Gene search


Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Bach13g00285 GGGAGACCTAAGTAGCAGATCGAGAAATCCTCTCTCCAATTCTTTGTTTGGTTAATTCTGGGTAATCCTCAGTCTCCTTCACCGATTCAGTTTTGCTTCAATTTTTCTTGATTTCAAGTCTGGGGTTTCGCTTTCGCAAAATCGAAACCCTAGATTCTGTTATATACTGTACCTGGGTTTGGGCGTTTTGGTGCTCAACCTCACTTTGAATAGTCTTTGAGGGTTTTAGGATTAAAGATTCGAAATGAACGTGCAAAATGACTTATTTTGTCTAAATCATAGAAAGTTACGTGGGATTTTTAATGGGCTTTGCGCCATGGTCCTATTTTTCTTTTTTTACAATAGGGAAGATATTATCAGTAACCCTCTTCTTAGACAATCTGCATATTTGGTAAATCATCGTATGCCTTCTAGAGATGGTTCGTCACAATTTACTGTAATTCATCGCCGAATGGTTGAATTGAGCGTTAACGCGTCAAATTCAGTTGATCAACACCATGAAAAGGATTTGCCTGTAAATAATGCTCGATCTTGCAGTGGGTTGCTCCAGCATGTTGGTTATGCCAGTGCGTGTGAGTACTTAAAGGCCAATCCACAGTGCTCTTCAGGGGGGTTTCTTGATTACCTGAAGTTTTTCTATTGCAATTGTCAAAATTTGAGTGTCCTGGGTTATCTAGTATTGGGTATATGGCTTGCTGCTCTATTTTATCTATTGGGAAATACTGCAGCAGACTACTTTTGCCCTTCTCTTAAGCATCTTTCAAGGCTCTTGAAATTTCCACCAACTGTTGCTGGGGTTGTGCTTCTTCCACTTGGGAATGGAGCCCCTGATGTGTTTTCCAGTATAGCTGCCTTTGTGGGTACAGATACTGGTGAAGTGGGTCTTAACAGCGTGTTAGGCGGTGCTCTATTTGTTACTTGCATTGTTGTTGGGACGGTTTCTCTTTGTGTTGCAGACAAAGGAATTCAAATTGATCAGAGATGCTTTATTAGAGATGTTTGTTTCTTTCTTTTCACTCTACTATCACTGTTGCTGATATTAATTTTTGGGGAGGTAAGTGTTTGGGTTGCCATTGCTTTCGTATCAATTTATGTTGTTTACGCATTTTCTGTTGCTGCAAATGAGATATTACGGAAGCATGCACGGAGGTTGAAGTTGGATGCTGTGACACCATTGCTTCCTGTCCGAGGAAGTGTGTTCTCCCAAGGTTCAGAAGAGGATGTTTCTATATATAGCTCTTTGCTTGACTTAGACACTGAAAATGATCCTCCTGTTCTCCCTGCTTCCTTACCGCAGTGGATGTGGTCTTCAAATGTGGCAATATATTCAAACCAGGCAAGTAAAGTTATGTTGGATGATGAAAGGCCTCCTTGGGGATGGAGTGACGAGAGAACAGAAAACACCAGCTCCTCATTCTCTATTTCAAAACTCTTTTTGCTGATGGAAATGCCACTTACAATTCCTAGACGGCTAACAATTCCACTGGTTGATCAGGAAGTTTGGTCAAAGCCATATGCTGTGGCCAGTGCATTATTGGCTCCAATTCTTCTGGCATTTTTGTGGAACACCCAAGATGGTGTGAGTTATCTGGGAATTGTTCTTTCTTGTCTTGTCGGTGTTGCTATTGGATGTACACTAGGCATTCTTGCATATCAACACACTGTATCTGATCATCCACCAAGTAGGTTTTTGATTACATGGGTTCTTGGAGGATTCCTTATGAGCATAGTGTGGTTCTACATCATTGCAAATGAGCTTGTAGCTCTGTTAATAACATTTGGGATAATTTTTGGGATCAATCCATCTGTCCTGGGATTAACTGTTTTAGCATGGGGGAATTCAATGGGGGATTTGATGTCAAATGTGGCGATAGCAATGAATGGAGAAGAGGGAGTTCAGATTGCTTTATCTGGATGCTATGCTGGTCCCATGTTCAACACTCTTATTGGTTTGGGGGTATCAATGCTGCTTGGTGCCTGGTCAGCTCGACCTGCTTCCTACATGGTTCCAGAAGACAGTAGCTTATTTTTTACCTTGGGATTCCTCATTTCAGCACTACTATGGGCACTTGTGGTTCTACCTCGCAATGACATGCATCCTAGCAGAAAATTAGGCTTGGGCCTCATCGCACTCTACTTGATATTTCTTTCCTTCAGGTTGTCCATTTCTATGGGGCTCATATCTGTGGCTAGTTTTCATTGAATGAACGTGCAAAATGACTTATTTTGTCTAAATCATAGAAAGTTACGTGGGATTTTTAATGGGCTTTGCGCCATGGTCCTATTTTTCTTTTTTTACAATAGGGAAGATATTATCAGTAACCCTCTTCTTAGACAATCTGCATATTTGGTAAATCATCGTATGCCTTCTAGAGATGGTTCGTCACAATTTACTGTAATTCATCGCCGAATGGTTGAATTGAGCGTTAACGCGTCAAATTCAGTTGATCAACACCATGAAAAGGATTTGCCTGTAAATAATGCTCGATCTTGCAGTGGGTTGCTCCAGCATGTTGGTTATGCCAGTGCGTGTGAGTACTTAAAGGCCAATCCACAGTGCTCTTCAGGGGGGTTTCTTGATTACCTGAAGTTTTTCTATTGCAATTGTCAAAATTTGAGTGTCCTGGGTTATCTAGTATTGGGTATATGGCTTGCTGCTCTATTTTATCTATTGGGAAATACTGCAGCAGACTACTTTTGCCCTTCTCTTAAGCATCTTTCAAGGCTCTTGAAATTTCCACCAACTGTTGCTGGGGTTGTGCTTCTTCCACTTGGGAATGGAGCCCCTGATGTGTTTTCCAGTATAGCTGCCTTTGTGGGTACAGATACTGGTGAAGTGGGTCTTAACAGCGTGTTAGGCGGTGCTCTATTTGTTACTTGCATTGTTGTTGGGACGGTTTCTCTTTGTGTTGCAGACAAAGGAATTCAAATTGATCAGAGATGCTTTATTAGAGATGTTTGTTTCTTTCTTTTCACTCTACTATCACTGTTGCTGATATTAATTTTTGGGGAGGTAAGTGTTTGGGTTGCCATTGCTTTCGTATCAATTTATGTTGTTTACGCATTTTCTGTTGCTGCAAATGAGATATTACGGAAGCATGCACGGAGGTTGAAGTTGGATGCTGTGACACCATTGCTTCCTGTCCGAGGAAGTGTGTTCTCCCAAGGTTCAGAAGAGGATGTTTCTATATATAGCTCTTTGCTTGACTTAGACACTGAAAATGATCCTCCTGTTCTCCCTGCTTCCTTACCGCAGTGGATGTGGTCTTCAAATGTGGCAATATATTCAAACCAGGCAAGTAAAGTTATGTTGGATGATGAAAGGCCTCCTTGGGGATGGAGTGACGAGAGAACAGAAAACACCAGCTCCTCATTCTCTATTTCAAAACTCTTTTTGCTGATGGAAATGCCACTTACAATTCCTAGACGGCTAACAATTCCACTGGTTGATCAGGAAGTTTGGTCAAAGCCATATGCTGTGGCCAGTGCATTATTGGCTCCAATTCTTCTGGCATTTTTGTGGAACACCCAAGATGGTGTGAGTTATCTGGGAATTGTTCTTTCTTGTCTTGTCGGTGTTGCTATTGGATGTACACTAGGCATTCTTGCATATCAACACACTGTATCTGATCATCCACCAAGTAGGTTTTTGATTACATGGGTTCTTGGAGGATTCCTTATGAGCATAGTGTGGTTCTACATCATTGCAAATGAGCTTGTAGCTCTGTTAATAACATTTGGGATAATTTTTGGGATCAATCCATCTGTCCTGGGATTAACTGTTTTAGCATGGGGGAATTCAATGGGGGATTTGATGTCAAATGTGGCGATAGCAATGAATGGAGAAGAGGGAGTTCAGATTGCTTTATCTGGATGCTATGCTGGTCCCATGTTCAACACTCTTATTGGTTTGGGGGTATCAATGCTGCTTGGTGCCTGGTCAGCTCGACCTGCTTCCTACATGGTTCCAGAAGACAGTAGCTTATTTTTTACCTTGGGATTCCTCATTTCAGCACTACTATGGGCACTTGTGGTTCTACCTCGCAATGACATGCATCCTAGCAGAAAATTAGGCTTGGGCCTCATCGCACTCTACTTGATATTTCTTTCCTTCAGGTTGTCCATTTCTATGGGGCTCATATCTGTGGCTAGTTTTCATTGAGACCCAAAAATCGATATAGATTAGTTGTAGCGAAAACTGCTGTCCTGCTCACAGCTGATAGGAGAAAAGAGAGTAAGAGAAGCAAAAAGATATGGCAGTTGTATATAGCAGGAATTCGTTGTACGAGCAGAAAATGCCATTGTAGTATATGTGGACTCATCATTTACTCATTGATTGAATTAACAACAGGTATTCTT 4359 0.4148 MNVQNDLFCLNHRKLRGIFNGLCAMVLFFFFYNREDIISNPLLRQSAYLVNHRMPSRDGSSQFTVIHRRMVELSVNASNSVDQHHEKDLPVNNARSCSGLLQHVGYASACEYLKANPQCSSGGFLDYLKFFYCNCQNLSVLGYLVLGIWLAALFYLLGNTAADYFCPSLKHLSRLLKFPPTVAGVVLLPLGNGAPDVFSSIAAFVGTDTGEVGLNSVLGGALFVTCIVVGTVSLCVADKGIQIDQRCFIRDVCFFLFTLLSLLLILIFGEVSVWVAIAFVSIYVVYAFSVAANEILRKHARRLKLDAVTPLLPVRGSVFSQGSEEDVSIYSSLLDLDTENDPPVLPASLPQWMWSSNVAIYSNQASKVMLDDERPPWGWSDERTENTSSSFSISKLFLLMEMPLTIPRRLTIPLVDQEVWSKPYAVASALLAPILLAFLWNTQDGVSYLGIVLSCLVGVAIGCTLGILAYQHTVSDHPPSRFLITWVLGGFLMSIVWFYIIANELVALLITFGIIFGINPSVLGLTVLAWGNSMGDLMSNVAIAMNGEEGVQIALSGCYAGPMFNTLIGLGVSMLLGAWSARPASYMVPEDSSLFFTLGFLISALLWALVVLPRNDMHPSRKLGLGLIALYLIFLSFRLSISMGLISVASFH 652
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Bach13g00285 652 Gene3D - 178 310 IPR044880 -
Bach13g00285 652 Gene3D - 425 639 IPR044880 -
Bach13g00285 652 PANTHER NA+/CA2+ K+ INDEPENDENT EXCHANGER 53 647 - -
Bach13g00285 652 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 148 288 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
Bach13g00285 652 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 487 638 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Bach13g00285 Bach-Chr13 7236481 7238880 Transposed
       

Functional genes information


Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Bach13g00285 78 644 Antiporters AT5G17850 41.156 4.62e-125 380
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Bach13g00285 K13754 - gmx:100796101 978.778