Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Bisa06g0508 ATGGAGTTTTCTGCGAAATGGTTCATCGTTTTTGTTCTGACCACGGCGCTGTTTTTATCTGGCGCCAATGCATTGAATGAGAATGAGAAAGAGAAAGTCCGGCATGTACAGTCAAGTAATGTAGAAACAGAGATGTTGCAGAGGTTGAACAATTCATCAATGATGGACAGGTCAGATGATAGTTTAAATGAGCATGCAGTTGATGATCCAGAGGAGATAGCTTCCATGGTTGATATGAGCATACGCAATCATACAGAAAGAAGGAACCTAGCTTTCTTCTCTTGCGTGACTGGTAATCCTATTGACGACTGCTGGCGATGTGATAAACTCTGGCACAAACGGCGAAAGCGTTTGGCTGATTGTGGAATTGGGTTTGGACGCAACGCCATTGGTGGCCGAGACGGAAGATTCTATGTAGTGACTGACCCAAGTGACGACGACCCAGTAAACCCAAAACCAGGCACTCTACGCCACGCCGTCATTCAAGACAGACCCTTATGGATTGTGTTCAAAAGGGACATGGTCATCACCTTAAAGCAAGAGCTCATTATGAACAGCTTCAAGACCATTGATGGTCGTGGTGTGAATGTGCACATTGCTCAGGGGGCTTGCATTACCGTACAGTTCGTCACCAATATCATCATCCATGGCTTACATATCCATGACTGCAAAAGCACTGGTAACGCAATGGTTCGTAGCTCGCCATCGCATTATGGATGGAGGACTATGGCTGATGGGGATGGCATTTCCATCTTTGGTTCAAGCCACATTTGGATTGACCATAATTCGCTGTCTAATTGCGCCGATGGGCTTATTGATGCTATAATGGGCTCCACTGCCATCACTATTTCCAACAATTACTTCACCCGCCACAATGAGGTTATGCTACTCGGTCATAGTGATTCATATGTGAGAGATAAGCAGATGCAAGTGACCATTGCCTACAACCATTTTGGGGAGGGTCTTATACAGAGAATGCCAAGGTGCAGACACGGATATTTCCACGTGGTAAACAATGACTATACCAACTGGGAAATGTATGCAATTGGTGGCAGTGCTAATCCCACAATTAACAGCCAAGGCAATCGATACCTTGCCCCTGGAAACCGTTTTGCTAAGGAGGTGACAAAGAGAGTGTTGACAGCGACAAGCGTATGGAAGGATTGGAATTGGAGGTCAGAAGGAGACCTGATGCTGAACGGAGCCTTCTTCACTTCCTCAGGAGCTGGGGCTGCAGCCAGCTATGCCAGAGCCTCCAGCTTAAGCGCCAAATCCTCTTCTCTGGTTGCTGTCCTCACTTCTGATGCTGGCGTTCTTACCTGCCGCAGGGGCCACTCCTGTTAA 1344 0.471 MEFSAKWFIVFVLTTALFLSGANALNENEKEKVRHVQSSNVETEMLQRLNNSSMMDRSDDSLNEHAVDDPEEIASMVDMSIRNHTERRNLAFFSCVTGNPIDDCWRCDKLWHKRRKRLADCGIGFGRNAIGGRDGRFYVVTDPSDDDPVNPKPGTLRHAVIQDRPLWIVFKRDMVITLKQELIMNSFKTIDGRGVNVHIAQGACITVQFVTNIIIHGLHIHDCKSTGNAMVRSSPSHYGWRTMADGDGISIFGSSHIWIDHNSLSNCADGLIDAIMGSTAITISNNYFTRHNEVMLLGHSDSYVRDKQMQVTIAYNHFGEGLIQRMPRCRHGYFHVVNNDYTNWEMYAIGGSANPTINSQGNRYLAPGNRFAKEVTKRVLTATSVWKDWNWRSEGDLMLNGAFFTSSGAGAAASYARASSLSAKSSSLVAVLTSDAGVLTCRRGHSC 447
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Bisa06g0508 447 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 347 366 IPR018082 -
Bisa06g0508 447 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 418 441 IPR018082 -
Bisa06g0508 447 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 245 266 IPR018082 -
Bisa06g0508 447 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 121 138 IPR018082 -
Bisa06g0508 447 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 181 197 IPR018082 -
Bisa06g0508 447 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 325 344 IPR018082 -
Bisa06g0508 447 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 145 170 IPR018082 -
Bisa06g0508 447 PRINTS Pollen allergen Amb family signature 389 413 IPR018082 -
Bisa06g0508 447 FunFam Pectate lyase 98 440 - -
Bisa06g0508 447 SUPERFAMILY Pectin lyase-like 76 442 IPR011050 -
Bisa06g0508 447 PANTHER PECTATE LYASE 18-RELATED 66 444 IPR045032 GO:0030570
Bisa06g0508 447 SMART amb_all 173 370 IPR002022 -
Bisa06g0508 447 Pfam Pectate lyase 182 362 IPR002022 -
Bisa06g0508 447 Gene3D - 98 440 IPR012334 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Bisa06g0508 Bisa-ChrBisa06 12678343 12684225 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Bisa06g0508 38 447 Polysaccharide Lyase AT4G13710 77.273 0.0 684