Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Bach13g01164 ATGACTGATTCCAAGGAGAAAAAGCGAAACTTTGTGGAGACCATTGAACTCCAGATTGGGCTGAAAAACTATGATCCGCAGAAGGACAAGCGTTTTAGTGGTTCTGTGAAACTGCCTCACATCCCTCGCCCTAAGATGAAGATATGCATGCTTGGAGATGCTCAGCACGTTGAAGAGGCAGAGAAGATAGGCCTGGACTATATGGATGTGGAAGCATTGAAGAAGCTTAACAAAAATAAGAAACTGGTTAAGAAACTTGCTAAGAAGTACCATGCGTTTTTAGCCTCTGAAGCAGTCATTAAGCAGATTCCTCGTCTTTTGGGTCCTGGGAAGTTTCCCACTCTTGTTACTCACCAAGAATCTCTAGAGTCAAAGGTTAATGAGACCAAGGCTATGGTAAAATTCCAGCTTAAGAAAGTGCTTTGCATGGGAGTTGCTGTGGGGAACGTTAGTATGGAGGAAAAGCAGATCTTCCAAAACGTACAAATGAGTGTTAACTTCCTTGTCTCCTTGTTGAAGAAGAATTGGCAGAATGTTCGATGCTTGTATCTGAAGAGTACTATGGGGAAATCATACCGAGTCTTTTGAGGGCTGGACTTTACTTCTCCAAGTATCTGTGGGGCACCATACACTTGATTATCTAGAGTCCGCCGATAGTTGGACAAGTATTTTCATATTTTTGCAGTTTTGGTTGAAATGTTCTTTAGTTTTGTTGTTCCTGATGTTATTTTAAATACCTAGCGACAATGGTAATGTTAAATTTGATGTTTTTGTTTTACCCATGCCGCTCTGAAATGCGTTTTAATTGTTTTAAACTGCGCTTAGGGCGCTCTATATTTATAAAATTGGAATGTTCGTTCCTTGGTTCGGATTGTTCAAAATAGTGAGCCTCTCTGTTTAGAGTGCTGTCGAATCTTTTATTGCGAGGTTAATACGAAGAAATGTCCATGAAGATGTTTTCTGGCATTTTTTCAGTCGTTCGCTAGCGAAGCTATAATTGCCAAACTGTGCCCACGGGACTCTTGTGCCTACTACCTCTTTGCGAAAGACTGCGAGCCAGTTTCAAAGTGGTTTGAGTGCCTCTCCCACTTTGAACTGCGGCGGAATCATTTACTGCGACTATGCAAACTGCTAGAACTCGTTACTATTTTGAGTGAAATTATTTCTTCATTTTTCAATAATACTTTCTTATAAATTATTTTCAAAAATTAATTCTTGGGAAGTGATTTCAAACTTAATTTCTCTTTTGCTTATTTCTCGTTTGCACAATTTAGATAGACAGAAGTGTTTTACCCAAAAAAAATTAAAAAAAACAGTAGAAAATCAAAGTGATGTAGATTATAATCTGCCATTCAGAACATATTCGAAGACTTGTTTCCTAAGAACCGTGATTAATTTAGTTTATAATAAATTTATGGAAGAAAATATAATCCGTAGTTGTTTTGTTAAAAATTTAACTGTTTTTTATAATTAAAAAAATTAACCTTTTTAAGGTCACAACTATTTCGAGTTGGGCCAGTGGGTCCAATTTAATTATTTAAATTTAAATTTTCTTGATAAGCACGAGAGGGGAAAAATTGGTTGGCGCATGAAAAATGAAATCCAAGGAATAACAAGACGGTTATTTAAGAAATATTTTTTTATTTTTTGAAATATATTTTGTACATTGTGTTTTTTTTTTTTTTATTCTCATGTTCGTTTTACTTATTTTTATATTCATTTAATATTTATTAATCACTTTCAATAAATTTACTAAACTAGTGATTATTTTGAAAACATTCAAAACCATTTTTTTTTATATTTTAAAAATATTTTAAATTTTTTGTTTATTTTTAATAAGAAAATATTTTTATTTATCTTTTTGTTGTGCAAATTATTTGGAAGATCCACTAATCCGGTTTAAGCATTATAAGCCAGCAAAATTATCTGTATTCTCCGGTTTAAGCGTTATAAACCAGCTAATTTGTCTGTATTAAACAAAAAAAGAAAAGGCAATGGGCTCATATTTATCTAATTAAACATATTTCCAAATATTATAAAATAAAAAAAAGGCCACGGGCTCCTATTCTTTAAGTCCCATTTCCACTTGCATCTCAATTGAATCATAGGTACCGTTGCTCTCTCTTGGATTTTTCTGTCTATAAATATGGGCTATTCTAATAGTTCACTCGTGATTCTGCTCTTATTATAGGTTTCTCGGCTGCCCACTGAAAGTACAAGAGCGAGACCGTCATCTCCCGTATACTCTTATCACTGCGCCGTTGCCCTCTTCATCTCTGTATGCGCTTCAAATCTCTGCCCTTCTCTCTTTCTGTGGATCTTTCTGTTAGATCTTCATCTATTTAACGTTTCGTGCTAATGTTCAGAGCTTTGCTTTACTGTTTAGTTTAGGGTTATCGCTTGGCTAATTTAATAACAGGAGCTACGAATCCTCTGAAAATAATAGAAAAAGTCTTCTCTGGGTTTTGATCCTCCAGCTCTTATTATTTTCGTATTCTTAGTTTCTTTCTCTTTTAGTTGTAAATTAGGCAGGTTGATCTATATTTGGACATGTTGCAGTGAAAATGAGTTAAAAGCTATGCTTTTGATATGGTTAAGATTGCTGAACTTGTTTAGAACACCTGAAGGCCTCGGCACTTGATTGCTCCTGTTTTTAGTTATGCGACTTATGTCGTTTCTAGAGCTTTCCAGATTACCTCTATATATAAGTATGGCCTGGAGAGTTGCTTGATGTGGCCGAAAGCTATTCGCATACTGAATTTCTTTATTTAGTTGTTGTTGCTACGATGCAGTGCTAGAGTTGCAGGATCTATCTTTAGGAAAAAATTTAGTTCTATGCAAATATTGACTTCGTCCTACTTTAAGCGGTACTTTGCTACATAGGCACTGAGAGAACAGAACAAGGCTGATTTTGCAGGTGGTCGTAAATTTGGAGTCTCGAGTGAAGAGCAGAGAGCCATTAGCTTGCTCTTCTCATTGTACTCCATAAACTAATTGCCTAATAGAACAGGAATGAAAATGGTTCCATTCTTTGTAAACTATAAAGGCATAAATTCAAATACCATTACGGTGTAGAACTGTTCTTAATTTGCTTTAGGATTATACACATTTACGTACCTAGTGCTACAGGCCTTTGTGGTGGTGTCCTTCTCTGTTTGTTCTATTTGTGGGCTCGAATTATGCTACTATTTTCTTCAATAGTTATGTCAACTTTGGAGAATTTCCCTCTTAGCACATGCTTCTCATGTAGACCTACGTTGGTTTTCAATGGTAAGCTTTAGCTGGTCGGGTTCTACCTTGGGAGATGGTAAGTTAAGTGGTGACCTAATGTTCATAAGAGAGAGGATTCTATATTATGCATGGGCTGAGGTAGACAAAGCACAGGAAACCATCAAATGTACTGCTCATCAAACTTTTGCAACGACAAACATCACAGTTAAATGTCTGTCTAGCAGTAATATTCTTATATAACTTCAACTGAATATGACTTCAGTGTCTGGACGTCACTTTTACTTATTGTAATTGACCAATTTTAATTCTAGTTGTCATCTCTTAAAATGATGAATTTTGTAATGTGGATTCCTTTTCAGGTAACAATGTCAACCATGTCGGCTGTGACGGTTTCCCCCCTCTGCTCGCATCAAACGACAAGCCAAAATAGATTCACCAGCACCATAATTAAGTTCCCCTCCTCTCTTGGATCAGTGAAGAGTGTTTCCAGGTCTTTTGGCTTGAAATTATCCAACATGTTTAGAGTTACTGCCATGGCTGCATACAAGGTTAAGCTGATTGGTCCAGAGGGACAAGAGAATGAGTTTGAGGCCCCTGATGACTGTTACATCCTTGATTCAGCAGAGAATGCTGGAATTGAGCTCCCATATTCGTGCAGGGCCGGAGCATGCTCTACCTGTGCTGGAAAGTTAGTTTCTGGGTCGGTGGATCAGTCTGATGGTTCATTCCTTGACGACAATCAAATGAAGGATGGTTACTTGCTGACCTGTGTGTCCTACCCAACTTCAGACTGTGTAATTCATACTCACAAGGAATCTGATCTCTATTGAGGAGTACTGGCCAGAATATTATATTGCTAGGTTCCTCTAGTTCGTCTTTGCGGGTAGAAAACTTTGATTTTAAAATAACATGGCTGGCCAACGTTGCTTGCCCTGCTTTCAAATTGCCTATTGTTGTTTATCCTTGGCACATGAAGCAGTTATTAGTATGTTTCTGTTATTATATGTTGGGCTTTGGAATTATCTGTGATAAGAAAG 4268 0.3667 MTDSKEKKRNFVETIELQIGLKNYDPQKDKRFSGSVKLPHIPRPKMKICMLGDAQHVEEAEKIGLDYMDVEALKKLNKNKKLVKKLAKKYHAFLASEAVIKQIPRLLGPGKFPTLVTHQESLESKVNETKAMVKFQLKKVLCMGVAVGNVSMEEKQIFQNVQMSVNFLVSLLKKNWQNVRCLYLKSTMGKSYRVF 195
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Bach13g01164 195 FunFam Ribosomal protein L10a 1 103 - -
Bach13g01164 195 Gene3D - 49 133 IPR016095 -
Bach13g01164 195 PANTHER RIBOSOMAL PROTEIN L7AE FAMILY MEMBER 6 189 - -
Bach13g01164 195 SUPERFAMILY Ribosomal protein L1 6 195 IPR023674 -
Bach13g01164 195 FunFam Ribosomal protein 49 133 - -
Bach13g01164 195 CDD Ribosomal_L1 5 194 IPR028364 -
Bach13g01164 195 Gene3D - 5 190 - -
Bach13g01164 195 FunFam Ribosomal protein 116 193 - -
Bach13g01164 195 PIRSF RPL1p_RPL1a_RPL10e_RPL1o 2 195 IPR002143 GO:0003723|GO:0003735|GO:0006412|GO:0015934
Bach13g01164 195 Pfam Ribosomal protein L1p/L10e family 5 189 IPR028364 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Bach13g01164 Bach-Chr13 16118319 16123209 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Bach13g01164 4 195 Cytoplasmic Ribosomal Protein Gene Family AT1G08360 90.355 2.91e-116 327
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Bach13g01164 K02865 - gmx:100305550 355.525