Select | Gene | Cds | Cds_length | GC_content | Pep | Pep_length |
---|---|---|---|---|---|---|
Bach12g01102 | CCAGCTTGAGCCGCTCCTGGAGATCCAGCATGACTTTCAAGAGAAGGAATGGAGGTCGCAACAAACATGGTCGTGGGCACGTCAAATTCATACGCTGCTCCAACTGTGGCAAATGTTGCCCTAAGGACAAGTCAATTAAGAGATTCCTTGTGAGGAATATAGTGGAGCAAGCTGCAGTGAGAGATGTGCAGGAAGCTTGTGTCTATGAGCAATACACTCTGCCCAAGCTCTACGTTAAGATGCAATACTGCGTGTCCTGTGCAATACACTCTCATGTTGTGAGGGTGCGATCTCGCACTGATAGGAGGAAGCGTGAGCCACCACAGCGCTTCATGAGGCGCAGGGATGATCAACCAAGGCCTGGTCAGCCTGGTCAAGCACCTCGCCCTGCTGGTGCAACAGCTCCTCCCCGCGCATAGGAATTTATTTCCCTTCCGCTTTGATATGGAGGTTTACCTTTTTTGCTTAGGGAAATGCTTTTCTTCTTAATGTCTCATTCGTGTGGATACTTTTTTTTATTAGTATAATTTTGTTCTGATGAGGATGAGGATGAACCCTGAGGTTTATTACTTATGTTCGAAATGGTTGCGTGGCTTACATCAGCTTGGTCTCATTTATTTAACCCCATCTTCCCACCAAACAGAACCGAAAATAGTAGATGTTAATGCCAAGTTAAATGGGCTTTGTAACTTGTTCAGACTTCTTATTTTCCATATTTCAGGTTTGTGATTGAATCTGTTTTCTATATTTCATGCTCAGATCGAATCTGGTTGTGGTTGTTAATACATTGGATTCATCAAACTCCTTTATTAAATTGTTCTTTACCCGCCTATATATTATGAGTCGTTCAAATGTGAGCTCGTGTAATCAGTGATTCAGTATAATAGCATTCTCTACTCTTTTATAGACAAATTGTTTGTCATGCCATATAATATCAAGTTAAAATGTGAACTCGAGTAGTCAGTGTGAATCGTATAATCTTCTGGTCCTTTCCAGTCTTAAAATTCCTCTCAAGTCAAATAGATTCTTTCGATAATATGGTCAAATTGTACAACTATACCTTGAACTATTTCATACGCGTCTCCATCGCAAATATCGACAGTTTCAGCTATTGTCTAGTTGGTTATAATTCTGAGTCTTTGAATAAAACGAATGTGAAAATAGAGCAATTTGGAGGTTTGTTTTAAGTATCATTTTCCAAGTTCGTTAGAGTGTTGACTGGAACAAAATATTGCAGTGTTAAACATATGTGTATGTATATATATATATATATATATATATGAAAAGAGATTAGAGGAAGAATTAATGACAGCAATCCTGAATTGTATGTCAATTCAACTCATCTTCTGTCAGGCATTAAGCCATTTACCATTGCACCGTCCAAGGTGATGGGCTTTATATAATTCATTTACAGCCAAAGATTCAGTCTAAGCACTCGAATTACACAGCAGTTCCTTGGAAATCCTAATGCATTCGGTCATAGGACAACTAGTCTTGATCGCATTGGTGGAAATGTGAGACCAGGGCGTTTTTGACTTATAAAACTTCATTATGAGCCAAAATGAACTATAACCTCTTCTCATATCCAACCAATAACACAAAATCTGACAATGGTATAAAATGATATAGAATAGAAGACAGAATAGACAGTTGTTGTACATTAGAATTCTTATCAGCTTGAGTTATCAGGATCTGATACTATTGTTTTAGGTAATCTTAGAATCAAACTATTGATTTTTAAAGTGGGGCAAGTTACTCTTGGTTACTTGCTTTCTGTAGTTTTATAACCTAAACTTATATTATTTATATGTTTTAATTTCTTTCAATATTTCAAAGAAGAGAGAACAAGAAATTCTGAAAGTCCCAATGTAATGAATTATATGTGTGTATCAAAGTTCTTTAAAATCATATTAAAATCATGACATTTGTTTATAGGGTGTCATGTTAATAATATTGAAGTTTGAAGGTACATATTTCACGTCTTTGTATTTCAAAATATTTGTTATACAATTATATTCCATATTGGATATTTTATAAGAAATAATTATTTATCAATTATTAATGTAATGTAATTTCTTAAAGTAATGTATTTAGACTAAAACACTATTTTTTTCTCTTAAAATTTACTAAAATAAAATAAAATAAAATAATGACGAATTTACTAAATTAAACTTTTACTTTACAAAAAACTCTATAACAAATTAAACATTATGTATAAACAAAAAGATTTGCAAAAAAAATAACTTTGATAATATTTTTACAATATGAGAGTTTAATTTAACAAATTTGAAATATGAAATTTTTTCTTAACTTTTTTTATTCAAATATTTACTTGGTGAATCAAGATTAAGGATCACATTTCCATTTCCCAAATGGACACTGTTAACGGAAATATATAATTGTATATAATTAGAATTTCTTAGATTAGGAAACAGGTAATCAATCCTTTGATTTTAGGGATTAGATTACCTAATTAGTCTCCTCCCTAGCTCTGTATGCATACATGTATTCAGATTACAGATACCAATCCATGAATGTCAAGGAAAATATGAATGTAATGCTTGGAATTGATGGCTGAGATTTCATTTTCTAGTTCTAGGAGGCAAAATTCCAAGTAAAAATGGAAATGGAAAATATCGATTACATCAAATCGAACTGATATAAATCAGACTATGGCATTTTTACATGGGAAAAAAATTAACACTATATATAATTACAAGGAAAAAGGATGGAAAAGAAAAATATATCAGAAAATGGTCTGATGTGAGTCTCCTTTTTGGAGGAGATTTCTCTATGATCTGCTTCTGTAAGTCCATGAATGTAGAACCCTTATCAGCAAATAGTCTTCGCAAGTTGATAACAGAAAGCTCATTAAAGCTAGCAACAGCAAAATCGGCTTGGCCCGGATCATACCTGCAAGTTTTAACATCAATTTCAGAATGGAAATTAGTTTCGGTTTTCCATTTCAGTCGAAAACAAATGCGATTGATTAGATTTTGGTGGCGGTGCCGGCACGGAGCTCAGTGGTGAAGGTAGAGTTTCGCTGAGAGAGCTTGAAATACTTGCCCACCCTGGTATTGGCTACGTAAGTGTTGAACCGAGACAGGGGCCTCCGCGAGTGTTGGGGTAATGAAGGCCCTTGAGCTTCCGCCTCCGCCTCCATCTCCGTCGCCATCAAATTCAAAGTGATCTCTTAGTTTCACGAGACGGCCGATGATAAGATAGTGAACCAAAGTTAGATTTTTTTGTTTAGAAGATGGGCAGGGGAGTTGGAAGGTAGAGAGGAGGATAATAACATATAAGAGGGGATCTTTTAAACACGAAAAAGTATCTGTGGGAACAAATTATTAGACAACTATCTATGAGTGTGAACTTAAAATGGCAAAAGAGCCGTACAATACTGTTTAACGACTTGCTAGTTTCTTTTATATCCAAAGGGTGAGTTCTTTTCCATGTGTATTCAGTTTTGGGCTTTAGGCCTTCTTTCAAAGGGAGCGTACATCTTCTAATTTTCTTAACAAAAAAAAGAGGACAGAGTTCATTTTCTCTCGATTTTTTTTTTTTAACTTATATCACACAAAATCAACAAAGAACATCCATTTTTCCTTTAAAACCATGAATTCATTTATTTTTTTGGCAAATAGTCTATCAATTTTTTTTTTCGCTCAAACATAATCTTTTAAATAAAAGTTACTATATTCTAAGTAATATTTAAGAACTTTAGAATTCAATTATTATGTTACAGAAAAAAAAAATTCTCATAAATGAGTGTAATAAGAAAAAAGTAAGATTATAGGAAGTGTTATACAAAGTTAAGAATATTTGAGATTTTTTTTTCAAAATAATTCAAAATTAATTTTTTTTTTTTTTGCACTTCGATATTTTTGACTATATTACACATATATTGTGATTTAAAATGATGTATATATCCTTTCATAAAAAATCGTATATCTCCAATAGAAAATAGGGAGGATTGGATTTCCTCTATAATCTTCTTTTGAGAAATTAAAAAGACCTTTGGGAGAGAAACGTTTTGAAAAATTACGAGGGGAATAAATAGTGAAAAAATGAAGTTTTTTTTTTTTTTTTGCGGCCCCAATCTGTATGATATTGGGCTGGCCGCTATAAAAGCTAATTCACCTCCGAAACCCTAATACTCCTCTCTAGCAGCAGCATCTGGAAAACGGCTCAGCCGTCCACCTCCAGAAGCTTCAGATTTCGCTAGCAATCATGACTTTCAAGAGAAGAAATGGAGGACGCAACAAGCATGGCCGTGGACATGTCAAGTTCATCCGGTGCTCCAACTGTGGCAAATGTTGCCCTAAGGACAAGTCAATTAAGAGATTCCTTGTAAGGAACATTGTGGAGCAAGCTGCAGTGAGAGATGTACAGGAAGCTTGTGTCTATGAGCAATACACTCTTCCCAAGCTATATGTGAAGATGCAGTATTGCGTCTCATGTGCCATTCACTCGCATGTTGTCAGGGTGCGATCTCGCACTGATAGGAGGAAGCGTGAGCCACCACAGCGCTTCATGAGGCGCAGGGATGATCAACCAAGGCCTGGTCAGCCTGGCCAAGCACCTCGCCCTGCTGGTGCAGCAGCTCCTCCCCGCGCATAGGAATTTATTTCCCTTCCGCTTTGATATGGAGGTTTACCTTTTGTGCTTAGGGGAATGCTTTTCTTCTTAATGTCTCATTCGTGTGGATACTTTTTTTATTAGTATAATTTTGTTTTGATGAGGATGAACTTGAGATTTATTACTTGTGTTCGAAAGAACTTGAGATTTATTACTTATGTTCGAAATGGTTGCGTGGTTTACATCAGCTTGGTCTCGTTTATTGGGATCTTCCCACCAAACAGAACCGAAAATAATAGATGTTCATGCTAAGTTAAATGGGC | 4901 | 0.353 | MTFKRRNGGRNKHGRGHVKFIRCSNCGKCCPKDKSIKRFLVRNIVEQAAVRDVQEACVYEQYTLPKLYVKMQYCVSCAIHSHVVRVRSRTDRRKREPPQRFMRRRDDQPRPGQPGQAPRPAGAAAPPRA | 129 |
Select | Seq ID | Length | Analysis | Description | Start | End | IPR | GO |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Bach12g01102 | 129 | Gene3D | Ribosomal protein S26e | 1 | 114 | IPR038551 | - | |
Bach12g01102 | 129 | MobiDBLite | consensus disorder prediction | 84 | 129 | - | - | |
Bach12g01102 | 129 | PANTHER | 40S RIBOSOMAL PROTEIN S26 | 1 | 123 | IPR000892 | GO:0003735|GO:0005840|GO:0006412 | |
Bach12g01102 | 129 | ProSitePatterns | Ribosomal protein S26e signature. | 73 | 80 | IPR000892 | GO:0003735|GO:0005840|GO:0006412 | |
Bach12g01102 | 129 | Pfam | Ribosomal protein S26e | 1 | 106 | IPR000892 | GO:0003735|GO:0005840|GO:0006412 | |
Bach12g01102 | 129 | FunFam | 40S ribosomal protein S26 | 1 | 114 | - | - | |
Bach12g01102 | 129 | MobiDBLite | consensus disorder prediction | 90 | 110 | - | - | |
Bach12g01102 | 129 | MobiDBLite | consensus disorder prediction | 113 | 129 | - | - |
Select | Gene | Chromosome | Start | End | Duplicated_type |
---|---|---|---|---|---|
Bach12g01102 | Bach-Chr12 | 7696866 | 7704032 | Dispersed/Wgd |
Select | Gene | Gene_start | Gene_end | Function | Ath_gene | Identity(%) | E-value | Score |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Bach12g01102 | 1 | 116 | Cytoplasmic Ribosomal Protein Gene Family | AT2G40590 | 83.621 | 2.41e-69 | 202 |
Select | Query | KO | Definition | Second KO | KEGG Genes ID | GHOSTX Score |
---|---|---|---|---|---|---|
Bach12g01102 | K02976 | - | gmx:100499862 | 198.749 |