRKYVGFQKRNMFSLKPDSELKILVCIHKQHHISPIIKVIDLCYPTIENPIIVDALHLIELAGRSSPIFISHKKKKVVSLNLNDSYSDTVVLNFKLYENDKQGAAIVNPYTAISPLNLMHEDVCHLALDKVSSIMILPFHKKWSSDGKVIEYDDNNIRSLNCKVLEKSPCSVGILVSRMNVHSSNLRLGLVFLGGKDDREALCLANRAACDSSIELVIYHILDKNLDEKDKENLETALDKAVLKESKLEHSSKGNIVTFKEIEVEGGSQTLDVLRQMVDEHDFIIVGRRHGVNSPQTSGLEEWSEFPELGSIGDYLASSDLDSKTSVLVVQQQQLCL 793
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Car05g02601 793 PANTHER CATION/H + ANTIPORTER 15 790 - -
Car05g02601 793 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 69 449 IPR006153 GO:0006812|GO:0015299|GO:0016021|GO:0055085
Car05g02601 793 Gene3D - 57 460 IPR038770 -
Car05g02601 793 PANTHER CATION/H+ EXCHANGER 3 15 790 - -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Car05g02601 Car-Chr5 71038692 71041288 Transposed
       

Functional genes information


Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Car05g02601 28 791 Antiporter Super Family AT5G22900 33.171 2.31e-141 435
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Car05g02601 - - cam:101490502 1378.23