Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Bisa10g0411 ATGGAGGTTTCTGTGAAATGGTTCACTGTTTGCTGTCTGGTTACGGCATTACTTTTAACTGGCGTCAAGGCATTGAATGAGAATGAGAAAGACCGTCTTGTACAGTCAAGTGAAGTAGAAATGGAGAATTCGTGGAGCTTGAAGAACTCATCAATGGCGGAAAGGTCAAATGATACTTTGAATGAGCATGCAGTAAAAAATCCTGAGGAGATAGCTGCTATGGTTGATATGACCATACGCAATCATACAGAAAGAAGGAATTTGGCTTTCTTCTCCTGTGTGACCGGAAATCCAATTGATGACTGCTGGCGGTGCGACCGGAGTTGGTACCTCCACCGGAAGCGCTTGGCCGATTGTGCAATTGGCTTTGGACGCAACGCCATTGGTGGCAGAGATGGGAAGTACTATGTTGTGTCTGATCCAAGCGATGACGACCCGGTCAACCCAAAACCAGGCACTCTCCGCCATGCTGTAATCCAAGACAGGCCCCTATGGATTGTGTTCAAAAGGGACATGGTGATCACTCTAAAGCAAGAGCTTATTATGAATAGCTTTAAGACCATTGATGCGCGTGGCGTCAATGTCCACATTGCCTATGGGGCTTGTATCACTATCCAATACATCACTAATGTTATCATCCATGGCCTGCACATCCATGATTGCAAGCAAACTGGTAACGCAATGGTTCGTAGCTCACCATCACATTATGGATGGAGGACCATGGCTGATGGGGATGGAATTTCCATCTTTGGTTCGAGCCACATCTGGATTGATCACAACTCACTCTCTAATTGTGCAGATGGCCTTGTTGACGCTGTAATGGGTTCAACGGCCATTACCATATCCAACAATTACTTCACCCACCACAATGAGGTTATGCTTTTGGGTCACAGTGACTCGTATGTAAGAGATAAGCAGATGCAAGTGACCATTGCCTACAACCATTTTGGGGAGGGTCTTATTCAAAGAATGCCAAGGTGCAGACATGGGTATTTCCATGTGGTAAACAATGACTACACCCACTGGGAAATGTATGCAATTGGTGGAAGTGCAGATCCCACCATTAACAGCCAGGGCAACCGATACCTTGCCCCTCAGAACGCATTTGCTAAGGAGGTGACGAAGAGGGTTGACACAGCATCCGGCGTATGGAAAAATTGGAACTGGAGGTCCCAGGGAGATCTTATGCTGAATGGAGCTTTCTTCACTGCATCAGGAGCTGGAGCTGGAGCTAGCTATGCCAGAGCTTCAAGTTTAGCAGCCAAATCATCTTCTGTAGTTGGTGAACTTACCTCTAGTTCTGGCGTTCTTAACTGCCGCAGAGGCTCTACATGTTAA 1338 0.4664 MEVSVKWFTVCCLVTALLLTGVKALNENEKDRLVQSSEVEMENSWSLKNSSMAERSNDTLNEHAVKNPEEIAAMVDMTIRNHTERRNLAFFSCVTGNPIDDCWRCDRSWYLHRKRLADCAIGFGRNAIGGRDGKYYVVSDPSDDDPVNPKPGTLRHAVIQDRPLWIVFKRDMVITLKQELIMNSFKTIDARGVNVHIAYGACITIQYITNVIIHGLHIHDCKQTGNAMVRSSPSHYGWRTMADGDGISIFGSSHIWIDHNSLSNCADGLVDAVMGSTAITISNNYFTHHNEVMLLGHSDSYVRDKQMQVTIAYNHFGEGLIQRMPRCRHGYFHVVNNDYTHWEMYAIGGSADPTINSQGNRYLAPQNAFAKEVTKRVDTASGVWKNWNWRSQGDLMLNGAFFTASGAGAGASYARASSLAAKSSSVVGELTSSSGVLNCRRGSTC 445
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Bisa10g0411 445 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 119 136 IPR018082 -
Bisa10g0411 445 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 416 439 IPR018082 -
Bisa10g0411 445 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 179 195 IPR018082 -
Bisa10g0411 445 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 323 342 IPR018082 -
Bisa10g0411 445 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 143 168 IPR018082 -
Bisa10g0411 445 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 345 364 IPR018082 -
Bisa10g0411 445 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 387 411 IPR018082 -
Bisa10g0411 445 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 243 264 IPR018082 -
Bisa10g0411 445 SUPERFAMILY Pectin lyase-like 73 439 IPR011050 -
Bisa10g0411 445 SMART amb_all 171 368 IPR002022 -
Bisa10g0411 445 Pfam Pectate lyase 197 360 IPR002022 -
Bisa10g0411 445 PANTHER PECTATE LYASE 18-RELATED 64 443 IPR045032 GO:0030570
Bisa10g0411 445 FunFam Pectate lyase 96 438 - -
Bisa10g0411 445 Gene3D - 96 438 IPR012334 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Bisa10g0411 Bisa-ChrBisa10 8941008 8946102 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Bisa10g0411 36 445 Polysaccharide Lyase AT4G13710 75.837 0.0 675