Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Car02g00483 ATGGCTATCAAAGTTTATTTGTCCAAATACACCTTTTTCATGGACATCTCTTTCCTCTTGTTGATTTGTGTTTTCATGATTATTCACTTCAACACACCAAAAGAAGATATTTTTATGGTTCTAAGAAATAAAAACAACCACTCTACCTTTGATGATGTCAATGATGAACAAGGATGCAATACTTTAGACAACATAGGTGACTACAAAGCCAAGTGTGTGTACCTTAAATCCAATGATTCATGTGTCTCTCAAGGCTACATTGATTACCTTTACCTTTTCTATTGCAAATTTGGAAAATTTCCTTTTTTGGGTTATACCcttttgttttcttgtcttttaattattttttatttATTGGCTAATACAACTTCTTATTATTTTTGTCCTTCACTTGAAAATTTATCAAAGTTATTAAGATTGTCACCAACAATTGCTGGTGTCACTCTTCTCTCTCTTGGTAATGGTGCTTGTGATGTTTTTTCTAGTCTTGTCTCTTTTCAAGTAAGTGGGACCCGCAATATTGGTTTGAACACAATTATTGGAGGTGTTTTTTTTGTGACATGTGTTGTTGTTGGGATAGTTAGCATTTCAATTAGTAAAAGAGGGATTCATGTTATGAAGTATGCTTTTGTAAGAGATGTTTGTGTTCTACTTTTTGTTCTTCTTTGTTTGCTTTGTGTTTTGATCATTGGTGAGATCAATGTTTTTGGAGCAATTGgtttttgttttatgtattttgtttatgtaattgttgtttatgtCTCATCTACCAAATGGAAAGATAGTGATGTTGGTTGCGGTGATGATGAAAAGGAAAATTATGGAAATGAATTGAATTTGAATGTGTCTCTTCTAAACGGTGTGAAGAAAGGATCTAATATTGATTATGTTGAAAATGGTATTCAAGAATGTGATTTGAATATAGAGAAAAATTGTTGCTTCATAAGATCTTCAATATGTAGAATTTTATTTTGTGTTCTTGAGATGCCACTTTATTTACCAAGGAGATTAACAATTCCTATTGTCAATGAAGAGAAATGGTCAAAGCTATATGGTGTTTCTTCAATGATATTAGCACCAATTCTCTTATCTTTTCTATGGAACACTCAAAAGGGACATAGTATTTTTAGCACAAGCCTTATTGTTTATGGAATTGGATTATTGGTTGGAATTATATTTGGTGTGATAGCATTTTTCACAACAAATACTTCAATGCCACCAAAAAAGTGCTTATTTCCTTGGCTTGTAGGAGGGTTTATAATGAGTGTGGCATGGAGTTACATTATAGCTCAAGAGTTGGTTGGATTGTTGGTTTCAATTGGTTTAATTTGTAGAATTAGTCCTTCAATATTAGGGTTAACAATTCTTGCTTGGGGGAATTCAATTGGTGATTTGATAACAAATTTAACATTGGCTTTAAATGGTGGACAAGAGGGGGTTCAAATAGCAATTTCAGGTTGTTATGCTGGCCCAATTTTTAATACCCTTGTTGGATTAGGATTGTCTCTTGTAAGTTCTACATGGTCACAATATCCACAACCTATTTTGATCCCTAAAGATCCATATTTATGGGAGACATTGGTATTTTTGGTGGTTGGATTGGTTTTTGCACTAGTGGTTTTGATCAAAAAAGATATGAAAGTTGATGGATTATTGGGAGGAGGGCTTTTAGTTGTTTACTTCATTTCTCTGTTTTTGAGGTTAATTCAAACACAAGGGTCTCTCCAATTTTAG 1734 0.3189 MAIKVYLSKYTFFMDISFLLLICVFMIIHFNTPKEDIFMVLRNKNNHSTFDDVNDEQGCNTLDNIGDYKAKCVYLKSNDSCVSQGYIDYLYLFYCKFGKFPFLGYTLLFSCLLIIFYLLANTTSYYFCPSLENLSKLLRLSPTIAGVTLLSLGNGACDVFSSLVSFQVSGTRNIGLNTIIGGVFFVTCVVVGIVSISISKRGIHVMKYAFVRDVCVLLFVLLCLLCVLIIGEINVFGAIGFCFMYFVYVIVVYVSSTKWKDSDVGCGDDEKENYGNELNLNVSLLNGVKKGSNIDYVENGIQECDLNIEKNCCFIRSSICRILFCVLEMPLYLPRRLTIPIVNEEKWSKLYGVSSMILAPILLSFLWNTQKGHSIFSTSLIVYGIGLLVGIIFGVIAFFTTNTSMPPKKCLFPWLVGGFIMSVAWSYIIAQELVGLLVSIGLICRISPSILGLTILAWGNSIGDLITNLTLALNGGQEGVQIAISGCYAGPIFNTLVGLGLSLVSSTWSQYPQPILIPKDPYLWETLVFLVVGLVFALVVLIKKDMKVDGLLGGGLLVVYFISLFLRLIQTQGSLQF 577
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Car02g00483 577 PANTHER NA+/CA2+ K+ INDEPENDENT EXCHANGER 1 576 - -
Car02g00483 577 Gene3D - 317 568 IPR044880 -
Car02g00483 577 Gene3D - 140 266 IPR044880 -
Car02g00483 577 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 415 567 IPR004837 GO:0016021|GO:0055085
Car02g00483 577 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 111 253 IPR004837 GO:0016021|GO:0055085
Car02g00483 577 PANTHER CATION CALCIUM EXCHANGER 1 576 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Car02g00483 Car-Chr2 5708987 5711072 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Car02g00483 13 576 Antiporters AT5G17850 49.212 2.18e-162 473
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Car02g00483 K13754 - gmx:100813848 682.559