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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Bva03g02142 ATGGAGGCTGAGCATAATGCTGAGTTACCATCTGTTCAAGTGCCTCTACTTGAAGAGCTAAAGAAGCCAAACGATGCTGAATGCATCCAAAAAGGCACCACCTATGCCAAGACCCTCTTTCATGGTCTTAATTCTTTGTCAGGtgctttttctctctttccattctttctttcttttcttttctttttttataatttctttattgttcTTGTTCTAGTTCTCTTATTAGCTAGGGTTTTGTTACTTGTTAATTATATAGCATATCTTTATGTGTTCGTCGTTAGAACTTTCTTGCTGTGAAACTTTTTCTGCATTACTAGAGATAATTCAGCAATTGCCCCTGCTGAATTCTCACTTTCTTTTGACTTCCTTCTTATGCTTATGCTATTGAATCAGACTTTAGGTATTAGATGTAGTATTATGATTAAGGagttttgatataaaaagttataaaacttATGAAACTTTGCTATTATTACTATTTccgtgatatatatatataaaagaattcacTTATTTcaagaatataatttatagtatgagagtttttaatttaatagttgaaattatgaaagttacattttataataagttattaataaaagaagtatGATGAATCTTAATTCTGGAGTAAGTACATCcctcttatttatatatatatatacacatcaaacattcattataaattatgaggACTAATGTACGTTGGATATTAATGTTCAAGTTTTGCCTAAACTCGATTGCTTTGTTTAATGACAACATATATGATCCATGCTCCATTGCATTCTTTCCTCTTGAACCTGTAATTTTGCTGCATCTTAGAGCTAGCTAGGGATGGTGGTGTGGGGTTTTGTTGAAGCTAGCTAGCCCACATACAAGGGCGTGAACCGTAGGCCATGCAcgcaaaagcaaacaaaaacaaagaacttGAATAATAGTGTCCATATATATGAGTGATTTAGAAAATCACTAGCTTTCTGcattttctgcattttatCTGTGTGATTGTGACCAGTGGGAGGCTCCAAGCTACTTGTTTCCATTTCTactagaaaatagaaattcaaGATACATAGAGTAGAGATATTAGGGTAAATATTTACTCGGAACAATAGCAAAAACCATTAACTTATACTAATAAAGTAAGTTAAgtctcaaattattttaagttaaaaattttaaatttaaaatatttaagtcaCATTTGTTAAAAGAGATTTATCATCTTTAGTAAATCAGTTTTATAGTCAAATGTTGTGAAAATACTTAAAgacaaaccaaaataaaaatgacaactTCTAGAAAGGACTTGGTAGAATTCAAACTAATGACCTTCCACCTAAAATGCTTAAACAGTGAGTTCGTTTTAGTGAGTGAGGCCTTTTCAATTAGAAAAGAGATACCTAGATAACTAAAGATTAGGCACCTCAATTATTTGTAGAGTAATGACATACAACTGATATAAACAATACACAAAATTAAGTCCCGCACGTAAATTCTGATTGGTGAGATTGGCGAAATAAGGAGGAGACCTTTTATTGATACTTGAATTAATGTTTATGCGCGTGTTTCATGTTAATAAAACAGAGGTTACAACAGTCTTCTTCAAATTGTACTCTTCTGTCTTCAATTCTAGGAATTTTCAAACGTGAATTTGTCACTTTCAACATGTATGGTCAGACTAGAGTCATGaagaaaacttttataaaactttaattacaagAGTTAATATTAACTgccttaaatattttaagtaaactcttaatttaatatatgtaaaaatgagaatatcaTCAAGTTagtacttatttaatttttaacattactaatttaatatttatgagattaaatttatataaaaaaaatttctagcaaaattttaactcgatcaaaaaatctttatttgatgtaaaatcaatttcacaactacttaaataatatcaaaatctaataaatattaatttaataatactctTATTTCACAAGTTTTAAATTGAGCATTGTTTTTTAGTCAAAAGTTATAAGCACATTTGAGCCGTGAGATCTCTCTTGTTAGATTGGTTTATTTCTAgtctttttaacataaaaagaaaagtttttccatataattttaaattatttgaaatgactttaaaacaataaaagtatttttaaaaactaaaaatatacttCTAAAAGAACTATGCAAtcagatatttttaaaaaataaaaaaatacaataataattacttttaatatctACTTCAAAGCAAAATCCATCCAAGAGTCTGAAGTTACAAGTTTgaagtcatttttattttgatggatTCATCTGTTTTTGGCCAAAACCAAAAGTACGGTAGGTATGACGTGGATCACTCCCCTCCCACAAGCTTGTACCTTGCAGCGGAACTCATAAATTGGGGAAGACAAGCTCGCGACTCACACTTATAAATAGAGTTGCTGGCTACTTTCTAtccataataaaattaattgggaACCTTGGAGCTTTTTTTCAAGTCTCTGCTCAACAGAGACAATCAATCAAATCTTAAGTTTCTTTGCGCAAAATTCAAGCTTCTTGTCATTACCACCTTTCTCTGTTTCAATGGCCAAAAAGATGAACCAAGAATGGTCCTTGAGCGTCCCTTTCCTAACCAAGTGGAAGAAGAGTGAGCTAGGAGTTGCTATAGATGAGGAAGCATCAGTAAACTGCCATGCTTCTAGCACAAAAGGAGTCTCTTCTTTCAATACCTGTATTAATGGACTCAACGCACTATCAGGAATTGGGATACTCTCCATTCCATATGCACTGGCATCGGGAGGATGGCTAAGCTTGATTCTTCTGTTTAGTATCGCCATGGCGGCATTTTACACAGGATTGCTGATGAAGAGATGTATGGATATGAGCTCAGATATCAGAAGCTACCCTGATATTGGTGAGCATGCATttggaaagaaaggaagaatacTGGTATCAGTGTCCATGTACACTGAACTCTACTTAGTTGCAACTGGGTTCTTGATTCTTGAAGGGgataatttgaataatatattccCCAATATGGAGCTTGAATTGGCAGGTTTTGCAATTGGTGGGAAGCAATTTTTTGTGATACTGATTGGCCTTGTTATTATGCCTTCTGTTTGGTTGGATGACCTGAGCCTTCTGTCATTTGTCTCTGCAAGTGGAGTTTTTGCTTCTGCTATTATCCTCTGCTCAATTTTCTGGGGCGGTGCAATTGATGAGGGAATAGGATTTCACAAAGAGGGAAATCTTCTGAATTGGAGTGGAATCCCCACAGCTGTTAGCTTGTATGCCTTTTGTTATTGTGCTCATCCAGTTTTCCCCACTCTCTATACTTCCATGAGAAATAGACATCAATTTTCTAATGTCTTGCTGGTATGCTTTGTGGTAAGCACTATTGGTTATGCTTCAATGGCTATCTTTGGCTACCTAATGTTTGGTTCAGAGGTTGAATCACAGATAACTCTGAACTTGCCAACCAGCAAAATAAGTTCAAGAGTGGCAATATGCACAACCTTGGTGAATCCCATAACCAAGTATGCTTTGATGGTTACACCAATCAAAAATGCTTTAAAAGGTTTGCTTCCACAGCAGTGCAAGAATAGGCTTATAAACACATTAATCAGCACCAGCTTGGTTGTCAGCACCGTGGTTGTTGCCCTGGTTGTGCCTTTCTTTGGGTACCTCATGTCACTGGTTGGAGCATTTCTAAGTGTCACAGCCTCAATTATTCTTCCATGCTCTTGCTACTTGAAGATTTCAGGCACTTATAAGAGATTTGGGGGAGAATTGGTTGTCATAGTGGGAATCATTATAGTGGGGATAGTAGTTGCTATATTTGGTACTTACACATCTCTGGTGGATATAGCTGGCCATTTGTA 3888 0.2932 MAKKMNQEWSLSVPFLTKWKKSELGVAIDEEASVNCHASSTKGVSSFNTCINGLNALSGIGILSIPYALASGGWLSLILLFSIAMAAFYTGLLMKRCMDMSSDIRSYPDIGEHAFGKKGRILVSVSMYTELYLVATGFLILEGDNLNNIFPNMELELAGFAIGGKQFFVILIGLVIMPSVWLDDLSLLSFVSASGVFASAIILCSIFWGGAIDEGIGFHKEGNLLNWSGIPTAVSLYAFCYCAHPVFPTLYTSMRNRHQFSNVLLVCFVVSTIGYASMAIFGYLMFGSEVESQITLNLPTSKISSRVAICTTLVNPITKYALMVTPIKNALKGLLPQQCKNRLINTLISTSLVVSTVVVALVVPFFGYLMSLVGAFLSVTASIILPCSCYLKISGTYKRFGGELVVIVGIIIVGIVVAIFGTYTSLVDIAGHL 433
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Bva03g02142 433 PANTHER AMINO ACID TRANSPORTER AVT1J 44 429 - -
Bva03g02142 433 PANTHER OS05G0424000 PROTEIN-RELATED 44 429 - -
Bva03g02142 433 Pfam Transmembrane amino acid transporter protein 45 425 IPR013057 -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Bva03g02142 Bva-Chr3 18811970 18816735 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information


Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Bva03g02142 30 431 Amino Acid or Auxin Permease AAAP Family AT3G28960 58.561 2.47e-169 479
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Bva03g02142 K15015 - gmx:100794374 563.533
       

Event-related genes


Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Bva03g02142 03 18811970 18816735 Bva03g02142 03 18811970 18816735 ECH